Klasifikace virů: Porovnání verzí

Smazaný obsah Přidaný obsah
aktualizace dle nového vydání reference
aktualizace + ref
Řádek 416:
 
===„Megavirales“===
*'''Řád (neuznaný): ''Megavirales''''' (7 čeledí, 32 neuznané čeledi, 1 nezařazenýuznaný roda 2 neuznané nezařazené rody)<ref name="Moumouvirus" /><ref name="Colson_2013">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Colson
| jméno = Philippe
Řádek 436:
| pmid = 23812617
| jazyk = anglicky
}}</ref><ref name="Megavirales" group="pozn." />
}}</ref>
*::*Nezařazený rod: ''Dinodnavirus''
*::*Nezařazený rod (neuznaný): ''Faustovirus''<ref name="Reteno_2015">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Reteno
| jméno = Dorine Gaëlle I.
| příjmení2 = Benamar
| jméno2 = Samia
| příjmení3 = Khalil
| jméno3 = Jacques Bou
| příjmení4 = Andreani
| jméno4 = Julien
| příjmení5 = Armstrong
| jméno5 = Nicholas
| příjmení6 = Klose
| jméno6 = Thomas
| příjmení7 = Rossmann
| jméno7 = Michael
| spoluautoři = COLSON, Philippe; RAOULT, Didier; La SCOLA, Bernard.
| titul = Faustovirus, an Asfarvirus-Related New Lineage of Giant Viruses Infecting Amoebae
| periodikum = Journal of Virology
| rok vydání = 2015
| měsíc vydání = duben
| den vydání = 15
| ročník = 89
| typ ročníku = svazek
| číslo = 13
| strany = 6585-6594
| url = http://jvi.asm.org/content/89/13/6585.full
| issn = 1098-5514
| doi = 10.1128/JVI.00115-15
| pmid =
| jazyk = anglicky
}}</ref><ref name="Benamar_2016">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Benamar
| jméno = Samia
| příjmení2 = Reteno
| jméno2 = Dorine Gaëlle I.
| příjmení3 = Bandaly
| jméno3 = Victor
| příjmení4 = Labas
| jméno4 = Noémie
| příjmení5 = Raoult
| jméno5 = Didier
| příjmení6 = La Scola
| jméno6 = Bernard
| titul = Faustoviruses: Comparative Genomics of New ''Megavirales'' Family Members
| periodikum = Frontiers in Microbiology
| rok vydání = 2016
| měsíc vydání = únor
| den vydání = 5
| ročník = 7
| typ ročníku = svazek
| číslo = 3
| strany = 1-9
| url = http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fmicb.2016.00003/full
| url2 = https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4742530/
| issn =
| doi = 10.3389/fmicb.2016.00003
| pmid =
| jazyk = anglicky
}}</ref>
*::*Nezařazený rod (neuznaný): ''Mollivirus''<ref name="Legendre_2015">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Legendre
| jméno = Matthieu
| příjmení2 = Lartigue
| jméno2 = Audrey
| příjmení3 = Bertaux
| jméno3 = Lionel
| příjmení4 = Jeudy
| jméno4 = Sandra
| příjmení5 = Bartoli
| jméno5 = Julia
| příjmení6 = Lescot
| jméno6 = Magali
| příjmení7 = Alempic
| jméno7 = Jean-Marie
| spoluautoři = RAMUS, Claire; BRULEY, Christophe; LABADIE, Karine; SHMAKOVA, Lyubov; RIVKINA, Elizaveta; COUTÉ, Yohann; ABERGEL, Chantal; CLAVERIE, Jean-Michel.
| titul = In-depth study of ''Mollivirus sibericum'', a new 30,000-y-old giant virus infecting ''Acanthamoeba''
| periodikum = Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS)
| rok vydání = 2015
| měsíc vydání = září
| den vydání = 8
| ročník = 112
| typ ročníku = svazek
| číslo = 38
| strany = E5327–E5335
| poznámky =
| url = http://www.pnas.org/content/112/38/E5327.full
| issn = 1091-6490
| doi = 10.1073/pnas.1510795112
| pmid = 26351664
| jazyk = anglicky
}}</ref>
**Nezařazená čeleď: ''Ascoviridae'' (2 rody)<ref name="Megavirales" group="pozn." />
**:*Rod: ''Ascovirus''
Řádek 453 ⟶ 544:
**:*Rod (neuznaný): ''Lausannevirus''
**:*Rod (neuznaný): ''Tunisvirus''
**Nezařazená čeleď (neuznaná): ''MegaviridaeMimiviridae'' (1 neuznaný rod; v případě ztotožnění s neuznanou čeledí ''Mimiviridae'' 2 rody a, 3 neuznané rody){{#tag:ref|Vzhledem k příbuznosti je navrhováno vyčlenění čeledí ''Ascoviridae'', ''Asfarviridae'', ''Iridoviridae'', ''Marseilleviridae'', ''Megaviridae'', ''Mimiviridae'', ''Phycodnaviridae'' a ''Poxviridae'' do zvláštního řádu '''''Megavirales'''''.<ref name="Moumouvirus" /><ref name="Colson_2013" /><ref>ICTV: [http://talk.ictvonline.org/files/proposals/taxonomy_proposals_fungal1/m/fung02/4649.aspx Taxonomy Proposals]</ref> Pracovní skupina ICTV Poxviridae Study Group zatím neodsouhlasila zařazení poxvirů do navrhovaného řádu. Do řádu by pravděpodobně také náležely navrhované čeledi ''Pandoraviridae'' (vzhledem k blízkosti k čeledi ''Phycodnaviridae'')<ref name="Yutin_2013">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Yutin
| jméno = Natalya
Řádek 474 ⟶ 565:
| pmid =
| jazyk = anglicky
}}</ref> a ''Pithoviridae'' (vzhledem k blízkosti k čeledím ''Iridoviridae'' a ''Marseilleviridae'')<ref name="Claverie_2014" />, jakož i nezařazený rod ''Dinodnavirus'' (vzhledem k blízkosti k čeledi ''Asfarviridae'')<ref name="Dinodnavirus" /> a neuznané rody ''Faustovirus'' (také blízký k ''Asfarviridae'') a ''Mollivirus'' (blízký k navrhované čeledi ''Pandoraviridae'').|group="pozn."|<ref name="MegaviralesFischer_2016"}}>{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Fischer
**:*Rod (neuznaný): ''Megavirus''<ref>{{Citace elektronického periodika
| jméno = Matthias G.
| titul = Giant viruses come of age
| periodikum = Current Opinion in Microbiology
| rok vydání = 2016
| měsíc vydání = březen
| den vydání = 19
| ročník = 31
| typ ročníku = svazek
| strany = 50-57
| url = http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S136952741630008X
| issn = 1369-5274
| doi = 10.1016/j.mib.2016.03.001
| pmid =
| jazyk = anglicky
}}</ref><ref name="Halary_2016">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Halary
| jméno = S.
| příjmení2 = Temmam
| jméno2 = S.
| příjmení3 = Raoult
| jméno3 = D.
| příjmení4 = Desnues
| jméno4 = C.
| titul = Viral metagenomics: are we missing the giants?
| periodikum = Current Opinion in Microbiology
| rok vydání = 2016
| měsíc vydání = březen
| den vydání = 19
| ročník = 31
| typ ročníku = svazek
| strany = 34-43
| url = http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1369527416000072
| issn = 1369-5274
| doi = 10.1016/j.mib.2016.01.005
| pmid =
| jazyk = anglicky
}}</ref>|group="pozn."|name="Megavirales"}}
**:*Rod: ''Cafeteriavirus''
**:*Rod: ''[[Mimivirus]]''
**:*Rod (neuznaný): ''[[Megavirus]]''<ref>{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Arslan
| jméno = Defne
Řádek 495 ⟶ 626:
| jazyk = anglicky
}}</ref>
**Nezařazená čeleď: ''Mimiviridae'' (2 rody, 2 neuznané rody; v případě ztotožnění s neuznanou čeledí ''Megaviridae'' 2 rody a 3 neuznané rody)<ref name="Megavirales" group="pozn." />
**:*Rod: ''Cafeteriavirus''
**:*Rod: ''[[Mimivirus]]''
**:*Rod (neuznaný): ''Lentillevirus''<ref>{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Desnues
Řádek 705 ⟶ 833:
:*:*Rod: ''Ilarvirus''
:*:*Rod: ''Oleavirus''
:*Nezařazená čeleď: ''[[:Kategorie:Bunyaviridae|Bunyaviridae]]'' (5 rodů, 2 neuznané rody){{#tag:ref|V r. 2016 bylo navrženo, aby byla čeleď ''Bunyaviridae'' pod novým názvem ''Peribunyaviridae'', společně s nově navrženými čeleděmi ''Feraviridae'', ''Fimoviridae'' (zahrnující dosud nezařazený rod ''Emaravirus''), ''Hantaviridae'', ''Jonviridae'', ''Nairoviridae'', ''Phasmaviridae'', ''Phenuiviridae'' (zahrnující dosud nezařazený rod ''Tenuivirus'') a ''Tospoviridae'' do nově vytvořeného samostatného řádu '''''Bunyavirales'''''.<ref name="Bunyaviridae Study Group_2016">Bunyaviridae Study Group: Create a new order, ''Bunyavirales'', to accommodate nine families (eight new, one renamed) comprising thirteen genera. Proposal to ICTV, Nr. 2016.030a-vM, 2016. [https://talk.ictvonline.org/files/proposals/taxonomy_proposals_plant1/m/plant02/6426 Dostupné online] (anglicky)</ref>|group="pozn."|name="Bunyavirales"}}
:*Nezařazená čeleď: ''[[:Kategorie:Bunyaviridae|Bunyaviridae]]'' (5 rodů, 2 neuznané rody)
:*:*Rod: ''[[Hantavirus]]''
:*:*Rod: ''Nairovirus''
Řádek 904 ⟶ 1 032:
:*:*Rod: ''Influenzavirus B''
:*:*Rod: ''Influenzavirus C''
:*:*Rod (neuznaný): ''Influenzavirus D''<ref>ICTV: [httphttps://talk.ictvonline.org/files/proposals/taxonomy_proposals_vertebrate1animal_dsrna_and_ssrna-_viruses/m/vert01animal_rna_minus_ec_approved/4954.aspx6262 Taxonomy Proposals]</ref>
:*:*Rod: ''Isavirus''
:*:*Rod: ''Quaranjavirus''
Řádek 1 096 ⟶ 1 224:
:*:*Rod: ''Tobravirus''
 
:::*Nezařazené rody: ''Albetovirus'', ''Aumaivirus'', ''Bacilladnavirus'', ''Botybirnavirus'', ''Cilevirus'', ''Deltavirus'', ''Dinodnavirus'' (pravděpodobně by patřil do neuznaného řádu ''Megavirales''<ref name="Dinodnavirus"> [http://talk.ictvonline.org/files/ictv_official_taxonomy_updates_since_the_8th_report/m/fungal-official/4091/download.aspx&sa=U&ei=ptXSUdIQxdO1BuTXgOgM&ved=0CCgQFjAB&usg=AFQjCNF_t_nyrQZhOe8K-fHM5Q_pf3lMDQ ICTV taxonomic proposal 2009.001a/fF] (anglicky)]</ref>), ''Emaravirus''<ref name="Bunyavirales" group="pozn." />, ''Higrevirus'', ''Idaeovirus'', ''Ourmiavirus'', ''Papanivirus'', ''Polemovirus'', ''Rhizidiovirus'', ''Salterprovirus'', ''Sinaivirus'', ''Sobemovirus'', ''Tenuivirus''<ref name="Bunyavirales" group="pozn." />, ''Virtovirus''
 
==Baltimorova klasifikace==
Řádek 1 148 ⟶ 1 276:
*:**Čeleď: ''Iridoviridae''
*:**Čeleď: ''Marseilleviridae''
*:**Čeleď (neuznaná): ''Megaviridae''
*:**Čeleď: ''Mimiviridae''
*:**Čeleď (neuznaná): ''Pandoraviridae''
Řádek 1 155 ⟶ 1 282:
*:**Čeleď: ''Poxviridae''
*:**Nezařazený rod: ''Dinodnavirus''
*:**Nezařazený rod (neuznaný): ''Faustovirus''
*:**Nezařazený rod (neuznaný): ''Mollivirus''
*:*a dále:
*:**'''Řád: ''Ligamenvirales''''' (celý)