Žlábek (DNA): Porovnání verzí

Smazaný obsah Přidaný obsah
m napřímení odkazu
m napřímení odkazu
Řádek 18:
== B-DNA ==
[[Soubor:Homeodomain-dna-1ahd.png|thumb|left|[[Homeodoména]] ve vazbě na DNA: Důležitou součástí je [[alfa-helix]], který je v kontaktu s velkým žlábkem. V rámci homeodomény se však vyskytuje i další stabilizační raménko, které kontaktuje [[malý žlábek]] DNA.<ref name=pollard>{{citace monografie| titul= Cell Biology| jméno=Thomas D| příjmení=Pollard| jméno2= William C| příjmení2= Earnshaw| vydání=2|vydavatel=Saunders| rok=2007| isbn=1416022554| strany=928}}</ref>]]
[[B-DNA]] je převažujícím typem dvoušroubovice nacházejícím se v buňkách a proto jsou standardně popisovány žlábky právě v B-DNA. V dvoušroubovici se střídá tzv. '''velký žlábek''' s '''malým žlábkem''', které se (jak název napovídá) liší svou šířkou a hloubkou. Je to způsobeno [[asymetrie|asymetrickým]] uspořádáním [[komplementární pár|párů bází]] na [[cukr-fosfátová kostra|cukr-fosfátových kostrách]] řetězců DNA.<ref name=king>{{citace monografie| titul = A Dictionary of Genetics, Seventh Edition | jméno= Robert C.| příjmení=King| jméno2=William D. | příjmení2=Stansfield| jméno3=Pamela K.| příjmení3=Mulligan | vydavatel = Oxford University Press| rok=2006}}</ref> [[Glykosidickáglykosidová vazba|Glykosidické vazby]] totiž vždy vychází z obou dvou [[nukleová báze|nukleových bází]] komplementárního páru na jednu stranu dvoušroubovice, takže na jedné straně je vytvořena větší brázda než na straně opačné.<ref name=duke>{{citace monografie| příjmení=Duke| jméno=Tom, et al| titul = Multiple aspects of DNA and RNA: from Biophysics to Bioinformatics| editoři = Didier Chatenay, et al|vydavatel=Elsevier| rok=2005| isbn = 0-444-52081-3| }}</ref> Velký žlábek je 12 [[Ångström|Å]] široký a 8,5 Å hluboký, malý žlábek je 6 Å široký a 7,5 Å hluboký.<ref name=king />
 
=== Velký žlábek ===