V době, kdy organizoval AlžbětyDudley návštěvu Alžběty u Tilbur, již pravděpodobně trpěl rakovinou žaludku a jeho dny byly sečteny. Po porážce armádyšpanělského loďstva odjel do Buxtonu, aby tam požíval léčivé vody, ale už nikdy k tomu nedošlo. Zemřel ve svém domě v hrabství [[Oxfordshire]] dne [[4. září]] [[1588]]. Alžběta byla zdrcená nad ztrátou svého přítele a společníka, prý se zamkla ve své komnatě na několik hodin, ne-li dnů. Na dopis, který jí poslal pouze několik dní před svou smrtí, napsala "Jeho poslední dopis" a uložila jej do pokladnice. Tam zůstal celých patnáct let a byl nalezen až po její smrti.
Jen málo lidí s královnou sdílelo její žal. Jeho nepřátelé tvrdili, že porážka španělskéšpanělského armádyloďstva nebyla ničím ve srovnání s tím, že zemřel Robert Dudley. Královna mu vystrojila velký pohřeb. Místem jeho posledního odpočinku je kaple svaté Marie v hrabství [[Warwick]].
