Chromozom X je rozměrysubmetacentrický, rozměrově jednoznačně větší chromozom než chromozom Y. Má velikost asi 155 milionů párů [[nukleová báze|bází]] (Mbp). Obsahuje 1098 [[gen]]ů. Pouze 54 z nich má svůj protějšek v chromozomu Y, a tato oblast DNA s 54 geny se při [[meióza|meióze]] u mužů spáruje a dochází v ní ke [[crossing-over]]u. U žen, jichž somatické buňky obsahují tyto chromozomy dva, je jeden z gonozomů umlčen v tzv. [[Barrovo tělísko]]. V tomto stavu je nejméně 75% jeho genů neaktivních (nedochází k [[transkripce (DNA)|transkripci]]), jisté geny však této inaktivaci unikají.<ref name="dictionary">{{citace monografie| titul = A Dictionary of Genetics, Seventh Edition | autor = ROBERT C. KING; WILLIAM D. STANSFIELD; PAMELA K. MULLIGAN | vydavatel = Oxford University Press| rok=2006}}</ref>
