[[Soubor:Yamato hit by bomb.jpg|náhled|vlevo|''Jamato'' dne 24. října 1944 během [[Bitva u Leyte#Bitva v Sibuyanském moři|bitvy v Sibuyanském moři]] po zásahu pumou.]]
''JamatoYamato'' byla [[Vlajková loď|vlajkovou lodí]] admirála [[Isoroku Jamamoto|Isoroku Jamamota]] od 12. února 1942, kdy v této funkci nahradila bitevní loď [[Nagato (1919)|''Nagato'']]. V červnu 1942 byla ''Jamato'' součástí hlavního svazu admirála Jamamota při útoku na Midway. Svaz složený z bitevních lodí ''Jamato'', ''Nagato'', [[Mucu (1920)|''Mucu'']], letadlové lodě ''[[Hóšó]]'', lehkého křižníku [[Sendai (1923)|''Sendai'']], 9 [[Torpédoborec|torpédoborců]] a 4 podpůrných lodí se však nakonec do [[Bitva u Midway|bitvy u Midway]] nezapojil. ''Jamato'' poté zůstala vlajkovou lodí ještě 364 dní, než jí v této roli 11. února 1943 vystřídala její sesterská loď Musaši. Celou dobu mezi 29. srpnem 1942 až 8. květnem 1943 kotvila ''Jamato'' na [[atol]]u [[Truk]]. V květnu 1943 se vrátila do Kure, kde bylo posíleno protiletadlové dělostřelectvo a instalován radar typu 22. Kvůli instalaci dalších 25mm kanónů byly odstraněny dvě dělové věže s kanóny 155 mm. To si vynutil rostoucí význam letectva při bojích v Pacifiku.
25. prosince 1943 se ''Jamato'' vydala na cestu zpět k atolu Truk, ale cestou byla poškozena torpédem americké ponorky [[USS Skate (SS-305)|USS ''Skate'']]. Oprava poškození trvala až do dubna 1944. Při těchto opravách byla ještě více posílena protiletecká obrana.
