RING finger

proteinová doména

RING finger (z angl. RING – Really Interesting New Gene) je proteinová doména podobná zinkovému prstu, obsahující motiv Cys3HisCys4 (ale aminokyseliny nejsou zařazeny bezprostředně za sebou). Tento motiv je schopen vázat dva kationty zinku (Zn2+).[1][2][3][4] Rozmístění důležitých cysteinů a histidinů je možné znázornit takto: CysX2CysX9–27CysXHisX2CysX2CysX6–17CysX2Cys.[5] Má tuto konzervovanou strukturu:[1]

Příklad RING finger domény, animováno
                              x x x     x x x
                             x      x x      x
                            x       x x       x
                           x        x x        x
                          C        C   C        C
                         x  \    / x   x \    /  x
                         x    Zn   x   x   Zn    x
                          C /    \ H   C /    \ C
                          x         x x         x
                 x x x x x x         x         x x x x x x

Jsou známy stovky proteinů obsahujících RING finger.[6] Mnohé z nich hrají roli v ubikvitinaci substrátových proteinů (tzv. RING ubiquitin ligázy), což často vede k degradaci těchto substrátů.[7][6][8] Role motivu RING finger zřejmě skutečně spočívá v přenášení ubikvitinu z E2 enzymů na cílový substrát.[6]

ReferenceEditovat

V tomto článku byl použit překlad textu z článku RING finger na anglické Wikipedii.

  1. a b Borden KL, Freemont PS. The RING finger domain: a recent example of a sequence-structure family. Curr. Opin. Struct. Biol.. 1996, s. 395–401. DOI 10.1016/S0959-440X(96)80060-1. PMID 8804826. (anglicky) 
  2. Hanson IM, Poustka A, Trowsdale J. New genes in the class II region of the human major histocompatibility complex. Genomics. 1991, s. 417–24. Dostupné online. DOI 10.1016/0888-7543(91)90327-B. PMID 1906426. (anglicky) 
  3. Freemont PS, Hanson IM, Trowsdale J. A novel cysteine-rich sequence motif. Cell. 1991, s. 483–4. DOI 10.1016/0092-8674(91)90229-R. PMID 1991318. (anglicky) 
  4. Lovering R, Hanson IM, Borden KL, Martin S, O'Reilly NJ, Evan GI, Rahman D, Pappin DJ, Trowsdale J, Freemont PS. Identification and preliminary characterization of a protein motif related to the zinc finger. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.. 1993, s. 2112–6. DOI 10.1073/pnas.90.6.2112. PMID 7681583. (anglicky) 
  5. Oxford dictionary of biochemistry and molecular biology; revised edition. Příprava vydání R. Cammack et al. New York: Oxford university press, 2006. ISBN 0-19-852917-1. 
  6. a b c Joazeiro CA, Weissman AM. RING finger proteins: mediators of ubiquitin ligase activity. Cell. 2000, s. 549–52. Dostupné online. DOI 10.1016/S0092-8674(00)00077-5. PMID 11007473. (anglicky) 
  7. Lorick KL, Jensen JP, Fang S, Ong AM, Hatakeyama S, Weissman AM. RING fingers mediate ubiquitin-conjugating enzyme (E2)-dependent ubiquitination. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.. 1999, s. 11364–9. DOI 10.1073/pnas.96.20.11364. PMID 10500182. (anglicky) 
  8. Freemont PS. RING for destruction?. Curr. Biol.. 2000, s. R84–7. Dostupné online. DOI 10.1016/S0960-9822(00)00287-6. PMID 10662664. (anglicky)