V roce 2018 se připojil k akademii [[Atlético Nacional|Atlética Nacional]].<ref name="TiagoAristiTiagoAristi2">{{cite web|last1=Aristi|first1=Tiago|title=Sobre promesas {{!}} Yerson Mosquera Valdelamar|url=https://elblogdetiagoaristi.com/2020/08/27/sobre-promesas-yerson-mosquera-valdelamar/|website=El Blog de Tiagoaristi|date=27 August 2020|access-date=27 July 2021}}</ref> V A-týmu debutoval v lednu 2020, a to na zápase [[Florida Cup]]u.<ref>{{cite web|url=https://int.soccerway.com/matches/2020/01/16/world/florida-cup/sociedade-esportiva-palmeiras/atletico-nacional/3180341/|title=PALMEIRAS VS. ATLÉTICO NACIONAL 0 - 0|website=Soccerway|date=16 January 2020|accessdate=17 June 2021}}</ref> Soutěžní debut si Mosquera odbyl dne 28. října 2020. Nastoupil do základní sestavy utkání [[Copa Sudamericana]] proti [[River Plate Montevideo|River Plate]]; v nastavení první půle byl však vyloučen.<ref>{{cite web|url=https://int.soccerway.com/matches/2020/10/28/south-america/copa-sudamericana/atletico-nacional/ca-river-plate/3415074/|title=ATLÉTICO NACIONAL VS. RIVER PLATE 1 - 1|website=Soccerway|date=28 October 2020|accessdate=17 June 2021}}</ref> První profesionální gól vstřelil při výhře 3:2 proti [[Alianza Petrolera FC|Alianze Petrolera]] dne 11. listopadu 2020.<ref>{{cite news|last1=Cuartas Gómez|first1=Juan Pablo|title=Análisis VAVEL, Atlético Nacional 2020: Yerson Mosquera|url=https://www.vavel.com/colombia/futbol-colombiano/2020/12/30/atletico-nacional/1053261-analisis-vavel-atletico-nacional-2020-yerson-mosquera.html|access-date=27 July 2021|work=VAVEL|date=5 January 2021}}</ref>
