Klasifikace virů: Porovnání verzí
Smazaný obsah Přidaný obsah
→Externí odkazy: +kat |
aktualizace dle nového vydání reference |
||
Řádek 9:
Aktuální snahou biologických klasifikačních systémů je přirozenost z hlediska fylogenetické příbuznosti. O tu se snaží podrobný, každoročně aktualizovaný '''[[Klasifikace virů#Systém ICTV|systém Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV)]]'''.
Vzhledem k tomu, že není známo příliš typů subvirových činitelů ([[viroid]]y a virové satelity včetně [[virofág]]ů a [[virusoid]]ů),
==Systém ICTV==
Řádek 16:
Standardními příponami jsou:
*pro řád: ''-virales''
*pro čeleď: ''-viridae'' (''-virodae'' v případě viroidů)
*pro podčeleď: ''-virinae''
*pro rod: ''-virus''
Podle názvoslovného kódu ICTV se názvy všech těchto taxonů píší stejně jako jména druhů kurzívou.<ref>The International Code of Virus Classification and Nomenclature. Kapitola IX, odstavec 3.36. ICTV, únor 2013. [http://www.ictvonline.org/codeOfVirusClassification.asp Dostupné online] (anglicky)</ref>
Aktuální klasifikace (ratifikovaná v
Klasifikace ICTV zahrnuje také viroidy (nezařazené čeledi ''Avsunviroidae'' a ''Pospiviroidae''), vybrané virofágy (nezařazená čeled ''Lavidaviridae'') či jiné satelity (např. nezařazená čeled ''Sarthoviridae'' a nezařazené rody ''Albetovirus'', ''Aumaivirus'', ''Papanivirus'', ''Virtovirus'') a retrotranspozony (nezařazené čeledi ''Metaviridae'' a ''Pseudoviridae'').
V následujícím přehledu jsou navíc pro úplnost uvedeny i dosud neuznané navrhované taxony, vždy označené závorkou "(neuznaný/á)". Návrh plyne z uvedené reference (zpravidla vědeckého periodika nebo webové složky ICTV s návrhy, u kterých dosud neskončil proces k jejich uznání.<ref>International Committee on Taxonomy of Viruses: [http://talk.ictvonline.org/files/proposals/default.aspx Pending Proposals]</ref>).
Řádek 29:
===Caudovirales===
*'''Řád: ''Caudovirales''''' (3 čeledi)
**Čeleď: ''Myoviridae'' (
**:*Nezařazený rod: ''
**:*Nezařazený rod: ''
**:*Nezařazený rod: ''
**:*Nezařazený rod: ''
**:*Nezařazený rod: ''
**:*Nezařazený rod: ''
**:*Nezařazený rod: ''
**:*Nezařazený rod: ''
**:*Nezařazený rod: ''
**:*Nezařazený rod: ''
**:*Nezařazený rod: ''
**:*Nezařazený rod: ''
**:*Nezařazený rod: ''Felixo1virus''
**:*Nezařazený rod: ''Hapunavirus''
**:*Nezařazený rod: ''Kpp10virus ''
**:*Nezařazený rod: ''Muvirus''
**:*Nezařazený rod: ''Myohalovirus''
**:*Nezařazený rod: ''Nit1virus''
**:*Nezařazený rod: ''P1virus''
**:*Nezařazený rod: ''Pakpunavirus''
**:*Nezařazený rod: ''Pbunavirus ''
**:*Nezařazený rod: ''Phikzvirus ''
**:*Nezařazený rod: ''Rheph4virus''
**:*Nezařazený rod: ''Secunda5virus''
**:*Nezařazený rod: ''Tg1virus''
**:*Nezařazený rod: ''Vhmlvirus''
**:*Nezařazený rod: ''Vi1virus''
**:*Nezařazený rod: ''Wphvirus''
***Podčeleď: ''Eucampyvirinae'' (2 rody)
****Rod: ''
****Rod: ''
***Podčeleď: ''Peduovirinae'' (2 rody)
****Rod: ''
****Rod: ''
***Podčeleď: ''Spounavirinae'' (
****Rod: ''
****Rod: ''
***
****Rod: ''
****Rod: ''
**
****Rod: ''Cc31virus''
****Rod: ''Js98virus''
****Rod: ''Rb49virus''
****Rod: ''Rb69virus''
****Rod: ''S16virus''
****Rod: ''Schizot4virus''
****Rod: ''Sp18virus''
****Rod: ''T4virus''
***Podčeleď: ''Vequintavirinae'' (3 rody)
****Rod: ''Cr3virus''
****Rod: ''Se1virus''
****Rod: ''V5virus''
**Čeleď: ''Podoviridae'' (2 podčeledi, 14 nezařazených rodů)
**:*Nezařazený rod: ''Bcep22likevirus''
**:*Nezařazený rod: ''
**:*Nezařazený rod: ''
**:*Nezařazený rod: ''
**:*Nezařazený rod: ''
**:*Nezařazený rod: ''
**:*Nezařazený rod: ''
**:*Nezařazený rod: ''
**:*Nezařazený rod: ''N4virus''
**:*
**:*
**:*
**:*Nezařazený rod: ''Phieco32virus''
**:*Nezařazený rod: ''Vp5virus''
***Podčeleď: ''Autographivirinae'' (4 rody)
****Rod: ''Kp34virus''
****Rod: ''Phikmvvirus''
****Rod: ''Sp6virus''
****Rod: ''T7virus''
***Podčeleď: ''Picovirinae'' (2 rody)
****Rod: ''
****Rod: ''
**Čeleď: ''Siphoviridae'' (
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*Nezařazený rod: ''Psimunavirus''
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*
**:*Nezařazený rod: ''Sfi11virus''
**:*Nezařazený rod: ''Sfi21dt1virus''
**:*Nezařazený rod: ''Sitaravirus''
**:*Nezařazený rod: ''Sk1virus''
**:*Nezařazený rod: ''Slashvirus''
**:*Nezařazený rod: ''Spbetavirus''
**:*Nezařazený rod: ''Ssp2virus''
**:*Nezařazený rod: ''T5virus''
**:*Nezařazený rod: ''Tm4virus''
**:*Nezařazený rod: ''Tp21virus''
**:*Nezařazený rod: ''Triavirus''
**:*Nezařazený rod: ''Wbetavirus''
**:*Nezařazený rod: ''Xp10virus''
**:*Nezařazený rod: ''Yuavirus''
**:*Nezařazený rod (neuznaný): ''Lebronvirus''<ref name="Adriaenssens_2015">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Adriaenssens
| jméno = Evelien M.
Řádek 169 ⟶ 189:
| jazyk = anglicky
}}</ref>
**:*
**:*
***Podčeleď: ''Guernseyvirinae'' (3 rody)
****Rod: ''Jerseyvirus''
****Rod: ''K1gvirus''
****Rod: ''Sp31virus''
***Podčeleď: ''Tunavirinae'' (5 rodů, 1 neuznaný rod)
****Rod: ''Kp36virus''
****Rod: ''Rogue1virus''
****Rod: ''Rtpvirus''
****Rod: ''T1virus''
****Rod: ''Tlsvirus''
****Rod (neuznaný): ''Jk06virus''<ref name="Niu 2014">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Niu
| jméno = Yan D.
| příjmení2 = McAllister
| jméno2 = Tim A.
| příjmení3 = Nash
| jméno3 = John H. E.
| spoluautoři = Kropinski, Andrew M.; Stanford, Kim.
| titul = Four ''Escherichia coli'' O157:H7 Phages: A New Bacteriophage Genus and Taxonomic Classification of T1-Like Phages
| periodikum = PLoS ONE
| rok vydání = 2014
| měsíc vydání = červen
| den vydání = 25
| ročník = 9
| typ ročníku = svazek
| číslo = 6: e100426
| strany = 1-11
| url = http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0100426
| dostupnost2 =
| url2 =
| issn = 1932-6203
| doi = 10.1371/journal.pone.0100426
| pmid = 24963920
| jazyk = anglicky
}}</ref>
===Herpesvirales===
*'''Řád: ''[[Herpetické viry|Herpesvirales]]''''' (3 čeledi)
**Čeleď: ''Alloherpesviridae'' (4 rody)
**:*Rod: ''Batrachovirus''
**:*Rod: ''Cyprinivirus''
**:*Rod: ''Ictalurivirus''
**:*Rod: ''Salmonivirus''
**Čeleď: ''Herpesviridae'' (3 podčeledi)
***Podčeleď: ''[[Alphaherpesvirinae]]'' (5 rodů)
Řádek 199 ⟶ 252:
****Rod: ''Rhadinovirus''
**Čeleď: ''Malacoherpesviridae'' (2 rody)
**:*Rod: ''Aurivirus''
**:*Rod: ''Ostreavirus''
===Ligamenvirales===
*'''Řád: ''Ligamenvirales''''' (2 čeledi)
**Čeleď: ''Lipothrixviridae'' (4 rody)
**:*Rod: ''Alphalipothrixvirus''
**:*Rod: ''Betalipothrixvirus''
**:*Rod: ''Deltalipothrixvirus''
**:*Rod: ''Gammalipothrixvirus''
**Čeleď: ''Rudiviridae'' (1 rod)
**:*Rod: ''Rudivirus''
===Mononegavirales===
*'''Řád: ''[[:Kategorie:Mononegavirales|Mononegavirales]]''''' (
*::*Nezařazený rod: ''Anphevirus''
*::*Nezařazený rod: ''Arlivirus''
*::*Nezařazený rod: ''Chengtivirus''
*::*Nezařazený rod: ''Crustavirus''
*::*Nezařazený rod: ''Wastrivirus''
**Čeleď: ''Bornaviridae'' (1 rod)
**:*Rod: ''Bornavirus''
**Čeleď: ''[[Filoviridae]]'' (3 rody)
**:*Rod: ''Cuevavirus''
**:*Rod: ''[[Ebola]]virus''
**:*Rod: ''[[Virus Marburg|Marburgvirus]]''
**Čeleď: ''
**:*Rod: ''
**Čeleď: ''
**:*Rod: ''Nyavirus''
**
**Čeleď: ''Paramyxoviridae'' (7 rodů)
**
**
**
**
**
**:*
**
**
**:*Rod: ''Metapneumovirus''
**:*Rod: ''
**Čeleď: ''[[Rhabdoviridae]]'' (13 rodů)
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''Tibrovirus''
**:*Rod: ''Tupavirus''
**:*Rod: ''Varicosavirus''
**:*Rod: ''Vesiculovirus''
**Čeleď: ''Sunviridae'' (1 rod)
**:*Rod: ''Sunshinevirus''
===Nidovirales===
*'''Řád: ''[[:Kategorie:Nidovirales|Nidovirales]]''''' (4 čeledi)
**Čeleď: ''Arteriviridae'' (1 rod)
**:*Rod: ''Arterivirus''
**Čeleď: ''[[Coronaviridae]]'' (2 podčeledi)
***Podčeleď: ''Coronavirinae'' (4 rody)
Řádek 262 ⟶ 325:
****Rod: ''Torovirus''
**Čeleď: ''Mesoniviridae'' (1 rod)
**:*Rod: ''Alphamesonivirus''
**Čeleď: ''Roniviridae'' (1 rod)
**:*Rod: ''Okavirus''
===Picornavirales===
*'''Řád: ''[[:Kategorie:Picornavirales|Picornavirales]]''''' (5 čeledí a 2 nezařazené rody)
*::*Nezařazený rod: ''Bacillarnavirus''
*::*Nezařazený rod: ''Labyrnavirus''
**Čeleď: ''Dicistroviridae'' (
**:*Rod: ''Aparavirus''
**:*Rod: ''Cripavirus''
**:*Rod: ''Triatovirus''
**Čeleď: ''Iflaviridae'' (1 rod)
**:*Rod: ''Iflavirus''
**Čeleď: ''Marnaviridae'' (1 rod)
**:*Rod: ''Marnavirus''
**Čeleď: ''[[Picornaviridae]]'' (
**:*Rod: ''[[Virus slintavky a kulhavky|Aphthovirus]]''
**:*Rod: ''Aquamavirus''
**:*Rod: ''Avihepatovirus''
**:*Rod: ''Avisivirus''
**:*Rod: ''Cardiovirus''
**:*Rod: ''Cosavirus''
**:*Rod: ''Dicipivirus''
**:*Rod: ''[[Enterovirus]]''
**:*Rod: ''Erbovirus''
**:*Rod: ''Gallivirus''
**:*Rod: ''Hepatovirus''
**:*Rod: ''Hunnivirus''
**:*Rod: ''Kobuvirus''
**:*Rod: ''Kunsagivirus''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''Teschovirus''
**:*Rod: ''[[Aviární encefalomyelitida|Tremovirus]]''
**Čeleď: ''Secoviridae'' (1 podčeleď a 5 nezařazených rodů)
**:*Nezařazený rod: ''Cheravirus''
Řádek 320 ⟶ 386:
===Tymovirales===
*'''Řád: ''Tymovirales''''' (4 čeledi)
**Čeleď: ''Alphaflexiviridae'' (
**:*Rod: ''Allexivirus''
**:*Rod: ''Botrexvirus''
**:*Rod: ''Lolavirus''
**:*Rod: ''Mandarivirus''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''
**:*Rod: ''Sclerodarnavirus''
**Čeleď: ''Betaflexiviridae'' (2 podčeledi)
***
****Rod: ''
****Rod: ''Foveavirus''
****Rod: ''
***
****Rod: ''
****Rod: ''Chordovirus''
****Rod: ''Citrivirus''
****Rod: ''Divavirus''
****Rod: ''Prunevirus''
****Rod: ''Tepovirus''
****Rod: ''Trichovirus''
****Rod: ''Vitivirus''
**Čeleď: ''Gammaflexiviridae'' (1 rod)
**:*Rod: ''Mycoflexivirus''
**Čeleď: ''Tymoviridae'' (3 rody)
**:*Rod: ''Maculavirus''
**:*Rod: ''Marafivirus''
**:*Rod: ''Tymovirus''
===„Megavirales“===
Řádek 364 ⟶ 437:
| jazyk = anglicky
}}</ref>
*::*Nezařazený rod: ''Dinodnavirus''
**Nezařazená čeleď: ''Ascoviridae'' (
**:*Rod: ''Ascovirus''
**:*Rod: ''Toursvirus''
**Nezařazená čeleď: ''Asfarviridae'' (1 rod)<ref name="Megavirales" group="pozn." />
**:*Rod: ''Asfivirus''
**Nezařazená čeleď: ''[[Iridoviry|Iridoviridae]]'' (5 rodů)<ref name="Megavirales" group="pozn." />
**:*Rod: ''Chloriridovirus''
**:*Rod: ''Iridovirus''
**:*Rod: ''Lymphocystivirus''
**:*Rod: ''Megalocytivirus''
**:*Rod: ''Ranavirus''
**Nezařazená čeleď: ''Marseilleviridae'' (1 rod, 2 neuznané rody)<ref name="Megavirales" group="pozn." />
**:*Rod: ''Marseillevirus''
**:*Rod (neuznaný): ''Lausannevirus''
**:*Rod (neuznaný): ''Tunisvirus''
**Nezařazená čeleď (neuznaná): ''Megaviridae'' (1 neuznaný rod; v případě ztotožnění s neuznanou čeledí ''Mimiviridae'' 2 rody a 3 neuznané rody){{#tag:ref|Vzhledem k příbuznosti je navrhováno vyčlenění čeledí ''Ascoviridae'', ''Asfarviridae'', ''Iridoviridae'', ''Marseilleviridae'', ''Megaviridae'', ''Mimiviridae'', ''Phycodnaviridae'' a ''Poxviridae'' do zvláštního řádu '''''Megavirales'''''.<ref name="Moumouvirus" /><ref name="Colson_2013" /><ref>ICTV: [http://talk.ictvonline.org/files/proposals/taxonomy_proposals_fungal1/m/fung02/4649.aspx Taxonomy Proposals]</ref> Pracovní skupina ICTV Poxviridae Study Group zatím neodsouhlasila zařazení poxvirů do navrhovaného řádu. Do řádu by pravděpodobně také náležely navrhované čeledi ''Pandoraviridae'' (vzhledem k blízkosti k čeledi ''Phycodnaviridae'')<ref name="Yutin_2013">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Yutin
Řádek 401 ⟶ 475:
| jazyk = anglicky
}}</ref> a ''Pithoviridae'' (vzhledem k blízkosti k čeledím ''Iridoviridae'' a ''Marseilleviridae'')<ref name="Claverie_2014" />, jakož i nezařazený rod ''Dinodnavirus'' (vzhledem k blízkosti k čeledi ''Asfarviridae'')<ref name="Dinodnavirus" />.|group="pozn."|name="Megavirales"}}
**:*Rod (neuznaný): ''Megavirus''<ref>{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Arslan
| jméno = Defne
Řádek 422 ⟶ 496:
}}</ref>
**Nezařazená čeleď: ''Mimiviridae'' (2 rody, 2 neuznané rody; v případě ztotožnění s neuznanou čeledí ''Megaviridae'' 2 rody a 3 neuznané rody)<ref name="Megavirales" group="pozn." />
**:*Rod: ''Cafeteriavirus''
**:*Rod: ''[[Mimivirus]]''
**:*Rod (neuznaný): ''Lentillevirus''<ref>{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Desnues
| jméno = Christelle
Řádek 450 ⟶ 524:
| jazyk = anglicky
}}</ref>
**:*Rod (neuznaný): ''Moumouvirus''<ref name="Moumouvirus">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Yoosuf
| jméno = Niyaz
Řádek 493 ⟶ 567:
| jazyk = anglicky
}}</ref><ref>MIHULKA, Stanislav: Mimiviry jsou out, teď vládnou pandoraviry! O.S.E.L., 20. červenec 2013. [http://www.osel.cz/index.php?clanek=7023 Dostupné online]</ref>
**:*Rod (neuznaný): ''[[Pandoravirus]]''
**Nezařazená čeleď: ''Phycodnaviridae'' (6 rodů)<ref name="Megavirales" group="pozn." />
**:*Rod: ''Chlorovirus''
**:*Rod: ''Coccolithovirus''
**:*Rod: ''Phaeovirus''
**:*Rod: ''Prasinovirus''
**:*Rod: ''Prymnesiovirus''
**:*Rod: ''Raphidovirus''
**Nezařazená čeleď (neuznaná): ''Pithoviridae''<ref name="Megavirales" group="pozn." /> (1 neuznaný rod)<ref name="Claverie_2014">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Legendre
Řádek 547 ⟶ 621:
| url = http://www.tyden.cz/rubriky/veda/veda-a-my/vedci-ozivili-30-tisic-let-stary-virus-z-ledu_300024.html
}}</ref>
**:*Rod (neuznaný): ''Pithovirus''
**Nezařazená čeleď: ''[[:Kategorie:Poxviry|Poxviridae]]'' (2 podčeledi)<ref name="Megavirales" group="pozn." />
***Podčeleď: ''Chordopoxvirinae'' (10 rodů)
Řádek 566 ⟶ 640:
===Nezařazené čeledi a rody===
:*Nezařazená čeleď: ''[[:Kategorie:Adenoviridae|Adenoviridae]]'' (5 rodů)
:*:*Rod: ''[[Adenovirová salpingitida drůbeže|Atadenovirus]]''
:*:*Rod: ''Aviadenovirus''
:*:*Rod: ''Ichtadenovirus''
:*:*Rod: ''Mastadenovirus''
:*:*Rod: ''Siadenovirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Alphatetraviridae'' (2 rody)
:*:*Rod: ''Betatetravirus''
:*:*Rod: ''Omegatetravirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Alvernaviridae'' (1 rod)
:*:*Rod: ''Dinornavirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Amalgaviridae'' (1 rod)
:*:*Rod: ''Amalgavirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Ampullaviridae'' (1 rod)
:*:*Rod: ''Ampullavirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Anelloviridae'' (
:*:*Rod: ''Alphatorquevirus''
:*:*Rod: ''Betatorquevirus''
:*:*Rod: ''Deltatorquevirus''
:*:*Rod: ''Epsilontorquevirus''
:*:*Rod: ''Etatorquevirus''
:*:*Rod: ''Gammatorquevirus''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''Zetatorquevirus''
:*Nezařazená čeleď: ''[[Arenaviridae]]'' (2 rody)
:*:*Rod: ''Mammarenavirus''
:*:*Rod: ''Reptarenavirus''
:*Nezařazená čeleď: ''
:*Nezařazená čeleď: ''Asfarviridae'' – viz neuznaný řád ''Megavirales'' výše
:*Nezařazená čeleď: ''Astroviridae'' (2 rody)
:*:*Rod: ''Avastrovirus''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''Avsunviroidae'' (3 rody)
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''Elaviroid
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''Baculoviridae'' (4 rody)
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''Deltabaculovirus''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''Birnaviridae'' (4 rody)
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''Blosnavirus''
:*:*Rod
:*Nezařazená čeleď: ''Bromoviridae'' (6 rodů)
:*:*Rod: ''Alfamovirus''
:*:*Rod: ''Anulavirus''
:*:*Rod: ''Bromovirus''
:*:*Rod: ''Cucumovirus''
:*:*Rod: ''Ilarvirus''
:*:*Rod: ''Oleavirus''
:*Nezařazená čeleď: ''[[:Kategorie:Bunyaviridae|Bunyaviridae]]'' (5 rodů, 2 neuznané rody)
:*:*Rod: ''[[Hantavirus]]''
:*:*Rod: ''Nairovirus''
:*:*Rod: ''[[Schmallenberský virus|Orthobunyavirus]]''
:*:*Rod: ''Phlebovirus''
:*:*Rod: ''Tospovirus''
:*:*Rod (neuznaný): ''Ferakvirus''<ref name="Marklewitz_2015">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Marklewitz
| jméno = Marco
| příjmení2 = Zirkel
| jméno2 = Florian
| příjmení3 = Kurth
| jméno3 = Andreas
| spoluautoři = DROSTEN, Christian; JUNGLEN, Sandra
| titul = Evolutionary and phenotypic analysis of live virus isolates suggests arthropod origin of a pathogenic RNA virus family
| periodikum = Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS)
| rok vydání = 2015
| měsíc vydání = červen
| den vydání = 2
| ročník = 112
| typ ročníku = svazek
| číslo = 24
| strany = 7536-7541
| url = http://www.pnas.org/content/112/24/7536.full
| dostupnost2 =
| url2 =
| issn = 1091-6490
| doi = 10.1073/pnas.1502036112
| pmid =
| jazyk = anglicky
}}</ref>
:*:*Rod (neuznaný): ''Jonchetvirus''<ref name="Marklewitz_2015" />
:*Nezařazená čeleď: ''[[:Kategorie:Caliciviridae|Caliciviridae]]'' (5 rodů)
:*:*Rod: ''Lagovirus''
:*:*Rod: ''Nebovirus''
:*:*Rod: ''[[Norovirus]]''
:*:*Rod: ''Sapovirus''
:*:*Rod: ''Vesivirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Carmotetraviridae'' (1 rod)
:*:*Rod: ''Alphacarmotetravirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Caulimoviridae'' (8 rodů)
:*:*Rod: ''Badnavirus''
:*:*Rod: ''Caulimovirus''
:*:*Rod: ''Cavemovirus''
:*:*Rod: ''Petuvirus''
:*:*Rod: ''Rosadnavirus''
:*:*Rod: ''Solendovirus''
:*:*Rod: ''Soymovirus''
:*:*Rod: ''Tungrovirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Chrysoviridae'' (1 rod)
:*:*Rod: ''Chrysovirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Circoviridae'' (2 rody)
:*:*Rod: ''Circovirus''
:*:*Rod: ''Cyclovirus''
<!--:*:*Rod (neuznaný): ''Tornovirus''<ref name="STTV">{{Citace elektronického periodika
| příjmení =
| jméno =
Řádek 684 ⟶ 783:
| pmid =
| jazyk = anglicky
}}</ref>
:*Nezařazená čeleď: ''Clavaviridae'' (1 rod)
:*:*Rod: ''Clavavirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Closteroviridae'' (4 rody)
:*:*Rod: ''Ampelovirus''
:*:*Rod: ''Closterovirus''
:*:*Rod: ''Crinivirus''
:*:*Rod: ''Velarivirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Corticoviridae'' (1 rod)
:*:*Rod: ''Corticovirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Cystoviridae'' (1 rod)
:*:*Rod: ''Cystovirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Endornaviridae'' (1 rod)
:*:*Rod: ''Endornavirus''
:*Nezařazená čeleď: ''[[Flaviviridae]]'' (4 rody)
:*:*Rod: ''Flavivirus''
:*:*Rod: ''Hepacivirus''
:*:*Rod: ''Pegivirus''
:*:*Rod: ''Pestivirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Fuselloviridae'' (2 rody)
:*:*Rod: ''Alphafusellovirus''
:*:*Rod: ''Betafusellovirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Geminiviridae'' (7 rodů, 1 neuznaný rod)
:*:*Rod: ''Becurtovirus''
:*:*Rod: ''Begomovirus''
:*:*Rod: ''Curtovirus''
:*:*Rod: ''Eragrovirus''
:*:*Rod: ''Mastrevirus''
:*:*Rod: ''Topocuvirus''
:*:*Rod: ''Turncurtovirus''
:*:*Rod (neuznaný): ''Graingemvirus''<ref>{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Poojari
| jméno = Sudarsana
Řádek 736 ⟶ 835:
| jazyk = anglicky
}}</ref>
:*Nezařazená čeleď: ''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''Guttaviridae'' (2 rody)
:*:*Rod: ''Alphaguttavirus''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''Hepadnaviridae'' (2 rody)
:*:*Rod: ''Avihepadnavirus''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''Hepeviridae'' (2 rody)
:*:*Rod: ''Orthohepevirus''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''Hytrosaviridae'' (2 rody)
:*:*Rod: ''Glossinavirus''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''Inoviridae'' (2 rody)
:*:*Rod: ''Inovirus''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''Iridoviridae'' – viz neuznaný řád ''Megavirales'' výše
:*Nezařazená čeleď: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''Leviviridae'' (2 rody)
:*:*Rod: ''Allolevivirus''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''
:*Nezařazená čeleď: ''Megabirnaviridae'' (1 rod)
:*:*Rod: ''Megabirnavirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Metaviridae'' (3 rody)
:*
:*
:*:*Rod: ''Semotivirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Microviridae'' (2 podčeledi)
:**Podčeleď: ''Bullavirinae'' (3 rody)
:***Rod: ''Alpha3microvirus''
:***Rod: ''
:***Rod: ''
:*
:***Rod: ''
:***Rod: ''Chlamydiamicrovirus''
:***Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''Mimiviridae'' – viz neuznaný řád ''Megavirales'' výše
:*Nezařazená čeleď: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''Narnavirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Nimaviridae'' (1 rod)
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''Nodaviridae'' (2 rody)
:*:*Rod: ''Alphanodavirus''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''Nudiviridae'' (2 rody)
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''Betaanudivirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Ophioviridae'' (1 rod)
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''[[Orthomyxoviridae]]'' (6 rodů, 1 neuznaný rod)
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod (neuznaný): ''Influenzavirus D''<ref>ICTV: [http://talk.ictvonline.org/files/proposals/taxonomy_proposals_vertebrate1/m/vert01/4954.aspx Taxonomy Proposals]</ref>
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''[[:Kategorie:Papilomavirus|Papillomaviridae]]'' (49 rodů)
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''Iotapapillomavirus''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''Omikronpapillomavirus''
:*:*Rod: ''Phipapillomavirus''
:*
:*
:*
:*
:*
:*:*Rod: ''Thetapapillomavirus''
:*
:*
:*
:*
:*
:*
:*
:*Nezařazená čeleď: ''Partitiviridae'' (5 rodů)
:*:*Rod: ''Alphapartitivirus''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''Cryspovirus''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''Gammapartitivirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Parvoviridae'' (2 podčeledi)
:**Podčeleď: ''Densovirinae'' (5 rodů)
:***Rod: ''Ambidensovirus''
:***Rod: ''Brevidensovirus''
:***Rod: ''Hepandensovirus''
:***Rod: ''Iteradensovirus''
:***Rod: ''Penstyldensovirus''
:**Podčeleď: ''Parvovirinae'' (8 rodů)
:***Rod: ''Amdoparvovirus''
:***Rod: ''Aveparvovirus''
:***Rod: ''Bocaparvovirus''
:***Rod: ''Copiparvovirus''
:***Rod: ''Dependoparvovirus''
:***Rod: ''Erythroparvovirus''
:***Rod: ''Protoparvovirus''
:***Rod: ''Tetraparvovirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Permutotetraviridae'' (1 rod)
:*:*Rod: ''Alphapermutotetravirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Phycodnaviridae'' – viz neuznaný řád ''Megavirales'' výše
:*Nezařazená čeleď: ''Picobirnaviridae'' (1 rod)
:*:*Rod: ''Picobirnavirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Plasmaviridae'' (1 rod)
:*:*Rod: ''Plasmavirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Pleolipoviridae'' (3 rody)
:*:*Rod: ''Alphapleolipovirus''
:*:*Rod: ''Betapleolipovirus''
:*:*Rod: ''Gammapleolipovirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Polydnaviridae'' (2 rody)
:*:*Rod: ''Bracovirus''
:*:*Rod: ''Ichnovirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Polyomaviridae'' (4 rody)
:*:*Rod: ''Alphapolyomavirus''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''Gammapolyomavirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Pospiviroidae'' (5 rodů)
:*:*Rod: ''Apscaviroid
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''Potyviridae'' (8 rodů)
:*:*Rod: ''Brambyvirus''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''Poxviridae'' – viz neuznaný řád ''Megavirales'' výše
:*Nezařazená čeleď: ''Pseudoviridae'' (3 rody)
:*:*Rod: ''Hemivirus''
:*:*Rod: ''Pseudovirus''
:*:*Rod: ''Sirevirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Quadriviridae'' (1 rod)
:*:*Rod: ''Quadrivirus''
:*Nezařazená čeleď: ''Reoviridae'' (2 podčeledi)
:**Podčeleď: ''Sedoreovirinae'' (6 rodů)
:***Rod: ''Cardoreovirus''
:***Rod: ''Mimoreovirus''
:***Rod: ''Orbivirus''
:***Rod: ''Phytoreovirus''
:***Rod: ''Rotavirus''
:***Rod: ''Seadornavirus''
:**Podčeleď: ''Spinareovirinae'' (9 rodů)
:***Rod: ''Aquareovirus''
:***Rod: ''Coltivirus''
:***Rod: ''Cypovirus''
:***Rod: ''Dinovernavirus''
:***Rod: ''Fijivirus''
:***Rod: ''Idnoreovirus''
:***Rod: ''Mycoreovirus''
:***Rod: ''Orthoreovirus''
:***Rod: ''Oryzavirus''
:*Nezařazená čeleď: ''[[Retroviry|Retroviridae]]'' (2 podčeledi)
:**Podčeleď: ''Orthoretrovirinae'' (6 rodů)
:***Rod: ''Alpharetrovirus''
:***Rod: ''Betaretrovirus''
:***Rod: ''Deltaretrovirus''
:***Rod: ''Epsilonretrovirus''
:***Rod: ''Gammaretrovirus''
:***Rod: ''Lentivirus''
:**Podčeleď: ''Spumaretrovirinae'' (1 rod)
:***Rod: ''Spumavirus''
:*Nezařazená čeleď: ''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''Sphaerolipoviridae'' (3 rody)
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''Betasphaerolipovirus''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''
:*:*Rod: ''
:*
:*:*Rod: ''[[Alphavirus]]''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''Tombusviridae'' (16 rodů)
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''Panicovirus''
:*:*Rod: ''Pelarspovirus''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''Totiviridae'' (5 rodů)
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''Leishmaniavirus''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''Trichomonasvirus''
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''Turriviridae'' (1 rod)
:*:*Rod: ''
:*Nezařazená čeleď: ''Virgaviridae'' (7 rodů)
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''
:*:*Rod: ''Hordeivirus''
:*:*Rod: ''Pecluvirus''
:*:*Rod: ''Pomovirus''
:*:*Rod: ''[[Virus tabákové mozaiky|Tobamovirus]]''
:*:*Rod: ''Tobravirus''
:::*Nezařazené rody:
==Baltimorova klasifikace==
Řádek 1 043 ⟶ 1 147:
*:**Čeleď: ''Asfarviridae''
*:**Čeleď: ''Iridoviridae''
*:**Čeleď
*:**Čeleď (neuznaná): ''Megaviridae''
*:**Čeleď: ''Mimiviridae''
Řádek 1 079 ⟶ 1 183:
*:*Nezařazená čeleď: ''Bidnaviridae''
*:*Nezařazená čeleď: ''Circoviridae''
*:*Nezařazená čeleď: ''Geminiviridae''
*:*Nezařazená čeleď: ''Genomoviridae''
*:*Nezařazená čeleď: ''Inoviridae''
*:*Nezařazená čeleď: ''Lavidaviridae''
*:*Nezařazená čeleď: ''Microviridae''
*:*Nezařazená čeleď: ''Nanoviridae''
*:*Nezařazená čeleď: ''Parvoviridae''
*:*Nezařazená čeleď
*:*Nezařazená čeleď: ''Spiraviridae''
*:*Nezařazený rod: ''Bacilladnavirus''
Řádek 1 090 ⟶ 1 196:
* ''' Skupina III.: [[dsRNA viry]]''', tedy viry s dvouvláknovou RNA
*:Patří sem:
*:*Nezařazená čeleď: ''
*:*Nezařazená čeleď: ''Birnaviridae''
*:*Nezařazená čeleď: ''Chrysoviridae''
*:*Nezařazená čeleď: ''Cystoviridae''
Řádek 1 103 ⟶ 1 208:
*:*Nezařazená čeleď: ''Reoviridae''
*:*Nezařazená čeleď: ''Totiviridae''
*:*Nezařazený rod: ''Botybirnavirus''
* ''' Skupina IV.: [[ssRNA viry s pozitivní polaritou]]''', tedy viry s jednovláknovou RNA přepisovanou do mRNA totožné polarity
Řádek 1 126 ⟶ 1 232:
*:*Nezařazená čeleď: ''Permutotetraviridae''
*:*Nezařazená čeleď: ''Potyviridae''
*:*Nezařazená čeleď: ''Sarthoviridae''
*:*Nezařazená čeleď: ''Togaviridae''
*:*Nezařazená čeleď: ''Tombusviridae''
*:*Nezařazená čeleď: ''Virgaviridae''
*:*Nezařazené rody: ''Albetovirus'', ''Aumaivirus'', ''Papanivirus'', ''Cilevirus'', ''Higrevirus'', ''Idaeovirus'', ''Ourmiavirus'', ''Polemovirus'', ''Sinaivirus'', ''Sobemovirus'', ''Virtovirus''
* ''' Skupina V.: [[ssRNA viry s negativní polaritou]]''', tedy viry s jednovláknovou RNA přepisovanou do mRNA opačné polarity
Řádek 1 138 ⟶ 1 245:
*:*Nezařazená čeleď: ''Ophioviridae''
*:*Nezařazená čeleď: ''Orthomyxoviridae''
*:*Nezařazené rody: ''Deltavirus'', ''Emaravirus'', ''Tenuivirus
* ''' Skupina VI.: [[ssRNA viry s reverzní transkriptázou]]''', tedy viry s jednovláknovou RNA reverzně přepisovanou do DNA
Řádek 1 149 ⟶ 1 256:
*:Patří sem:
*:*Nezařazená čeleď: ''Caulimoviridae''
*:*Nezařazená čeleď: ''Hepadnaviridae''
==Systém LHT==
|