Rubivirus

Rubivirus je rod virů z čeledi Togaviridae, ke kterým patří také rod Alphavirus. Napadá savce, ale není přenášen hmyzem.

Rubivirus
Vědecká klasifikace
Řád	Nezařazené +ssRNA
Čeleď	Togaviridae
Druh	Rubivirus
Binomické jméno
Rubivirus rubellae
Druh
Rubella virus
Některá data mohou pocházet z datové položky.

Virologie

Morfologie

Virus se řadí mezi obalené viry (má membránovou schránku), přičemž se na membráně (o průměru 60-70 nm) vyskytuje 80 špic složených z trojic heterodimerů glykoproteinů E1 a E2, společně s menším proteinem 6K. Membrána je bohatá na cholesterol a sfingolipid, což jsou složky nezbytné pro vstup a výstup z buňky. Kapsid je sférický (ikosahedrický) o průměru 35-40 nm a skládá se z 240 podjednotek, (T=4).

Genom

Genom tvoří jedna molekula jednovláknové RNA s pozitivní polaritou o délce 9,762 kb a o mol.hm. 4 x 106. Nestrukturní proteiny (replikáza) jsou umístěné na 5' konci, zaujímající zhruba 2/3 délky genomu, zatímco strukturní (kapsidový protein a 3 obalové proteiny) jsou v psolední třetině, na 3' konci. Obě tyto skupiny jsou překládány jako polyprotein, který je následně rozštěpen. Genom je očepičkován a polyadenylován. Nestrukturní proteiny jsou překládány rovnou z genomu, zatímco strukturní proteiny jsou překládány z subgenomické mRNA. Na začátku genomu je průměrně 59 nukleotidů dlouhá nepřekládaná oblast, zatímco na konci je dlouhá průměrně 322 nukleotidů.

Proteom

Podrobnější informace naleznete v článku Alphavirus.

Proteom je v podstatě identický s tím alphavirálním. E1 a E2 tvoří heterodimer, a mají 13 a 7 aminokyselinových zbytků dlouhé cytoplasmatické konce. Všechny tři strukturní proteiny jsou asociovány s membránou. Kapsidový protein je fosfoprotein o délce 293 nebo 300 aminokyselinových zbytků, přičemž délka je závislá na použití jednoto ze startovních kodonů. Replikační proteiny P150 a P90 jsou syntetizovány z genomické RNA, zatímco strukturní protieny jsou syntetizovány z subgenomické RNA. narozdíl od strukturních proteinů, mají replikační proteiny určitou homologii s proteiny alphavirů.

Životní cyklus

Receptory a vstup do buňky

Stejně jako aplhavirus, i rubivirus vstupuje du buněk zřejmě skrze ubiquitinový receptor, který je konzervován pro velkou skupinu organismů. na rozdíl od laphavirů však není tento rod přenášen hmyzem. Do buněk vstupuje repetrorem zprostředkovanou endocytózou, načež následuje fůze membrán v endozomu, který se pozvolna okyseluje.

Replikace, transkripce a translace

během infekce jsou syntetizovány tři druhy RNA. Genomová RNA, komplementární RNA a subgenomická RNA. Genomická RNA je přeložena jako 200-kDa polyprotein, který je přestřižen virovou proteázou. Na rozdíl od té alphavirové je to metalloproteáza, která obsahuje doménu pro zinkové prsty. Replikační komplex je asociován s membránou.

Zrání

Obalovací signál, mezi 347-tým a 375-tým nukleoidem na genomové RNA, interaguje s kapsidovými zbytky číslo 28 až 56. Fosforylace kapsidového proteinu slouží jako regulátor, který zabraňuje zabalení nevirové RNA. C koncová doména kapsidového proteinu je stále asociována s ER membránou, což je zřejmě nezbytné pro správné napojení glykoproteinů jejich transmembránovými doménami. Přestože rubiviry pučí do Golgiho aparátu, věří se, že E1 a E2 mají podobné funkce jako jejich alphavirové analogy. Přesná struktura a morfologie ještě není známa, avšak jistě se při jejich zjišťování uplatní techniky tolik úspěšné u alphavirů.

Odkazy

Literaura

Fields Virology, 5th edith

Související odkazy

Alphavirus