Nové hranice způsobily hlavně v dopravě kritickou situaci. Kromě přerušení dopravy v oblasti západu Slovenska došlo k rozdělení železniční sítě hlavně ve východní části krajiny Slovenské, kde [[Košice]], regionálně nejvýznamnější město, připadly Maďarsku. Situace na Podkarpatské rusiRusi byla ještě horší, neboť Maďaři získali [[Užhorod]] i [[Mukačevo]]. Díky napjatým vztahům mezi Československem a Maďarskem byl provoz drážní dopravy komplikovaný a tak muselo být rozhodnuto o budování tratí nových.<ref>[http://www.rail.sk/skhist/stavba/arb.htm Článek o dopravních omezeních v souvislosti s výsledky arbitráže]</ref>. Kromě dopravních omezení však došlo i k ekonomickým a jiným ztrátám. Odstoupením Košic přišla krajina Slovenská o druhé největší město, rovněž ztratila zemědělsky cenné oblasti jižního Slovenska, hlavně tedy [[Žitný ostrov]]. Maďarské království sice podle textu smlouvy mělo zajistit československé vládě odstranění všech komplikací, které odtržení území způsobilo, vztahy však dobré nebyly a těžkosti přetrvávaly. Hranice stanovené Vídeňskou arbitráží přetrvávaly až do konce Druhé světové války a byly i jižní hranicí Slovenského státu před znovuobnovením Československa v hranicích předmnichovských.
