}}</ref> Podle Babiše mladšího byl do Ruska a na Ukrajinu odvezen poté, co mu jeho tehdejší lékařka Dita Protopopová dala na výběr, zda chce být zavřen v [[Národní ústav duševního zdraví|Národním ústavu národníhoduševního zdraví]], kde Protopopová pracuje jako vedoucí lékařka oddělení psychotických poruch, nebo odjet na „prázdniny“. Na Krym, už [[Anexe Krymu Ruskou federací|okupovaný]] Ruskem, ho poté odvezl Petr Protopopov, manžel Dr. Protopopové, který je ruského původu a pracuje v [[Agrofert]]u jako řidič.<ref name=idnes0955>[https://zpravy.idnes.cz/dita-protopopova-andrej-babis-mladsi-capi-hnizdo-unos-krym-zastupitelka-lekarka-dusevni-zdravi-ustav-i7d-/domaci.aspx?c=A181113_160955_domaci_pmk Nová postava v případu Čapí hnízdo. Lékařku stála kauza místo na radnici]</ref> Protopopova rodina žije v Česku už od 90. let.<ref name=irozhlas2010/> Dr Protopopová je psychyatriačka a autorka zprávy o zdravotní nezpůsobilosti Babiše mladšího, díky které neměl být stíhán policií v kauze Čapí hnízdo.<ref name=idnes0955/> V regionálních volbách v roce 2018 kandidovala za hnutí [[ANO 2011|ANO]] v Praze 8 a stala se členkou zastupitelstva. Po zveřejnění souvislostí Seznamem TV se členství v zastupitelstvu vzdala.<ref>[https://domaci.ihned.cz/c1-66339270-psychiatricka-protopopova-rezignovala-na-mandat-zastupitelky-prahy-8-dlouho-ji-nikdo-nevidel-ani-v-narodnim-ustavu-dusevniho-zdravi Psychiatrička Protopopová rezignovala na mandát zastupitelky Prahy 8. Dlouho ji nikdo neviděl ani v Národním ústavu duševního zdraví]</ref> Petr Protopopov je bývalý cyklistický závodník, který vlastnil také obchod s cyklistickými potřebami a v současnosti kromě práce pro Agrofert působí také jako fotograf. Právě jeho angažmá v případu a hlídání Babiše mladšího byl podle jeho obchodního partnera hlavní důvod, proč cykloobchod prodal.<ref name=irozhlas2010>[https://www.irozhlas.cz/zpravy-domov/petr-protopopov-dita-protopopova-kauza-capi-hnizdo-agrofert-andrej-babis-mladsi_1811132010_tec Udělali si normálně výlet na ryby, říká k cestě na Krym exspolupracovník Protopopova]</ref>
Andrej Babiš starší zveřejnění dokumentu „Zvláštní vyšetřování“ televize Seznam označil za pokus destabilizovat vládu a kampaň vedenou proti němu. Svého syna, který v současnosti žije společně se svou matkou ve [[Švýcarsko|Švýcarsku]], označil za duševně nemocného. Podle Babiše trpí Andrej mladší na [[Schizofrenie|schizofrenii]] a mediální kampaň kolem syna je "odporný útok na mou rodinu s cílem destabilizovat Česko".<ref>{{Citace elektronického periodika
| titul = Babiš: Jde o odporný útok na moje děti. Cílem je destabilizovat Česko
