Topoizomeráza: Porovnání verzí
Smazaný obsah Přidaný obsah
m - Soubor:Topoisomerase_I.png (na Commons smazal commons:User:Jameslwoodward, důvod: Per commons:Commons:Deletion requests/PDB dummy) |
→Funkce: rozšíření |
||
Řádek 2:
'''Topoizomeráza''' (dříve též „swiveláza“) je [[enzym]] ze skupiny [[izomeráza|izomeráz]], který umožňuje měnit tzv. [[terciární struktura|terciární strukturu]] ([[supercoiling]]) [[DNA]], a to bez vlivu na sekundární a primární strukturu. Účastní se zejména [[replikace DNA]], kde dohlíží na to, aby se při rozmotávání vlákna DNA v [[replikační vidlice|replikační vidlici]] pomocí [[helikáza|helikáz]] neutáhlo zbývající vlákno DNA natolik, že by již nešlo rozmotat.
==
Topoizomerázy jsou schopné rozštěpit vlákno DNA, rozmotat 1 či 2 otočky [[dvoušroubovice]] a opět spojit rozrušený řetězec do celistvé podoby.<ref>National Library of Medicine - Medical Subject Headings, DNA Topoisomerases, http://www.nlm.nih.gov/cgi/mesh/2009/MB_cgi?mode=&term=DNA+Topoisomerases</ref> Topoizomerázy je obecně možné dělit do dvou až tří skupin:
* [[Topoizomeráza I]] – rozštěpuje pouze jedno vlákno [[dvoušroubovice]], druhé proklouzne takto vytvořeným volným prostorem;<ref name=genetics>{{citace monografie| titul = A Dictionary of Genetics, Seventh Edition | autor = ROBERT C. KING; WILLIAM D. STANSFIELD; PAMELA K. MULLIGAN | vydavatel = Oxford University Press| rok=2006}}</ref>
* [[Topoizomeráza II]] – rozštěpuje obě vlákna dvoušroubovice;<ref name=genetics />
* jako třetí třída topoizomeráz bývá označována [[recQ-helikáza]].<ref name=ency>{{citace monografie | editoři = Lennarz,W.J., Lane, M.D. | titul =
===Topoizomerázy I. třídy ===
Topoizomerázy I. třídy vytváří v průběhu své enzymatické činnosti jakýsi přechodný stav, během kterého je jedno z vláken rozštěpeno a navázáno na [[tyrosin]]ový zbytek enzymu. Pokud se tento tyrosin váže na [[5' konec]] rozštěpeného vlákna, jsou to topoizomerázy třídy IA, jestliže na [[3' konec]], jedná se o topoizomerázy třídy IB. Různí zástupci obou podtříd se vyskytují napříč všemi organismy. Do skupiny IA patří např. [[topoizomeráza I]], která je schopná odstraňovat negativní [[nadšroubovice|nadšroubovicové nadobrátky]]. Některé topoizomerázy IA nejen odstraňují nadobrátky negativní, ale dokonce (nicméně však za spotřeby [[adenosintrifosfát|ATP]]) aktivně vytváří nadobrázky pozitivní (tzv. [[reverzní gyráza|reverzní gyrázy]]). Topo IB jsou schopné relaxovat (ostraňovat) jak negativní, tak pozitivní nadšroubovicové obrázky. Většina běžných topoizomeráz I. třídy jsou obecně monomery, s několika výjimkami.<ref name=topo1>{{citace sborníku | sestavitel = Lennarz,W.J., Lane, M.D. | sborník = Encyclopedia of Biological Chemistry , Four-Volume Set, 1-4| titul= DNA Topoisomerases: Type I| jméno=James J. |příjmení= Champoux}}</ref>
===Topoizomerázy II. třídy ===
Topoizomerázy II. třídy jsou schopné rozštěpit obě vlákna dvoušroubovice DNA, a proto vyjma své schopnosti regulovat množství nadobrátek dále také umí opravovat různé spletence a uzly vznikající na molekulách DNA (mimo jiné při [[segregace (genetika)|segregaci sesterských chromozomů]] a po [[crossing-over|rekombinaci]]). U [[eukaryota|eukaryot]] se označuje tento enzym jednoduše [[topoizomeráza II]]; je schopná odstraňovat pozitivní i negativní nadobrátky. Pro svou činnost potřebuje [[adenosintrifosfát|ATP]]. U bakterií se vyskytuje zejména tzv. [[DNA gyráza]], [[heterodimer]]ní enzym, který je jako jediná topoizomeráza II. třídy schopen aktivně vytvářet negativní nadobrátky.<ref name=topo2>{{citace sborníku | sestavitel = Lennarz,W.J., Lane, M.D. | sborník = Encyclopedia of Biological Chemistry , Four-Volume Set, 1-4| titul= DNA Topoisomerases: Type II| jméno=Renier |příjmení= Vélez-Cruz |jméno2= Neil | příjmení2= Osheroff}}</ref>
== Odkazy ==
| |||