Integráza: Porovnání verzí

'''Integráza''' (zkratka '''IN''') je [[enzym]] (řazený mezi [[rekombináza|rekombinázy]]), který umožňuje vložení cizorodé [[DNA]] do hostitelského [[genom]]u.<ref name="mesh">{{citace elektronické monografie| url = http://www.nlm.nih.gov/cgi/mesh/2011/MB_cgi?mode=&term=Integrases| titul = Integrases| vydavatel=National Library of Medicine - Medical Subject Headings}}</ref> Integrázou disponují [[retroviry]] (Retroviridae)<ref>{{citace elektronické monografie| url = http://viralzone.expasy.org/all_by_species/71.html| titul = Retroviridae| vydavatel=ViralZone}}</ref> a jejich blízcí příbuzní, [[retrotranspozon]]y.<ref name="lodish">{{Citace monografie | titul=Molecular Cell Biology| příjmení=Lodish| jméno=Harvey| spoluautoři=''et al.''| rok=2004| vydavatel=W.H. Freedman and Company| místo=New York| isbn=0-7167-4366-3}}</ref> Zcela odlišný typ integráz mají rovněž mnohé [[temperátní fág|temperátní]] [[bakteriofág]]y.<ref name="phage">{{Citace periodika

Velmi podobný enzym, [[transpozáza|transpozázu]], si kódují [[DNA transpozon]]y, zvláštní parazitické [[sekvence DNA]].<ref name="lodish" /> Registr [[MeSH]] dokonce uvádí, že transpozázy jsou speciální skupinou integráz.<ref name="mesh" />

Integráza retrovirů je složena ze tří [[doména (protein)|domén]]; [[N-terminus|N-terminální]] doména obsahuje [[zinkový prst|zinkové prsty]] a je tedy schopná vázat se na DNA, centrální doména je katalytické jádro schopné provádět vlastní integraci, a konečně zatřetí [[C-terminus|C-terminální]] doména s méně konzervovanou strukturou. Celý enzym však mnohdy vytváří [[dimer]]ní či [[tetramer]]ní uspořádání. Geny pro integrázu se nachází v oblasti genomu známé jako [[pol (oblast)|pol]]. Aby však byl [[virion]] infekční, musí být integrázový protein přítomen uvnitř virové částice. Po [[reverzní transkripce|reverzní transkripci]] RNA genomu přebírá integráza DNA genom, speciálně upraví jeho 3' konce a provádí integraci do hostitelského genomu.<ref name="fields">{{citace monografie| titul = Fields Virology| vydání=5| příjmení = Knipe| jméno=David M.| příjmení2=Howley|jméno2=Peter M.| rok=2007 |vydavatel= Lippincott Williams & Wilkins }}</ref>

Integrázy temperátních fágů (tedy fágů, které jsou schopné [[latentní fáze]]) jsou zcela nepříbuzné retrovirovým integrázám. Řadí se mezi místně specifické rekombinázy, což znamená, že integrují virový genom do specifických míst v genomu hostitele. Dělí se na dvě velké skupiny: [[tyrosin]]ové rekombinázy a [[serin]]ové rekombinázy, podle aminokyseliny, která hraje centrální roli v katalytickém procesu. Ke známých bakteriofágům, které mají integrázu, patří namátkou [[fág lambda]] či [[P1 fág]], ale je jich mnohem více.<ref name="phage" />