Genetický kód: Porovnání verzí

Přidáno 3 144 bajtů ,  před 9 lety
doplněn formylmethionin, drobné úpravy, doplnění a ozdrojování u výjimek
m (r2.6.4) (robot přidal: kk:ТРИПЛЕТТЕР)
(doplněn formylmethionin, drobné úpravy, doplnění a ozdrojování u výjimek)
 
Výjimečné postavení mají:
* '''[[Iniciační kodón]]''' - podle něj se pozná začátek [[gen]]ové sekvence [[nukleotidy|nukleotidů]] v [[mRNA]], začíná u něj [[translace]], většinou AUG, výjimečně u prokaryot GUG, UUG, CUG
* '''[[Stop kodón]]''' - končí u něj proteosyntéza, UAA, UAG, UGA
 
UUC (Phe/F)[[Fenylalanin]]<br />
UUA (Leu/L)[[Leucin]]<br />
UUG (Leu/L)[[Leucin]], (''Start'')<sup>2</sup><br />
|
UCU (Ser/S)[[Serin]]<br />
CUC (Leu/L)[[Leucin]]<br />
CUA (Leu/L)[[Leucin]]<br />
CUG (Leu/L)[[Leucin]],<sup>7</sup> (''Start'')<sup>2</sup><br />
|
CCU (Pro/P)[[Prolin]]<br />
! A
|
AUU (Ile/I)[[Isoleucin]], (''Start'')<sup>2</sup><br />
AUC (Ile/I)[[Isoleucin]]<br />
AUA (Ile/I)[[Isoleucin]]<sup>6</sup><br /><br />
AUG (Met/M)[[Methionin]], resp.<br />&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;(fMet)[[N-formylmethionin]], ''Start''<sup>1</sup><br />
|
ACU (Thr/T)[[Threonin]]<br />
GUC (Val/V)[[Valin]]<br />
GUA (Val/V)[[Valin]]<br />
GUG (Val/V)[[Valin]], (''Start'')<sup>2</sup><br />
|
GCU (Ala/A)[[Alanin]]<br />
|}
 
<sup>1</sup>Kodón AUG kóduje [[methionin]] a slouží jako iniciační místo: první AUG v [[mRNA]] je místo, kde [[translace]] začíná. U eukaryot a archeí kóduje [[methionin]], u bakterií (a z nich vzniklých organel - plastidů a mitochondrií) kóduje [[N-formylmethionin]]
<br />
<sup>2</sup>Toto je startovní kodón pouze u některých [[prokaryota|prokaryot]] a v takovém případě pak kóduje [[methionin]]<ref name="start Ecoli"/>
<br />
<sup>3</sup>U některých [[zelené řasy|zelených řas]] se vyvinul nekanonický kód, při kterém UAG a UAA kódují [[glutamin]]<ref name="Cocquyt">{{Citace elektronického periodika
<sup>4</sup>U některých druhů [[archea|archeí]] a [[baktérie|baktérií]] je při biosyntéze enzymů pro metabolismus metanu normální ''Stop''-funkce kodónu UAG modifikována přítomností zvláštní genové sekvence mRNA, umožňující navázat pyrolysinovou tRNA a zabudovat do proteinu [[pyrolysin]] (Pyl/O).
<br />
<sup>5</sup>U rodu ''[[Mycoplasma]]'' byla objevena odchylka kódu, při které kodón UGA kóduje [[tryptofan]] (Trp/W)<br />&nbsp; Při biosyntéze některých proteinů [[archea|archeí]], [[baktérie|baktérií]] i [[eukaryota|eukaryot]] je normální ''Stop''-funkce kodónu UGA díky zvláštní genové sekvenci mRNA ignorována, což umožňuje navázat selenosysteinovou tRNA vzniklou selenizací serinové tRNA a zabudovat do proteinu [[selenocystein]] (Sec/U).
<br />
<sup>6</sup>V plastidech [[obrněnky|obrněnek]] ''Lepidodinium chlorophorum'' byla objevena odchylka kódu, při které kodón AUA kóduje [[methionin]] (Met/M)<ref name="Lepidodinium">{{Citace elektronického periodika
| jazyk = anglicky
}}</ref>
<br />
<sup>7</sup>U rodu ''[[Candida]]'' byla objevena odchylka kódu, při které kodón CUG kóduje [[serin]] (Ser/S)<ref name="CUGserin Candida">{{Citace periodika
| příjmení = Butler
| jméno = Geraldine
| příjmení2 = Rasmussen
| jméno2 = Matthew D.
| příjmení3 = Lin
| jméno3 = Michael F.
| spoluautoři = Manuel A. S. Santos, Sharadha Sakthikumar, Carol A. Munro, Esther Rheinbay, Manfred Grabherr, Anja Forche, Jennifer L. Reedy, Ino Agrafioti, Martha B. Arnaud, Steven Bates, Alistair J. P. Brown, Sascha Brunke, Maria C. Costanzo, David A. Fitzpatrick, Piet W. J. de Groot, David Harris, Lois L. Hoyer, Bernhard Hube, Frans M. Klis, Chinnappa Kodira, Nicola Lennard, Mary E. Logue, Ronny Martin, Aaron M. Neiman, Elissavet Nikolaou, Michael A. Quail, Janet Quinn, Maria C. Santos, Florian F. Schmitzberger, Gavin Sherlock, Prachi Shah, Kevin A. T. Silverstein, Marek S. Skrzypek, David Soll, Rodney Staggs, Ian Stansfield, Michael P. H. Stumpf, Peter E. Sudbery, Thyagarajan Srikantha, Qiandong Zeng, Judith Berman, Matthew Berriman, Joseph Heitman, Neil A. R. Gow, Michael C. Lorenz, Bruce W. Birren, Manolis Kellis, Christina A. Cuomo.
| titul = Evolution of pathogenicity and sexual reproduction in eight ''Candida'' genomes
| periodikum = Nature
| odkaz na periodikum = Nature
| rok = 2009
| měsíc = květen
| den = 24
| ročník = 459
| typ ročníku = svazek
| číslo = 7247
| strany = 657–662
| url = http://www.nature.com/nature/journal/v459/n7247/full/nature08064.html
| formát = html
| issn = 0028-0836
| doi = 10.1038/nature08064
| jazyk = anglicky
}}</ref>
 
 
== Tabulka 2: [[aminokyseliny|aminokyselina]] → kodón(y) ==
| align="center" valign="top" | '''Met'''
| valign="top" | M
| valign="top" | AUG (AUU, GUG, UUG, CUG)<sup>2</sup> (AUA)<sup>45</sup>
|-
| align="center" valign="top" | '''Asn'''
| align="center" valign="top" | '''Pyl'''
| valign="top" | O
| valign="top" | UAG<sup>23</sup>
|-
| align="center" valign="top" | '''Gln'''
| align="center" valign="top" | '''Sec'''
| valign="top" | U
| valign="top" | UGA<sup>34</sup>
|-
| align="center" valign="top" | '''Glu'''
| align="center" valign="top" | '''Ser'''
| valign="top" | S
| valign="top" | UCU, UCC, UCA, UCG, AGU, AGC (CUG)<sup>7</sup>
|-
| align="center" valign="top" | '''Gly'''
| align="center" valign="top" | '''Trp'''
| valign="top" | W
| valign="top" | UGG (UGA)<sup>6</sup>
|-
| align="center" valign="top" | '''Ile'''
| valign="top" | I
| valign="top" | AUU<sup>2</sup>, AUC, AUA<sup>45</sup>
| align="center" valign="top" | '''Tyr'''
| valign="top" | Y
| align="center" valign="top" | '''Leu'''
| valign="top" | L
| valign="top" | UUA, UUG<sup>2</sup>, CUU, CUC, CUA, CUG<sup>2,7</sup>
| align="center" valign="top" | '''Val'''
| valign="top" | V
| valign="top" | GUU, GUC, GUA, GUG<sup>2</sup>
|-
| align="center" valign="top" | '''''Start'''''
| valign="top" |
| valign="top" | AUG (AUU, GUG, UUG, CUG)<sup>2</sup>
| align="center" valign="top" | '''''Stop'''''
| valign="top" |
| valign="top" | UAG<sup>1,23</sup>, UGA<sup>34,6</sup>, UAA<sup>1</sup>
|}
 
<sup>1</sup>U některých [[zelené řasy|zelených řas]] se vyvinul nekanonický kód, při kterém UAG a UAA kódují [[glutamin]]<ref name="Cocquyt"/>
<br />
<sup>2</sup>U některých [[prokaryota|prokaryot]] je startovním kodónem také AUU, GUG, UUG či CUG, v takovém případě pak kóduje [[methionin]]<ref name="start Ecoli">{{Citace periodika
<sup>2</sup>U některých druhů [[archea|archeí]] a [[baktérie|baktérií]] je při biosyntéze enzymů pro metabolismus metanu normální ''Stop''-funkce kodónu UAG modifikována přítomností zvláštní genové sekvence mRNA, umožňující navázat pyrolysinovou tRNA a zabudovat do proteinu [[pyrolysin]] (Pyl/O).
| příjmení = Blattner
| jméno = F. R.
| příjmení2 = Plunkett
| jméno2 = G.
| příjmení3 = Bloch
| jméno3 = C. A.
| spoluautoři = ''et al''.
| titul = The complete genome sequence of Escherichia coli K-12
| periodikum = Science
| odkaz na periodikum = Science
| rok = 1997
| číslo = 5331
| ročník = 277
| strany = 1453-62
| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9278503
| issn = 0036-8075
| jazyk = anglicky
}}</ref>
<br />
<sup>23</sup>U některých druhů [[archea|archeí]] a [[baktérie|baktérií]] je při biosyntéze enzymů pro metabolismus metanu normální ''Stop''-funkce kodónu UAG modifikována přítomností zvláštní genové sekvence mRNA, umožňující navázat pyrolysinovou tRNA a zabudovat do proteinu [[pyrolysin]] (Pyl/O).
<br />
<sup>34</sup>Při biosyntéze některých proteinů [[archea|archeí]], [[baktérie|baktérií]] i [[eukaryota|eukaryot]] je normální ''Stop''-funkce kodónu UGA díky zvláštní genové sekvenci mRNA ignorována, což umožňuje navázat selenosysteinovou tRNA vzniklou selenizací serinové tRNA a zabudovat do proteinu [[selenocystein]] (Sec/U).
<br />
<sup>5</sup>V plastidech [[obrněnky|obrněnek]] ''Lepidodinium chlorophorum'' byla objevena odchylka kódu, při které kodón AUA kóduje [[methionin]] (Met/M).<ref name="Lepidodinium" />
<sup>3</sup>Při biosyntéze některých proteinů [[archea|archeí]], [[baktérie|baktérií]] i [[eukaryota|eukaryot]] je normální ''Stop''-funkce kodónu UGA díky zvláštní genové sekvenci mRNA ignorována, což umožňuje navázat selenosysteinovou tRNA vzniklou selenizací serinové tRNA a zabudovat do proteinu [[selenocystein]] (Sec/U).
<br />
<sup>46</sup>VU plastidechrodu ''[[obrněnky|obrněnekMycoplasma]] ''Lepidodinium chlorophorum'' byla objevena odchylka kódu, při které kodón AUAUGA kóduje [[methionin]] (Met/M).<ref name="Lepidodinium" />
[[tryptofan]] (Trp/W) <br />
<sup>7</sup>U rodu ''[[Candida]]'' byla objevena odchylka kódu, při které kodón CUG kóduje [[serin]] (Ser/S)<ref name="CUGserin Candida"/>
 
[[Marshall W. Nirenberg]] a jeho [[laboratoř]] ([[National Institutes of Health]]) první provedla pokusy, které ukázaly na závislost mezi kodóny a [[aminokyseliny|aminokyselinami]], které kódují. [[Har Gobind Khorana]] rozšířil [[Marshall W. Nirenberg|Nirenbergovu]] práci a nalezl kódy pro [[aminokyseliny]], které [[Marshall W. Nirenberg|Nirenbergova]] metoda nalézt nemohla. Za svůj [[výzkum]] oba obdrželi [[Nobelova cena za fyziologii a medicínu|Nobelovu cenu]] ([[1968]])