SARS-CoV-2: Porovnání verzí

Přidáno 358 bajtů ,  před 1 měsícem
(→‎Další varianty: omikron dle WHO)
| datum vydání = 2021-06-11
| datum přístupu = 2021-06-25
}}</ref>
}}</ref> V Česku se šíří hlavně v Praze a Jihočeském kraji.<ref>{{Citace elektronické monografie
 
| titul = Neviditelné šíření mutace delta v Praze. Prymula varuje před exponenciálním růstem případů Zdroj: https://www.lidovky.cz/domov/respiratory-zustanou-i-kvuli-delte-mutace-prochazi-ceskem-odbornici-vyzyvaji-k.A210624_201943_ln_domov_lihem
=== Varianta '''B.1.1.529 ([[Omikron|ο]] dle WHO) = omikron''' ===
| url = https://www.lidovky.cz/domov/respiratory-zustanou-i-kvuli-delte-mutace-prochazi-ceskem-odbornici-vyzyvaji-k.A210624_201943_ln_domov_lihem
V Jihoafrické republice byla vave školách a mezi mladými lidmi v listopadu 2021 zachycena nová varianta označená '''B.1.1.529 ([[Omikron|ο]] dle WHO)'''.<ref name="WHO-B.1.1.529">{{Citace elektronické monografie
| vydavatel = Lidovky.cz
| titul = Classification of Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern
| datum vydání = 2021-06-24
| url = https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern
| datum přístupu = 2021-06-25
| datum_přístupu = 2021-11-26
| datum_vydání = 2021-11-26
}}</ref> Vědce znepokojuje vysoký počet celkem 30 mutací [[Aminokyselina|aminokyselin]], které virus akumuloval ve spike proteinu. Ty zásadně změnily jeho prostorovou konformaci a mohou být odpovědné za odolnost vůči protilátkám. Počítačové simulace spike proteinu naznačují, že virus by mohl unikat i imunitě zprostředkované [[T-lymfocyt|T lymfocyty]].<ref>[https://www.nature.com/articles/d41586-021-03552-w Ewen Callaway, Heavily mutated coronavirus variant puts scientists on alert, Nature News, 25.11.2021]</ref> Nástup nové varianty B.1.1.529 je výrazně strmější než u předchozích variant beta (dominovala na přelomu let 2020/2021) a delta (dominantní od června 2021, kdy nahradila variantu alfa). Ve spike proteinu kumulovala veškeré mutace charakteristické pro vysoce infekční a nejnebezpečnější varianty alfa, beta a delta, označované [[Světová zdravotnická organizace|WHO]] jako tzv. VOC (Variants of concern). Kromě toho obsahuje nové mutace, jejichž význam dosud není zřejmý. Řada států už zrušila lety z afrických zemí, kde byla nová varianta viru potvrzena.<ref>[https://www.seznamzpravy.cz/clanek/koronavirus-prehled-co-uz-vime-o-nove-variante-ktera-strasi-svet-181820 Lukáš Marek, První data. Co už víme o nové variantě koronaviru, která straší svět, Seznam Zprávy 26.11.2021]</ref> V listopadu 2021 byla WHO zařazena mezi znepokojivé varianty (VOC).<ref>{{Citace elektronického periodika
| příjmení =
| jméno =
| titul = Omikron. WHO pojmenovala novou obávanou variantu koronaviru
| periodikum = ČT24
| vydavatel = Lidovky.czČeská televize
| url = https://ct24.ceskatelevize.cz/specialy/koronavirus/3405712-od-soboty-se-omezi-vstup-do-ceska-z-osmi-africkych-zemi-duvodem-je-nova
| datum vydání = 2021-0611-2426
| jazyk = cs
| datum přístupu = 2021-0611-2526
}}</ref><ref>{{Citace elektronického periodika
| titul = Omikron. WHO oficiálně zařadila novou variantu mezi znepokojivé - Seznam Zprávy
| periodikum = www.seznamzpravy.cz
| url = https://www.seznamzpravy.cz/clanek/zahranicni-omikron-who-oficialne-zaradila-novou-variantu-mezi-znepokojive-181934
| datum přístupu = 2021-11-26
}}</ref>
 
 
V Angole byly u cestujících z Tanzánie identifikovány tři vzorky nové varianty označené provizorně jako '''A.VOI.V2'''. Ta obsahuje tři delece a 11 substitucí aminokyselin ve spike proteinu (z celkových 31 substitucí). Tři substituce (R346K, T478R, E484K) zahrnují receptor-binding domain. Z dalších celkem 5 substitucí a tří delecí v N-terminální doméně spike proteinu se některé kumulují v tzv. antigenní superdoméně (Y144Δ, R246M, SYL247-249Δ a W258L) a poblíž místa S1/S2 štěpeného furinovou proteázou (H655Y a P681H).<ref>[https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.03.30.21254323v1.full-text Tulio de Oliveira et al., A novel variant of interest of SARS-CoV-2 with multiple spike mutations detected through travel surveillance in Africa, medRxiv, 4.4.2021]</ref>
 
V Jihoafrické republice byla va školách a mezi mladými lidmi v listopadu 2021 zachycena nová varianta označená '''B.1.1.529 ([[Omikron|ο]] dle WHO)'''.<ref name="WHO-B.1.1.529">{{Citace elektronické monografie
| titul = Classification of Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern
| url = https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern
| datum_vydání = 2021-11-26
| datum_přístupu = 2021-11-26
}}</ref> Vědce znepokojuje vysoký počet celkem 30 mutací aminokyselin, které virus akumuloval ve spike proteinu. Ty zásadně změnily jeho prostorovou konformaci a mohou být odpovědné za odolnost vůči protilátkám. Počítačové simulace spike proteinu naznačují, že virus by mohl unikat i imunitě zprostředkované T lymfocyty.<ref>[https://www.nature.com/articles/d41586-021-03552-w Ewen Callaway, Heavily mutated coronavirus variant puts scientists on alert, Nature News, 25.11.2021]</ref> Nástup nové varianty B.1.1.529 je výrazně strmější než u předchozích variant beta (dominovala na přelomu let 2020/2021) a delta (dominantní od června 2021, kdy nahradila variantu alfa). Ve spike proteinu kumulovala veškeré mutace charakteristické pro vysoce infekční a nejnebezpečnější varianty alfa, beta a delta, označované WHO jako tzv. VOC (Variants of concern). Kromě toho obsahuje nové mutace, jejichž význam dosud není zřejmý. Řada států už zrušila lety z afrických zemí, kde byla nová varianta viru potvrzena.<ref>[https://www.seznamzpravy.cz/clanek/koronavirus-prehled-co-uz-vime-o-nove-variante-ktera-strasi-svet-181820 Lukáš Marek, První data. Co už víme o nové variantě koronaviru, která straší svět, Seznam Zprávy 26.11.2021]</ref>
 
=== Konkrétní záměny aminokyselin u nejvýznamnějších mutací ===