Wikipedie

Klasifikace virů: Porovnání verzí

Interaktivně procházet historii
← Přejít na předchozí porovnáníPřejít na další porovnání →
Smazaný obsah Přidaný obsah
VizuálníWikitext
komplexní aktualizace + ref
aktuální doplnění + ref, drobné úpravy
Řádek 37:
 
=== Bunyavirales ===
* '''Řád: ''[[Bunyavirales]]''''' (9 čeledí, 1 neuznaná čeleď){{#tag:ref|Jako samostatný řád byl navržen v r. 2016 a schválen v r. 2017; byla do něj zahrnuta bývalá čeleď ''Bunyaviridae'' a do té doby nezařazené rody ''Emaravirus'' a ''Tenuivirus''.<ref name="Bunyaviridae Study Group_2016"/>|group="pozn."|name="Bunyavirales"}}
** Čeleď: ''[[Feraviridae]]'' (1 rod)
**:* Rod: ''[[Orthoferavirus]]''
Řádek 46:
** Čeleď: ''[[Jonviridae]]'' (1 rod)
**:* Rod: ''[[Orthojonvirus]]''
** Čeleď (neuznaná): ''[[Leishbunyaviridae]]'' (1 neuznaný rod)<ref name="Grybchuk_2018"/>
:**:* Rod (neuznaný): ''[[GraingemvirusLeishbunyavirus]]''<ref name="Poojari_2013Grybchuk_2018"/>▼
** Čeleď: ''[[Nairoviridae]]'' (1 rod)
**:* Rod: ''[[Orthonairovirus]]''
Řádek 228 ⟶ 230:
**:* Nezařazený rod: ''[[Lambdavirus]]''
**:* Nezařazený rod: ''[[Laroyevirus]]''
**:* Nezařazený rod (neuznaný): ''[[Lebronvirus]]''<ref name="Adriaenssens_2015"/>▼
**:* Nezařazený rod: ''[[Liefievirus]]''
**:* Nezařazený rod: ''[[Marvinvirus]]''
Řádek 287 ⟶ 290:
**:* Nezařazený rod: ''[[Ydn12virus]]''
**:* Nezařazený rod: ''[[Yuavirus]]''
▲**:* Nezařazený rod (neuznaný): ''[[Lebronvirus]]''<ref name="Adriaenssens_2015"/>
*** Podčeleď: ''[[Arquatrovirinae]]'' (3 rody)
**** Rod: ''[[Camvirus]]''
Řádek 585 ⟶ 587:
*::* Nezařazený rod (neuznaný): ''[[Faustovirus]]''<ref name="Reteno_2015"/><ref name="Benamar_2016"/>
*::* Nezařazený rod (neuznaný): ''[[Mollivirus]]''<ref name="Legendre_2015"/>
** Nezařazená čeleďČeleď: ''[[Ascoviridae]]'' (2 rody)<ref name="Megavirales" group="pozn." />
**:* Rod: ''[[Ascovirus]]''
**:* Rod: ''[[Toursvirus]]''
** Nezařazená čeleďČeleď: ''[[Asfarviridae]]'' (1 rod)<ref name="Megavirales" group="pozn." />
**:* Rod: ''[[Asfivirus]]''
** Nezařazená čeleďČeleď: ''[[Iridoviry|Iridoviridae]]'' (2 podčeledi)<ref name="Megavirales" group="pozn." />
*** Podčeleď: ''[[Alphairidovirinae]]'' (3 rody)
**** Rod: ''[[Lymphocystivirus]]''
Řádek 598 ⟶ 600:
**** Rod: ''[[Chloriridovirus]]''
**** Rod: ''[[Iridovirus]]''
** Nezařazená čeleďČeleď: ''[[Marseilleviridae]]'' (1 rod, 2 neuznané rody)<ref name="Megavirales" group="pozn." />
**:* Rod: ''[[Marseillevirus]]''▼
**:* Rod (neuznaný): ''[[Lausannevirus]]''
▲**:* Rod: ''[[Marseillevirus]]''
**:* Rod (neuznaný): ''[[Tunisvirus]]''
** Nezařazená čeleďČeleď: ''[[Mimiviridae]]'' (1 neuznaná podčeleď, 2 nezařazené rody, 4 neuznané nezařazené rody){{#tag:ref|Vzhledem k příbuznosti je navrhováno vyčlenění čeledí ''Ascoviridae'', ''Asfarviridae'', ''Iridoviridae'', ''Marseilleviridae'', ''Mimiviridae'', ''Phycodnaviridae'' a ''Poxviridae'' do zvláštního řádu '''''Megavirales'''''.<ref name="Moumouvirus"/><ref name="Colson_2013"/> Do řádu by pravděpodobně také náležely navrhované čeledi ''Pandoraviridae'' (vzhledem k blízkosti k čeledi ''Phycodnaviridae'')<ref name="Yutin_2013"/> a ''Pithoviridae'' (vzhledem k blízkosti k čeledím ''Iridoviridae'' a ''Marseilleviridae'')<ref name="Claverie_2014"/>, jakož i nezařazený rod ''Dinodnavirus'' (vzhledem k blízkosti k čeledi ''Asfarviridae'')<ref name="Dinodnavirus"/> a neuznané rody ''Faustovirus'' (také blízký k ''Asfarviridae'') a ''Mollivirus'' (blízký k navrhované čeledi ''Pandoraviridae'').<ref name="Fischer_2016"/><ref name="Halary_2016"/>|group="pozn."|name="Megavirales"}}
**:* Nezařazený rod: ''[[Cafeteriavirus]]''
**:* Nezařazený rod: ''[[Mimivirus]]''▼
**:* Nezařazený rod (neuznaný): ''[[Megavirus]]''<ref name="Arslan_2011"/>▼
**:* Nezařazený rod (neuznaný): ''[[Lentillevirus]]''<ref name="Desnues_2012"/>
▲**:* Nezařazený rod (neuznaný): ''[[Megavirus]]''<ref name="Arslan_2011"/>
▲**:* Nezařazený rod: ''[[Mimivirus]]''
**:* Nezařazený rod (neuznaný): ''[[Moumouvirus]]''<ref name="Moumouvirus"/>
**:* Nezařazený rod (neuznaný): ''[[Tupanvirus]]''<ref name="Tupanvirus"/>
Řádek 614 ⟶ 616:
**** Rod (neuznaný): ''[[Indivirus]]''
**** Rod (neuznaný): ''[[Klosneuvirus]]''
** Nezařazená čeleďČeleď (neuznaná): ''[[Pandoraviridae]]'' (1 neuznaný rod)<ref name="Philippe_2013"/><ref name="Mihulka_2013"/><ref name="Megavirales" group="pozn." />
**:* Rod (neuznaný): ''[[Pandoravirus]]''
** Nezařazená čeleďČeleď: ''[[Phycodnaviridae]]'' (6 rodů)<ref name="Megavirales" group="pozn." />
**:* Rod: ''[[Chlorovirus]]''
**:* Rod: ''[[Coccolithovirus]]''
Řádek 623 ⟶ 625:
**:* Rod: ''[[Prymnesiovirus]]''
**:* Rod: ''[[Raphidovirus]]''
** Nezařazená čeleďČeleď (neuznaná): ''[[Pithoviridae]]'' (1 neuznaný rod)<ref name="Claverie_2014"/><ref name="Yong_2014"/><ref name="Týden"/><ref name="Megavirales" group="pozn." />
**:* Rod (neuznaný): ''[[Pithovirus]]''
** Nezařazená čeleďČeleď: ''[[Poxviry|Poxviridae]]'' (2 podčeledi)<ref name="Megavirales" group="pozn." />
*** Podčeleď: ''[[Chordopoxvirinae]]'' (11 rodů)
**** Rod: ''[[Avipoxvirus]]''
Řádek 696 ⟶ 698:
:*:* Rod: ''[[Avastrovirus]]''
:*:* Rod: ''[[Mamastrovirus]]''
:* Nezařazená čeleď (neuznaná): ''[[Autolykiviridae]]'' (1 neuznaný rod)<ref name="Kauffman_2018"/><ref name=" Ignacio-Espinoza_2018"/><ref name="Mihulka_2018"/>
:*:* Rod (neuznaný): ''[[Autolykivirus]]''<ref name="Kauffman_2018"/>
:* Nezařazená čeleď: ''[[Avsunviroidae]]'' (3 rody)
:*:* Rod: ''[[Avsunviroid]]''
Řádek 772 ⟶ 775:
:*:* Rod: ''[[Eragrovirus]]''
:*:* Rod: ''[[Grablovirus]]''
:*:* Rod (neuznaný): ''[[Graingemvirus]]''<ref name="Poojari_2013"/>
:*:* Rod: ''[[Mastrevirus]]''
:*:* Rod: ''[[Topocuvirus]]''
:*:* Rod: ''[[Turncurtovirus]]''
▲:*:* Rod (neuznaný): ''[[Graingemvirus]]''<ref name="Poojari_2013"/>
:* Nezařazená čeleď: ''[[Genomoviridae]]'' (9 rodů)
:*:* Rod: ''[[Gemycircularvirus]]''
Řádek 1 058 ⟶ 1 061:
:*:* Rod: ''[[Tobravirus]]''
 
:::* Nezařazené rody: ''[[Albetovirus]]'', ''[[Aumaivirus]]'', ''[[Blunervirus]]'', ''[[Botybirnavirus]]'', ''[[Cilevirus]]'', ''[[Deltavirus]]'', ''[[Dinodnavirus]]'' (patřil by do zatím neuznaného řádu [[#„Megavirales“|''Megavirales'']]<ref name="Dinodnavirus"/>), ''[[Higrevirus]]'', ''[[Idaeovirus]]'', ''[[Negevirus]]'' (neuznaný)<ref name="Shi_2016"/>, ''[[Ostravirus]]'' (neuznaný)<ref name="Grybchuk_2018"/><ref name="CT24_2018"/>, ''[[Ourmiavirus]]'', ''[[Papanivirus]]'', ''[[Polemovirus]]'', ''[[Qinvirus]]'' (neuznaný)<ref name="Shi_2016"/>, ''[[Rhizidiovirus]]'', ''[[Salterprovirus]]'', ''[[Sinaivirus]]'', ''[[Sobemovirus]]'', ''[[Tornovirus]]'' (neuznaný, blízký čeledi ''Circoviridae'')<ref name="STTV"/>, ''[[Virtovirus]]'', ''[[Weivirus]]'' (neuznaný)<ref name="Shi_2016"/>, ''[[Yanvirus]]'' (neuznaný)<ref name="Shi_2016"/>, ''[[Yuevirus]]'' (neuznaný)<ref name="Shi_2016"/>, ''[[Zhaovirus]]'' (neuznaný)<ref name="Shi_2016"/>
 
== Baltimorova klasifikace ==
Řádek 1 089 ⟶ 1 092:
*:** Nezařazená čeleď: ''Adenoviridae''
*:** Nezařazená čeleď: ''Ampullaviridae''
*:** Nezařazená čeleď (neuznaná): ''[[Autolykiviridae]]''<ref name="Kauffman_2018"/><ref name=" Ignacio-Espinoza_2018"/><ref name="Mihulka_2018"/>
*:** Nezařazená čeleď: ''Baculoviridae''
*:** Nezařazená čeleď: ''Bicaudaviridae''
Řádek 1 174 ⟶ 1 177:
*:* Nezařazená čeleď: ''Tombusviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Virgaviridae''
*:* Nezařazené rody: ''Albetovirus'', ''Aumaivirus'', ''[[Blunervirus]]'', ''Cilevirus'', ''Higrevirus'', ''Idaeovirus'', ''Negevirus'' (neuznaný)<ref name="Shi_2016"/>, ''Ostravirus'' (neuznaný)<ref name="Grybchuk_2018"/><ref name="CT24_2018"/>, ''Ourmiavirus'', ''Papanivirus'', ''Polemovirus'', ''Sinaivirus'', ''Sobemovirus'', ''Virtovirus'', ''Weivirus'' (neuznaný)<ref name="Shi_2016"/>, ''Yanvirus'' (neuznaný)<ref name="Shi_2016"/>, ''Zhaovirus'' (neuznaný)<ref name="Shi_2016"/>
 
* ''' Skupina V.: [[ssRNA viry s negativní polaritou]]''', tedy viry s jednovláknovou RNA přepisovanou do mRNA opačné polarity
*: Patří sem:
*:* '''Řád: ''Bunyavirales''''' (celý) ){{#tag:ref|Viry z čeledi ''Phenuiviridae'' a ''Tospoviridae'' z řádu ''Bunyavirales'' a viry z čeledi ''Arenaviridae'' obsahují i ssRNA s pozitivní polaritou.<ref name="Bunyaviridae Study Group_2016"/><ref name="Species_2017"/>|group="pozn."|name="Bunyavirales2"}}
*:* '''Řád: ''Mononegavirales''''' (celý)
*:* Nezařazená čeleď: ''Arenaviridae''<ref name="Bunyavirales2" group="pozn." />
Řádek 1 295 ⟶ 1 298:
<ref name="pending">International Committee on Taxonomy of Viruses, ''Pending Proposals'' [http://talk.ictvonline.org/files/proposals/default.aspx Dostupné online] (anglicky)</ref>
<ref name="Bunyaviridae Study Group_2016">Bunyaviridae Study Group: Create a new order, ''Bunyavirales'', to accommodate nine families (eight new, one renamed) comprising thirteen genera. Proposal to ICTV, Nr. 2016.030a-vM, 2016. [https://talk.ictvonline.org/files/proposals/taxonomy_proposals_plant1/m/plant02/6426 Dostupné online] (anglicky)</ref>
<ref name="Grybchuk_2018">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Grybchuk
| jméno = Danyil
| příjmení2 = Akopyants
| jméno2 = Natalia S.
| příjmení3 = Kostygov
| jméno3 = Alexei Y.
| příjmení4 = Konovalovas
| jméno4 = Aleksandras
| příjmení5 = Lye
| jméno5 = Lon-Fye
| příjmení6 = Dobson
| jméno6 = Deborah E.
| příjmení7 = Zangger
| jméno7 = Haroun
| spoluautoři = FASEL, Nicolas; BUTENKO, Anzhelika; FROLOV, Alexander O.; VOTÝPKA, Jan; d’AVILA-LEVY, Claudia M.; KULICH, Pavel; MORAVCOVÁ, Jana; PLEVKA, Pavel; ROGOZIN, Igor B.; SERVA, Saulius; LUKEŠ, Julius; BEVERLEY, Stephen M.; YURCHENKO, Vyacheslav.
| titul = Viral discovery and diversity in trypanosomatid protozoa with a focus on relatives of the human parasite ''Leishmania''
| periodikum = Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS)
| rok vydání = 2017
| měsíc vydání = prosinec
| den vydání = 28
| ročník = 115
| typ ročníku = svazek
| číslo = 3
| strany = E506-E515
| url = http://www.pnas.org/content/115/3/E506.long
| dostupnost2 = PDF
| url2 = http://www1.osu.cz/~yurchenko/pdf/PNAS2018.pdf
| url3 = https://www.researchgate.net/publication/322110746_Viral_discovery_and_diversity_in_trypanosomatid_protozoa_with_a_focus_on_relatives_of_the_human_parasite_Leishmania
| issn = 1091-6490
| doi = 10.1073/pnas.1717806115
| pmid = 29284754
| jazyk = anglicky
}}</ref>
<ref name="Adriaenssens_2015">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Adriaenssens
Řádek 1 854 ⟶ 1 891:
| pmid = 27880757
| jazyk = anglicky
}}</ref>
<ref name="CT24_2018">{{Citace elektronického periodika
| autor = kar ([[Česká tisková kancelář|ČTK]])
| titul = Ostrava má svůj virus. Podle vědců se OstraVirus nepodobá žádnému jinému na Zemi
| periodikum = ČT24.cz
| odkaz na periodikum = ČT24
| vydavatel = [[Česká televize]]
| rok vydání = 2018
| měsíc vydání = duben
| den vydání = 4
| kapitola = Všda
| url = http://www.ceskatelevize.cz/ct24/veda/2439526-ostrava-ma-svuj-virus-podle-vedcu-se-ostravirus-nepodoba-zadnemu-jinemu-na-zemi
}}</ref>
<ref name="STTV">{{Citace elektronického periodika
Citováno z „https://cs.wikipedia.org/wiki/Klasifikace_virů“