Micunari potkal Tojotomiho Hidejošiho když byl ještě mladý, a později jako daimjóa z Nagahamy. Když Hidejoši vedl tažení v Chūgoku regionu, Micunari asistoval svému pánovi v útocích na hrady jako Tottori a Takamatsu (v současné době Okayama).
PoKdyž Hideyoshise Hidejoši uchvátilichopil mocmoci, MitsunariMicunari se stalastal známouznámý jako talentovaný finanční manažer v důsledku své znalosti a dovednosti při výpočtu. Od 1585r. kupředu1585, byl správcem provincie Sakai, roli vzal spolu s jeho starším bratrem IshidaIšidou Masazumi,. Byl jmenován jedním z pěti bugyo nebo tophlavních správců HideyoshiHidejošiho vlády. Hideyoshi seHidejoši mu daimyoudělil ztitul Sawayamadaimjó OMIze Sawayamy (nyní součást Hikone) v provincii Omi , a půl milionu koku léno (nyní součást Hikone)léna. Sawayama Hrad Sawayama byl znám jako jeden z nejlepších-opevněnénejlépe opevněných hradyhradů v této době.
MitsunariMicunari byl vůdcem byrokraty v Hideyoshi vláda, a byl známý svou rigidní charakter. Přestože měl mnoho přátel, byl na špatné podmínky v některých daimyo, které jsou označovány jako dobré bojovníky, včetně Hideyoshi relativní Fukushima Masanori. Po Hideyoshi smrti, jejich konflikt zhoršil. Ústředním bodem jejich střetu byla otázka, zda by mohl být Tokugawa Ieyasu dovolávané jako zastáncem Toyotomi vlády, jejichž nominální pán byl dítě Toyotomi Hideyori.
V roce 1600, v bitvě u Sekigahara byla bojoval v důsledku tohoto politického konfliktu. Mitsunari podařilo při organizování vojsko vedené Mori Terumoto. Ale koalici po Tokugawa Ieyasu byl vyšší, a bitva vyústila v Mitsunari porážce.
