National Center for Biotechnology Information: Porovnání verzí

[[GenBank]] je databáze genetických sekvencí obsahující anotovanou sbírku DNA sekvencí.[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/] GenBank je spolu s DNA Data Bank of Japan a European Nuclotide Archive součástí tzv. International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC), které aktivně spolupracují na archivaci nukleotidových sekvencí. Mezi těmito institucemi také dochází k vzájemné výměně uložených dat na denní báze. Nové vydání GenBank vychází průběžně v dvouměsíčních intervalech zveřejněním na stránce ftp. Jednotlivé záznamy v GenBank jsou katalogizované pod unikátním šestimístným číslem a obsahují údaje jako zdrojový organismus, struční popis k dané sekvenci, délka a typ sekvence, pořadí nukleotidů ve formátu FASTA a také bibliografický záznam.<ref>{{Citace periodika

Databáze RefSeq shromažďuje sekvence genomových DNA, jejich transkriptů a proteinů za účelem tvorby rozsáhlé neredundantní sbírky integrující sekvenční, genetické a funkční informace v jednom záznamu. <ref>[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21091/ The Reference Sequence (RefSeq) Database] - The NCBI Handbook</ref> Záznamy v RefSeq vycházejí z archivu INSDC, jejíž součástí je i GenBank, převzatá data jsou automaticky anotovaná a postupně validovaná správci databáze. Data do RefSeq jsou v menší míře získávané také v rámci spolupráce s projekty jako Saccharomyces Genome Database nebo The Arabidopsis Information Resource. Unikátní identifikační číslo jednotlivých záznamů je dynamické a liší se v závislosti na typu sekvence a množství validovaných údajů o dané sekvenci.

V databázi Genome se nachází sekvenční a mapovací data již osekvenovaných nebo průběžně sekvenovaných genomů. Obsahuje informace o genomech z přes 1000 různých druhů nebo kmenů, ze všech domén organismů. Genome zahrnuje sekvence nukleotidů genomů, mapy genetických markerů, variace (např. [[Jednonukleotidový polymorfismus|jednonukleotidové polymorfismy]]) a údaje z epigenomických studií. Vzhledem na přirozenou velikost a komplexnost genomových dat jsou záznamy členěné na jednotlivé chromozomy s unikátními RefSeq identifikátory. K prohlížení záznamů eukaryotických genomů uložených v Genome je možné použít rozhraní online prohlížeče Genome Data Viewer, lokalizovanéhoumístěného na webové stránce NCBI. <ref>[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/help/ Genome Data Viewer] - NCBI</ref>