Verze z 6. 8. 2021, 10:36 editovat JAnDbot (diskuse \| příspěvky) Roboti 1 716 378 editací m robot: přidáno {{Autoritní data}}; kosmetické úpravy ← Přejít na předchozí porovnání		Verze z 9. 4. 2022, 10:22 editovat zrušit editaci Naďa Čel (diskuse \| příspěvky) Prověření uživatelé 2 581 editací Doplnění textu, obrázků a referenci značka: editace z Vizuálního editoru Přejít na další porovnání →
Řádek 1: [[Soubor:Phosphodiester Bond Diagram.svg\|náhled\|200px\|Fosfodiesterová vazba propojující nukleotidy [[thymin]] (T) s [[adenin]]em (A), a následně s dalším adeninem skrze fosfátové skupiny(PO<sub>4</sub><sup>3−</sup>).]] '''Fosfodiesterová vazba''' je [[~~kovalentní~~Kovalentní vazba\|kovalentní]] propojení, ve kterém dvě [[Hydroxyl\|hydroxylové skupiny]] tvoří [[Estery\|esterové]] vazby nas ~~jednu~~jednou [[Fosforečnany\|fosfátovou]] ~~skupinu~~skupinou. ~~Fosfodiesterová~~Nejdůležitější ~~vazba~~úlohou jefosfodiesterových ~~známá především~~vazeb v ~~nukleových~~přírodě ~~kyselinách,~~je ~~ale~~tvorba ~~vyskytuje se například i v~~řetězců [[~~cyklický~~Nukleová ~~nukleotid~~kyselina\|~~cyklických~~nukleových ~~nukleotidech~~kyselin]] ~~nebo v [[glycerolfosfolipid]]ech.<br />'''Cukr-fosfátová kostra''' v~~ ([[DNA]] a, [[RNA]]), ~~vzniká~~jejichž ~~propojením~~primární 5'struktura ~~uhlíku~~je nadána ~~jednom~~lineární ~~cukerném~~sekvencí ~~zbytku~~nukleotidů skovalentně 3'vázaných ~~uhlíkem~~fosfodiesterovými ~~následujícího cukerného zbytku fosfodiesterovou vazbou~~vazbami. ~~Takto~~Tyto ~~vazba tedy určuje~~vazby určují[[~~direkcionalita~~Direkcionalita\|direkcionalitu]] ~~[[nukleová kyselina\|~~nukleové kyseliny]] a způsobuje na jejím povrchu velmi silný záporný náboj. Fosfodiesterová vazba v nukleových kyselinách je tvořena vazbou fosfátové skupiny s nukleosidy. Fosfátová skupina se váže na 5. uhlíku pentosy prvního nukleosidu a hydroxylovou skupinu na 3. uhlíku pentosy druhého nukleosidu. Nukleosid a fosfátová skupina dohromady vytvářejí [[Nukleotid\|nukleotid.]] Nukleotidy se pomocí fosfodiesterové vazby spojují do dlouhých vláken podobných řetězcům, které vytvářejí nukleové kyseliny. Vznik fosfodiesterových vazeb zajišťují [[DNA polymeráza\|DNA]] a [[RNA polymeráza\|RNA polymerázy]], ale také další enzymy, například [[ligáza\|ligázy]] nebo [[nukleotidyltransferáza\|nukleotidyltransferázy]], případně [[cykláza\|cyklázy]] vytvářející z nukleotidů [[cyklický nukleotid\|cyklické nukleotidy]].▼ Fosfodiesterová vazba je známá především v nukleových kyselinách, ale vyskytuje se například i v [[Cyklický nukleotid\|cyklických nukleotidech]] nebo v [[Glycerolfosfolipid\|glycerolfosfolipidech]]. Rozpad fosfodiesterových vazeb v nukleových kyselinách zajišťují [[DNáza\|DNázy]] a [[RNázy]], [[fosfodiesteráza\|fosfodiesterázy]] (ukončují signalizaci [[cyklický nukleotid\|cyklických nukleotidů]] působících jako [[druhý posel\|druzí poslové]]), fosfolipázy [[Fosfolipáza C\|C]] a [[Fosfolipáza D\|D]] (vytváří [[druhý posel\|druhé posly]] štěpením [[fosfatidylinositol-4,5-bisfosfát]]u).▼ == Stavba nukleové kyseliny == V případě nukleových kyselin je fosfát ve fosfodiesterové vazbě zodpovědný za záporný náboj nesený molekulou, který je přímo úměrný jejich délce, což umožňuje jejich jednoduchou analýzu pomocí [[Gelová elektroforéza\|gelové elektroforézy]]. V buňkách tento záporný náboj ovšem musí být odstíněn, k čemuž slouží především bazické proteiny [[histon]]y a bivalentní ionty kovů, především [[hořčík]]u.▼ [[Soubor:Dna_strand3_cs.png\|náhled\|403x403pixelů\|Chemická struktura nukleotidového vlákna (DNA) sestávajícího ze čtyř nukleotidů a s vyznačením hlavy (5 'konce) a ocasu (3 'konce)]] Nukleotidová vlákna, která tvoří nukleové kyseliny, mají dva konce, známé jako 5 'konec a konec 3'. Podle konvencí 5 'konec představuje hlavu vlákna tvořícího nukleovou kyselinu, zatímco 3 'konec představuje jeho ocas. Z chemického hlediska se 5 'konec shoduje s fosfátovou skupinou prvního nukleotidu řetězce, zatímco 3' konec se shoduje s hydroxylovou skupinou (OH) umístěnou na uhlíku 3 posledního nukleotidu. ~~{{Pahýl}}~~ ~~{{Autoritní data}}~~ V genetice a biologii jsou na základě této organizace nukleotidová vlákna popsána: P-5 '→ 3'-OH. Písmeno P označuje atom fosforu fosfátové skupiny a skupina -OH pochází z pentózy (ribóza nebo deoxyribóza). == Vznik vazby == Vznik fosfodiesterové vazby v nukleových kyselinách (podobně jako vznik [[Peptidová vazba\|peptidové vazby]] v [[Bílkovina\|proteinech]] a [[Glykosidová vazba\|glykosidických vazeb]] mezi [[monosacharidy]]) je důsledkem [[Dehydratační reakce\|dehydratačních]] reakcí, při kterých dochází ke ztrátě molekuly [[Voda\|vody]]. Obecný vzorec dehydratační reakce je: H-X1-OH + H-X2-OH → H-X1-X2-OH + H<sub>2</sub>O ▲Vznik fosfodiesterových vazeb zajišťují [[DNA polymeráza\|DNA]] a [[RNA polymeráza\|RNA polymerázy]], ale také další enzymy, například [[~~ligáza~~Ligáza\|ligázy]] nebo [[~~nukleotidyltransferáza~~Nukleotidyltransferáza\|nukleotidyltransferázy]], případně [[~~cykláza~~Cykláza\|cyklázy]] vytvářející z nukleotidů [[~~cyklický~~Cyklický nukleotid\|cyklické nukleotidy]]. == Rozpad vazby == ▲Rozpad ~~fosfodiesterových~~fosfodiesterové ~~vazeb~~vazby v nukleových kyselinách ~~zajišťují~~je důsledkem [[Hydrolýza\|hydrolýzy]]. Zajišťují ji [[DNáza\|DNázy]] a [[RNázy]], [[~~fosfodiesteráza~~Fosfodiesteráza\|fosfodiesterázy]] (ukončují signalizaci [[~~cyklický~~Cyklický nukleotid\|cyklických nukleotidů]] působících jako [[~~druhý~~Druhý posel\|druzí poslové]]), fosfolipázy [[Fosfolipáza C\|C]] a [[Fosfolipáza D\|D]] (~~vytváří~~vytvářejí ~~[[druhý posel\|~~druhé posly]] štěpením [[~~fosfatidylinositol~~Fosfatidylinositol-4,5-bisfosfát\|fosfatidylinositol-4,5-bisfosfátu]]u). Například enzym 3'-fosfodiesteráza hraje důležitou roli při opravě oxidačního poškození DNA. ▲VVe ~~případě~~vodném ~~nukleových~~roztoku ~~kyselin~~jsou jefosfodiesterové ~~fosfát~~vazby v molekulách DNA mnohem stabilnější než v molekulách RNA. Fosfodiesterová vazba je ve ~~fosfodiesterové~~vodném ~~vazbě~~roztoku ~~zodpovědný~~zcela zaionizována a to dává molekulám nukleové kyseliny záporný náboj. ~~nesený~~Tento ~~molekulou,~~záporný ~~který~~náboj je přímo úměrný ~~jejich~~ délce řetězce nukleové kyseliny, což umožňuje ~~jejich~~jeho jednoduchou analýzu pomocí [[Gelová elektroforéza\|gelové elektroforézy]]. V buňkách musí být tento záporný náboj ~~ovšem~~odstíněn ~~musí být odstíněn,~~a k ~~čemuž~~tomu slouží především bazické proteiny [[~~histon~~Histon\|histony,]]~~y a~~ bivalentní [[Ion\|ionty]] [[Kovy\|kovů,]] (především [[Hořčík\|hořčík)]] a [[polyaminy]]u. == Funkce vazby == * Nejvýznamnější funkcí diesterových vazeb je jejich účast na tvorbě kostry molekul nukleových kyselin, které jsou nejdůležitějšími molekulami v [[Buňka\|buňkách]] všech [[Organismus\|organismů]]. * Na interakci fosfodiesterových vazeb na 5 'konci DNA s postranním řetězcem zbytků [[Tyrosin\|tyrosinu]] v aktivním místě těchto DNA závisí aktivita [[Enzym\|enzymu]] [[Topoizomeráza\|topoizomerázy]], který se aktivně podílí na [[Replikace DNA\|replikaci DNA]] a syntéze [[Bílkovina\|proteinů]]. * Fosfodiesterové vazby mají [[Druhý posel\|druzí poslové]] (cyklický [[Adenosin\|adenosinový]] monofosfát [[Cyklický adenosinmonofosfát\|cAMP]] nebo cyklický [[guanosin]] trifosfát [[Cyklický guanosinmonofosfát\|cGTP]]), které jsou hydrolyzovány specifickými enzymy fosfodiesterázami a které mají velký význam pro mnoho signálních procesů. * Glycerofosfolipidy (základní složky [[Biologická membrána\|biologických membrán]]) se skládají z molekuly [[Glycerol\|glycerolu]], která je vázána fosfodiesterovými vazbami na polární skupiny, které tvoří hydrofilní oblast [[Molekula\|molekuly]]. == Reference == {{Překlad\|jazyk=de\|článek=Phosphodiesterbindung\|revize=184977049\|jazyk2=en\|článek2=Phosphodiester bond\|revize2=1044890374}}{{Autoritní data}} [[Kategorie:Estery]]

Fosfodiesterová vazba: Porovnání verzí