Smíšená inhibice
Smíšená inhibice je druh inhibice enzymů, kdy se inhibitor může na enzym navázat, ať už na něj je nebo není napojený substrát, ale substrát má k jednomu ze stavů větší afinitu než ke druhému.[1]
Jako „smíšená“ se tato inhibice označuje, protože spojuje prvky kompetitivní inhibice, kde se inhibitor může navázat pouze, když není navázaný substrát, a akompetitivní inhibice, kde se inhibitor může navázat jen když je na enzym navázán i substrát. Pokud se inhibitor na enzym navazuje se stejnou účinností, ať už substrát je, nebo není navázán, pak jde o nekompetitivní inhibici;[1][2] nekompetitivní inhibici lze tak považovat za zvláštní případ smíšené inhibice.
Při smíšené inhibici se inhibitor váže na alosterické místo, tedy mimo aktivní místo , kam se navazuje substrát; ne všechny inhibitory navazující se na alosterická místa jsou ale smíšené inhibitory. [1]
Smíšená inhibice může vyvolat:
- Pokles zdánlivé afinity enzymu vůči substrátu (zdánlivá hodnota Km se zvyšuje) - v případech, kdy se inhibitor přednostně váže na volný enzym; tento způsob je blíže akompetitivní inhibici.
- Nárůst zdánlivé afinity enzymu vůči substrátu (Km se zdánlivě snižuje) - jestliže se inhibitor přednostně váže na komplex enzym-substrát; tento způsob je blíže akompetitivní inhibici.
V obou případech klesá maximální rychlost reakce ().[3]
Z matematického hlediska nastává smíšená inhibice, pokud jsou oba parametry α a α’ v rovnici Michaelise-Mentenové (první odpovídá kompetitivní a druhý akompetitivní inhibici) jsou oba větší než 1.
Jestliže platí α = α’, pak nastává nekompetitivní inhibice, kde se snižuje a nemění. Takovéto inhibice jsou neobvyklé.[3]
V biologii
editovatPři glukoneogenezi přeměňuje cystolická fosfoenolpyruvátkarboxykináza za přítomnosti guanosintrifosfátu oxalacetát na fosfoenolpyruvát. Tato reakce se vyskytuje pouze v glukoneogenezi. Cystolická fosfoenolpyruvátkarboxykináza (cPEPCK) je regulována genisteinem, izoflavonem nacházejícím se v řadě rostlin.[4]
Bylo zjištěno, že přítomnost genisteinu snižuje hladinu cukru v krvi.[4] Mechanismus inhibice cPEPCK genisteinem byl dále zkoumán. Nejprve byla na cPEPCK navázána kyselinu 3-merkaptopropionovou, o níž již bylo známo, že enzym inhibuje. Výsledky byly srovnávány s fosfoenolpyruvátkarboxykinázou s genisteinem, po čemž bylo zjištěno, že se jedná o smíšenou inhibici.[4] cPEPCK při katalýze tvorby fosfoenolpyruvátu projde několika konfiguracemi; může být volná, vázaná na GDP, nebo vázaná na GTP. Geinstein se nejsnáze navazuje na cPEPCK s navázaným GTP, jeho komplex s enzymem s GDP je méně stálý.[4] Genistein se váže na stejné místo jako žádoucí substrát, oxalacetát, což u jiných konfigurací nelze.[4] Tímto bylo potvrzeno, že inhibice cPEPCK genisteinem spojuje kompetitivní a nekompetitivní inhibici.
Mezi serinové proteázy patří také kalikreiny, skupina 15 enzymů (označovaných KLK1 až KLK15) vyskytujících se v lidských tkáních. Štěpení bílkovin tímto enzymem vede k aktivaci receptorů na površích buněk, kalikreiny jsou tak důležitými součástmi řady signálních drah a jejich zesilování. Serinové proteázy z této skupiny se často využívají jako biologické značky onemocnění, a bývají tak častými cíli inhibic.[5]
Inhibice těchto kalikreinů by mohla být využita například k léčbě metastazujících nádorů nebo Alzheimerovy nemoci.[5] Rostlinný biflavonoid fukugetin ((+)-moreloflavon), byl v různých koncentracích přidáván ke KLK1, KLK2, KLK3, KLK4, KLK5, KLK6, a KLK7, což umožnilo zkoumání kinetiky enzymů odvozováním parametrů Km a Vmax. Prostřednictvím kinetiky Michaelise-Mentenové byl vytvořen Eadieův-Hofsteeův diagram, pomocí nějž se potvrdilo, že fukugetin je smíšeným inhibitorem, jelikož se jeho afinity k volnému enzymu a ke komplexu enzym-substrát liší. V průběhu analýzy u fukugetin klesala hodnota Vmax za současného nárůstu Km;[5] při kompetitivní inhibici se Vmax nemění a Km roste, a u nekompetitivní inhibice Vmax klesá a Km se nemění. Skutečnost, že se měnily oba tyto parametry, ukazovala na smíšenou inhibici.
Reference
editovatV tomto článku byl použit překlad textu z článku Mixed inhibition na anglické Wikipedii.
- ↑ a b c Types of Inhibition [online]. National Institues of Health Chemical Genomics Center, 2011 [cit. 2012-04-02]. Dostupné v archivu pořízeném z originálu dne 2011-09-08.
- ↑ Enzyme inhibition [online]. London South Bank University, 2012-04-02. Dostupné v archivu pořízeném z originálu dne 2012-03-19.
- ↑ a b Kenneth B. Storey. Functional Metabolism: Regulation and Adaptation. [s.l.]: Wiley-IEEE, 2004. ISBN 978-0-471-41090-4.
- ↑ a b c d e S. P. Katiyar; A. Jain; J. K. Dhanjal; D. Sundar. Mixed Inhibition of cPEPCK by Genistein, Using an Extended Binding Site Located Adjacent to Its Catalytic Cleft. PLOS ONE. 2015. DOI 10.1371/journal.pone.0141987. PMID 26528723. Bibcode 2015PLoSO..1041987K.
- ↑ a b c J. A. Santos, M. Y. Kondo, R. F. Freitas, M. H. dos Santos, T. C. Ramalho, D. M. Assis, L. Juliano, M. A. Juliano, L. Puzer. The natural flavone fukugetin as a mixed-type inhibitor for human tissue kallikreins. Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters. 2016, s. 1485–1489. Dostupné online. DOI 10.1016/j.bmcl.2016.01.039. PMID 26848109.