Vystudoval všeobecné lékařství na 1. Lékařské fakultě Univerzity Karlovy. Poté začal pracovat jako chirurg v Nemocnici Hořovice, v irském Dublinu[[Dublin]]u a v současnosti v Nemocnici Na Františku v Praze. V roce 2010 se vydal na svou první misi pod hlavičkou organizace [[Lékaři bez hranic]], a to na [[Haiti]].<ref>{{Citace elektronického periodika | příjmení = Kočová | jméno = Radka | titul = Chlap má mít svou misi, Tomáš Šebek se vydal na Haiti| periodikum = Deník.cz | datum vydání = 2011-1-14 | url = http://berounsky.denik.cz/zpravy_region/horovice_110115_haiti.html}}</ref> Vrátil se tam o dva roky později, poté absolvoval dvě mise v [[Afghánistán|afghánském]] [[Kundúz (město)|Kundúzu]].<ref>{{Citace elektronické monografie | příjmení = | jméno = | titul = Tomáš Šebek | url = http://www.lekari-bez-hranic.cz/cz/person-profile/tomas-sebek | datum vydání = | vydavatel = Lékaři bez hranic }}</ref> V lednu až březnu 2017 pracoval na misi v [[Jižní Súdán|Jižním Súdánu]].<ref>{{Citace elektronického periodika | příjmení = Stingl | jméno = Tomáš | titul = Tomáš Šebek: Když jsem v Súdánu brečel, nikdo mi to nevyčetl| periodikum = E15.cz | datum vydání = 2017-3-24 | url = http://nazory.e15.cz/rozhovory/tomas-sebek-kdyz-jsem-v-sudanu-brecel-nikdo-mi-to-nevycetl-1330365}}</ref>
