Nejúspěšnějším klubem je [[AC Sparta Praha]], která pohár od roku 1993 vyhrála celkem sedmkrát a z nějaké formy českého poháru má celkem 21 prvenství.
Nynější formát rozděluje soutěž na několik etap. Do jejího předkola či úvodního kola nastupují pouze týmy z nižších pater [[Systém fotbalových soutěží v Česku|systému ligových soutěží v Česku]]. Do druhého kola potom i 11 celků z aktuálně hraného ročníku [[1. česká fotbalová liga|Synot ligyFortuna:Ligy]], k nimž se ve 3. kole přidává čtveřice nejlepších celků uplynulého ročníku [[1. česká fotbalová liga|HET ligy]] a obhájce trofeje. Hraje se jednokolově na hřišti týmu z nižší soutěže. Ve 3. kole se mezi profesionální týmy z 1. a 2. ligy v případě vzájemného utkání losuje pořadatelství. Počínaje 4. kolem (osmifinále) neplatí ani toto pravidlo. Pokud tedy postoupí celek z 3. ligy nebo nižší soutěže do osmifinále, nemá zaručeno, že bude hrát utkání na domácí půdě. V sezonách [[Pohár ČMFS 2007/08|2007/08]] a [[Pohár ČMFS 2008/09|2008/09]] byla soutěž od čtvrtfinále do semifinále dvoukolová systémem doma–venku, v sezonách [[Ondrášovka Cup 2009/10|2009/10]] až [[MOL Cup 2015/16|2015/16]] to bylo již od osmifinále (4. kolo). V případě rovnosti výsledků v dvojzápase nenásledovalo [[prodloužení]], ale rovnou [[penaltový rozstřel]]. Od sezony [[MOL Cup 2016/17|2016/17]] se v takové situaci hraje prodloužení a až poté případně penalty.Od roku 2018/19 se hraje pouze 1 zápas tzv. odvety jsou zrušeny. Finále se hraje od roku 2019/20 na hřišti hůře postaveného finalisty v ligové tabulce.
