V sezóně 1997/1998 trénoval český klub [[FK Drnovice|Petra Drnovice]], později trénoval německé kluby [[FC Rot-Weiss Erfurt]] a [[Sportfreunde Siegen]]. Pracoval také jako asistent tréneratrenéra v klubech [[1. FC Köln]] a [[Eintracht Frankfurt]].
TréneremTrenérem slovenské reprezentace se stal [[2. listopad]]u [[2006]], když nahradil [[Dušan Galis|Dušana Galise]]. Kocian už předtím působil u reprezentace, neboť byl asistentem trenéra [[Jozef Vengloš|Jozefa Vengloše]] v letech 1993 až 1995. V létě 2008 byl odvolán. Poté působil 7 měsíců jako asistent [[Karel Brückner|Karla Brücknera]] při [[Rakouská fotbalová reprezentace|rakouské fotbalové reprezentaci]].<ref>[http://futbal.pravda.sk/bruckner-s-kocianom-pokracuju-pri-rakuskej-reprezentacii-p3t-/sk_rfutbal.asp?c=A081107_204524_sk_rfutbal_p43 Pravda.sk: Brückner s Kocianom pokračujú pri rakúskej reprezentácii, 7. november 2008] {{sk}}</ref>
8. prosince 2010 byl oficiálně prohlášen za hlavního trenéra čínského týmu [[Jiangsu Sainty FC]]. O místo přišel v květnu 2011. V Jiangsu vedl 5 zápasů (1 remíza a 4 prohry).
