Wikipedista:Jakimek/Pískoviště

Phylogeny reconstruction of the genus Pseudogemmobacter
Phylogeny reconstruction of the genus Pseudogemmobacter[1]

Rod Pseudogemmobacter

editovat

Pseudogemmobacter je rod gramnegativních bakterií z čeledi Rhodobacteraceae[2][3].

Charakteristika rodu

editovat

Buňky zástupců tohoto rodu jsou gramnegativní, oválné až tyčinkovité, některé druhy jsou motilní[4]. Jde o aerobní chemoorganotrofy, fototrofie není přítomna. Hlavním respiratorním chinonem je ubichinon Q-10. Hlavní mastnou kyselinou je C18 : 1ω7c. Hlavními polárními lipidy jsou fosfatidylglycerol, fosfatidylmethylethanolamin, fosfatidylcholin a difosfatidylglycerol[5][4][3][2]. Zástupci rodu jsou positivní na oxidasu, katalasu a nitrátreduktasu, negativní na ureasu[2]. Obsah párů GC v genomové DNA je vyšší než 62% [5][4][3][2]. Rod se řadí do čeledi Rhodobacteraceae v rámci třídy Alphaproteobacteria.

Zástupci

editovat

Rod byl etablován v roce 2019 s typovým kmenem Pseudogemmobacter bohemicus Cd-10(T)[2]. V současné době byly efektivně publikovány popisy 4 druhů toho rodu, kromě výše zmíněného jde o Pseudogemmobacter faecipullorum[3], Pseudogemmobacter hezenzis[4] a Pseudogemobacter humicola[4] (dříve Xinfangfangia humi[5]).

Prostředí

editovat

Prostředí, ze kterého pochází jednotliví zástupci rodu, jsou značně diverzní. Typový druh rodu P. bohemicus byl izolován z kalu kontaminovaného těžkými kovy původem z odkaliště v okolí Příbrami (Česká republika) na základě jeho schopnosti tolerovat kademnatou sůl v kultivačním médiu[2]. Druh P. faecipullorum byl izolován z drůbežího hnoje[3]. P. hezenzis pochází ze vzorku kůry topolu Populus × euramericana[4]. Druh P. humicola byl původně izolován z půdy obohacené huminovými kyselinami[5].

 Wikipedista:Jakimek/Pískoviště
 
Vědecká klasifikace
TřídaAlphaproteobacteria
ČeleďRhodobacteraceae
RodPseudogemmobacter

Reference

editovat
  1. MA, Tengfei; XUE, Han; PIAO, Chungen. Reclassification of 11 Members of the Family Rhodobacteraceae at Genus and Species Levels and Proposal of Pseudogemmobacter hezensis sp. nov.. Frontiers in Microbiology. 2022-04-13, roč. 13, s. 849695. Dostupné online [cit. 2022-12-21]. ISSN 1664-302X. DOI 10.3389/fmicb.2022.849695. PMID 35495672. 
  2. a b c d e f SUMAN, Jachym; ZUBROVA, Andrea; ROJIKOVA, Katerina. Pseudogemmobacter bohemicus gen. nov., sp. nov., a novel taxon from the Rhodobacteraceae family isolated from heavy-metal-contaminated sludge. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2019-08-01, roč. 69, čís. 8, s. 2401–2407. Dostupné online [cit. 2022-12-14]. ISSN 1466-5026. DOI 10.1099/ijsem.0.003493. (anglicky) 
  3. a b c d e LIN, Shih-Yao; HAMEED, Asif; TSAI, Chia-Fang. Description of Pseudogemmobacter faecipullorum sp. nov., isolated from poultry manure. FEMS Microbiology Letters. 2022-11-29, roč. 369, čís. 1, s. fnac112. Dostupné online [cit. 2022-12-14]. ISSN 1574-6968. DOI 10.1093/femsle/fnac112. (anglicky) 
  4. a b c d e f MA, Tengfei; XUE, Han; PIAO, Chungen. Reclassification of 11 Members of the Family Rhodobacteraceae at Genus and Species Levels and Proposal of Pseudogemmobacter hezensis sp. nov.. Frontiers in Microbiology. 2022-04-13, roč. 13, s. 849695. Dostupné online [cit. 2022-12-21]. ISSN 1664-302X. DOI 10.3389/fmicb.2022.849695. PMID 35495672. 
  5. a b c d KÄMPFER, Peter; BUSSE, Hans-Jürgen; MCINROY, John A. Xinfangfangia humi sp. nov., isolated from soil amended with humic acid. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2019-07-01, roč. 69, čís. 7, s. 2070–2075. Dostupné online [cit. 2022-12-21]. ISSN 1466-5026. DOI 10.1099/ijsem.0.003434. (anglicky)