National Center for Biotechnology Information: Porovnání verzí

Smazaný obsah Přidaný obsah
Úvod doplnění
m Robot: doplnění referencí; kosmetické úpravy
Řádek 10:
}}</ref>
 
Úlohou NCBI je ukládání, zpracování a anotace vědeckých dat, zejména z oblastí molekulární biologie, medicíny, biochemie a genetiky. Instituce se také aktivně podílí na vyvíjení nástrojů pro analýzu bioinformatických dat. V databázích NCBI se soustřeďují výsledky [[sekvenování DNA|sekvenací DNA]] ([[GenBank]]), vědecké články ([[PubMed Central]], [[PubMed]]), informace o genech (RefSeq, Gene), anotace sekvencí makromolekul (Protein, Nucleotide) nebo mapovací data již osekvenovaných genomů (Genome). Služby NCBI jsou volně dostupné, podobně jako u bioinformatických institutů jako European Bioinformatics Institute (EBI), Swiss Institute of Bioinformatics (SIB) nebo DNA Data Bank of Japan (DDBJ).
 
Pro tvorbu svých databází využívá NCBI data ukládané vědeckou komunitou manuálně přímo do NCBI nebo získávané jejich výměnou se spřízněnými institucemi jako např. DDBJ, European Molecular Biology Laboratory (EMBL), Protein Information Resource (PIR) nebo vydavateli vědecké literatury. Minoritní podíl na zisku dat tvoří také cílené správcovské aktivity NCBI, data aktivně vkládaná zaměstnanci centra. Množství uložených dat v NCBI roste exponenciálně - v roce 2020 bylo ve všech databázích NCBI celkově uložených přes 3 miliardy záznamů <ref>{{Citace periodika
Řádek 96:
| url = http://academic.oup.com/nar/article/41/D1/D36/1068219/GenBank
| datum přístupu = 2021-04-24
}}</ref>
 
== PubMed ==
Řádek 104:
| url = https://www.nlm.nih.gov/bsd/licensee/2020_stats/2020_LO.html
| datum přístupu = 2021-05-03
}}</ref> Rozhraní PubMed umožňuje komplexní prohledávání vědeckých prací a poskytuje externí odkazy na plné texty a stránky publikací. Vybrané volné publikace jsou taky dostupné v archivu PubMed Central (PMC), který obsahuje přes 6 milionů plných textů zejména z biomedicinské a biologické oblasti výzkumu. PubMed je jako databáze veřejnosti přístupna od roku 1996. Reference v PubMed jsou automaticky převzaté prostřednictvím MEDLINE z vybraných časopisů, jež jsou průběžně aktualizovaná komisí Literature Selection Technical Review Committee (LSTRC).
 
== Reference Sequence (RefSeq) ==
Databáze RefSeq shromažďuje sekvence genomových DNA, jejich transkriptů a proteinů za účelem tvorby rozsáhlé neredundantní sbírky integrující sekvenční, genetické a funkční informace v jednom záznamu. [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21091/] Záznamy v RefSeq vycházejí z archivu INSDC, jejíž součástí je i GenBank, převzatá data jsou automaticky anotovaná a postupně validovaná správci databáze. Data do RefSeq jsou v menší míře získávané také v rámci spolupráce s projekty jako Saccharomyces Genome Database nebo The Arabidopsis Information Resource. Unikátní identifikační číslo jednotlivých záznamů je dynamické a liší se v závislosti na typu sekvence a množství validovaných údajů o dané sekvenci.
 
== Gene ==
Řádek 129:
| url = https://academic.oup.com/nar/article-lookup/doi/10.1093/nar/gkq1237
| datum přístupu = 2021-04-24
}}</ref>
 
== Genome ==
Řádek 140:
 
{{překlad|en|National Center for Biotechnology Information|254042918}}
<references />
{{Pahýl}}
{{Autoritní data}}