Kocian odehrál za [[Dukla Banská Bystrica|Duklu Banská Bystrica]] 209 zápasů v letech [[1979]] až [[1988]]. V roce 1988 přestoupil do německého klubu [[FC St. Pauli]], kde odehrál 147 zápasů. Se svojí aktivní sportovní kariérou skončil v roce [[1993]].
Za československou reprezentaci odehrál 26 zápasů s bilancí 15 výher, 4 remízy a 7 proher (na hřišti strávil celkem 2 145 minut, gól nevstřelil <ref>[http://www.fotbal.cz/c/nat/players/viewstat.asp?jmeno=jan&prijmeni=kocian Profil hráče na www.fotbal.cz]</ref>). Hrál i na [[Mistrovství světa ve fotbale 1990]]. Ján Kocián byl zvolen československým hráčem roku [[1990]].
== Trenérská kariéra ==
V sezóně 1997/1998 trénoval český klub [[FK Drnovice|Petra Drnovice]], později trénoval německé kluby [[FC Rot-Weiss Erfurt]] a [[Sportfreunde Siegen]]. Pracoval také jako asistent trenéra v klubech [[1. FC Köln]] a [[Eintracht Frankfurt]].
Trenérem slovenské reprezentace se stal [[2. listopad]]u [[2006]], když nahradil [[Dušan Galis|Dušana Galise]]. Kocian už předtím působil u reprezentace, neboť byl asistentem trenéra [[Jozef Vengloš|Jozefa Vengloše]] v letech [[1993]] až [[1995]]. V létě [[2008]] byl odvolán. Poté působil 7 měsíců jako asistent [[Karel Brückner|Karla Brücknera]] při [[Rakouská fotbalová reprezentace|rakouské fotbalové reprezentaci]].<ref>[http://futbal.pravda.sk/bruckner-s-kocianom-pokracuju-pri-rakuskej-reprezentacii-p3t-/sk_rfutbal.asp?c=A081107_204524_sk_rfutbal_p43 Pravda.sk: Brückner s Kocianom pokračujú pri rakúskej reprezentácii, 7. november 2008] {{sk}}</ref>
8. prosince [[2010]] byl oficiálně prohlášen za hlavního trenéra čínského týmu [[Jiangsu Sainty FC]]. O místo přišel v květnu 2011. V Jiangsu vedl 5 zápasů (1 remíza a 4 prohry).
28. června [[2011]] byl uveden do pozice trenéra týmu z hongkongské první ligy (Hong Kong First Division League) [[South China AA]] ředitelem klubu Stevenem Lo pro sezónu 2011/2012.
