Parvarchaeota
Parvarchaeota je kmen patřící do domény Archea.
 Parvarchaeota | |
|---|---|
 | |
| Vědecká klasifikace | |
| Doména | Archea |
| Kmen | Parvarchaeota |
| Některá data mohou pocházet z datové položky. | |
Taxonomie
editovatDle taxonomie Národního centra pro biotechnologické informace (NCBI) je tento kmen součástí skupiny DPANN společně s kmeny Diapherotrites, Woesearchaeota, Pacearchaeota, Aenigmarchaeota, Nanohaloarchaeota a Nanoarchaeota. Zástupce kmene Parvarchaeota označujeme „Candidatus Parvarchaeales“. Status „candidatus“ je prozatímní označení přiřazované dobře charakterizovaným mikroorganismům, které ale nejsme schopni získat v čisté kultuře v laboratorních podmínkách.[1]
Charakteristika
editovatZástupci kmene Parvarchaeota mají relativně malý genom, jehož velikost je odhadována na 0,53–0,76 Mb.[2] Jejich metabolické schopnosti jsou omezené, postrádají například metabolické dráhy pro syntézu nukleotidů a aminokyselin. Bylo prokázáno, že studovaní zástupci žijí v blízkosti jedinců z řádu Thermoplasmatales, kteří mohou potenciálně poskytovat potřebné aminokyseliny.[3] Disponují metabolickými drahami, jako je glykolýza, citrátový cyklus, elektronový transportní řetězec a několik cest pro degradaci polysacharidů, které se obvykle nenacházejí u jiných zástupců skupiny DPANN.[4]
Výskyt
editovatParvarchaeota se vyskytují v extrémních podmínkách s nízkým pH a vysokým obsahem těžkých kovů,[2] např. v horkých pramenech nebo kyselé důlní drenáži.[4]
První zástupci kmene Parvarchaeota, společně se zástupci kmene Micrarchaeota, byli objeveni v acidofilních biofilmech v bývalém dole Richmond (Iron Mountain, Kalifornie, ve Spojených státech amerických). Kvůli tomuto nalezišti se Parvarchaeota řadí do skupiny mikroorganismů označovanou zkratkou ARMAN (Archaeal Richmond Mine Acidophilic Nanoorganisms).[2] Parvarchaeota obývají zřejmě užší škálu biotopů než Micrarchaeota, která se vyskytují kromě horkých pramenů a kyselého prostředí také na místech se zvýšenou radioaktivitou nebo v běžnějších podmínkách, jako jsou například běžné odpadní vody.[4]
Reference
editovat- ↑ TAXONOMY. Taxonomy browser (root). www.ncbi.nlm.nih.gov [online]. [cit. 2023-12-06]. Dostupné online.
- ↑ a b c LUO, Zhen-Hao; LI, Qi; LAI, Yan. Diversity and Genomic Characterization of a Novel Parvarchaeota Family in Acid Mine Drainage Sediments. Frontiers in Microbiology. 2020-12-21, roč. 11. Dostupné online [cit. 2023-12-06]. ISSN 1664-302X. DOI 10.3389/fmicb.2020.612257.
- ↑ SUN, Renpeng; ZHANG, Pan; RIGGINS, Chance W. Long-Term N Fertilization Decreased Diversity and Altered the Composition of Soil Bacterial and Archaeal Communities. Agronomy. 2019-09-23, roč. 9, čís. 10, s. 574. Dostupné online [cit. 2023-12-07]. ISSN 2073-4395. DOI 10.3390/agronomy9100574.
- ↑ a b c RAO, Yang-Zhi; LI, Yu-Xian; LI, Ze-Wei. Metagenomic Discovery of “ Candidatus Parvarchaeales”-Related Lineages Sheds Light on Adaptation and Diversification from Neutral-Thermal to Acidic-Mesothermal Environments. mSystems. 2023-04-27, roč. 8, čís. 2. Dostupné online [cit. 2023-12-07]. ISSN 2379-5077. DOI 10.1128/msystems.01252-22. PMID 36943058. (anglicky)