Wikipedie

National Center for Biotechnology Information: Porovnání verzí

Interaktivně procházet historii
← Přejít na předchozí porovnáníPřejít na další porovnání →
Smazaný obsah Přidaný obsah
VizuálníWikitext
mBez shrnutí editace
mBez shrnutí editace
Řádek 12:
Úlohou NCBI je ukládání, zpracování a anotace vědeckých dat, zejména z oblastí molekulární biologie, medicíny, biochemie a genetiky. Instituce se také aktivně podílí na vyvíjení nástrojů pro analýzu bioinformatických dat. V databázích NCBI se soustřeďují výsledky [[sekvenování DNA|sekvenací DNA]] ([[GenBank]]), vědecké články ([[PubMed Central]], [[PubMed]]), informace o genech (RefSeq, Gene), anotace sekvencí makromolekul (Protein, Nucleotide) nebo mapovací data již osekvenovaných genomů (Genome). Služby NCBI jsou volně dostupné, podobně jako u bioinformatických institutů jako European Bioinformatics Institute (EBI), Swiss Institute of Bioinformatics (SIB) nebo DNA Data Bank of Japan (DDBJ).
 
Pro tvorbu svých databází využívá NCBI data ukládané vědeckou komunitou manuálně přímo do NCBI nebo získávané jejich výměnou se spřízněnými institucemi jako např. DDBJ, European Molecular Biology Laboratory (EMBL), Protein Information Resource (PIR) nebo vydavateli vědecké literatury. Minoritní podíl na zisku dat tvoří také cílené správcovské aktivity NCBI, data aktivně vkládaná zaměstnanci centra. Množství uložených dat v NCBI roste exponenciálně - v roce 2020 bylo ve všech databázích NCBI celkově uložených přes 3 miliardy záznamů ,<ref>{{Citace periodika
| příjmení = Sayers
| jméno = Eric W
Řádek 30:
| url = https://doi.org/10.1093/nar/gkaa892
| datum přístupu = 2021-05-03
}}</ref>, v porovnání s přibližně 680 miliony záznamy v roce 2012 <ref>{{Citace periodika
| titul = Database resources of the National Center for Biotechnology Information
| periodikum = Nucleic Acids Research
Řádek 64:
| url = https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1781113/
| datum přístupu = 2021-05-03
}}</ref> Služby NCBI jsou denně využívány až 4 miliony použivatelů.<ref>{{Citace elektronického periodika
| titul = NCBI Web Server Stats
| periodikum = www.ncbi.nlm.nih.gov
Řádek 78:
== GenBank ==
{{Viz též|GenBank}}
[[GenBank]] je databáze genetických sekvencí obsahující anotovanou sbírku DNA sekvencí. GenBank je spolu s DNA Data Bank of Japan a European NuclotideNucleotide Archive součástí tzv. International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC), které aktivně spolupracují na archivaci nukleotidových sekvencí. Mezi těmito institucemi také dochází k vzájemné výměně uložených dat na denní báze. Nové vydání GenBank vychází průběžně v dvouměsíčních intervalech zveřejněním na stránce ftp. Jednotlivé záznamy v GenBank jsou katalogizované pod unikátním šestimístným číslem a obsahují údaje jako zdrojový organismus, stručnístručný popis k dané sekvenci, délka a typ sekvence, pořadí nukleotidů ve formátu FASTA a také bibliografický záznam.<ref>{{Citace periodika
| příjmení = Benson
| jméno = Dennis A.
Citováno z „https://cs.wikipedia.org/wiki/National_Center_for_Biotechnology_Information“