SARS-CoV-2: Porovnání verzí

Přidáno 2 183 bajtů ,  před 1 měsícem
(→‎Šíření viru: složky UV)
značka: školní IP
 
Kmen P.1 je podle lékařů až 2,2krát nakažlivější než předchozí verze SARS-CoV-2 a je u něj až o 61 procent vyšší riziko, že se lidé nakazí opakovaně. V Brazílii byl v březnu 2021 odpovědný za většinu nakažených a mezitím se stačil rozšířit do dalších 20 zemí. Zhruba třicet procent lidí, kteří po nákaze P.1 umírají, je mladší 60 let. Brazílie neprovádí v potřebném rozsahu sekvenaci vzorků viru, ale existují doklady že začala mutovat i samotná varianta P.1 a vykazuje změny, které by ji mohly učinit ještě nakažlivější. Vědci uvádějí, že podle předběžných studií jsou existující vakcíny účinné i proti kmeni P.1.<ref>[https://ct24.ceskatelevize.cz/veda/3290679-v-brazilii-radi-varianta-covidu-19-ktera-ohrozuje-cely-svet V Brazílii řádí varianta covidu-19, která ohrožuje celý svět, ČT24, 30.3.2021]</ref>
==== Varianta B.1.525 ====
 
Tato varianta, označovaná též VUI-21FEB-03 a považovaná spolu s B.1.526 za variantu hodnou zájmu (variant of interest),<ref>[https://www.nytimes.com/interactive/2021/health/coronavirus-variant-tracker.html Jonathan Corum and Carl Zimmer, Coronavirus Variants and Mutations, The New York Times, 22.3.2021]</ref> je v tisku uváděna jako Nigerijská. Původně byla zachycena v prosinci 2020 ve Velké Británii (UK1188) a v Nigérii, kde se později stala převažující formou SARS-CoV-2. Vyskytuje se ve 36 zemích, včetně [[Polsko|Polska]], [[Německo|Německa]] a [[Rakousko|Rakouska]].<ref>[https://cov-lineages.org/global_report_B.1.525.html Global report investigating novel coronavirus haplotypes: B.1.525, Fig. 5, 8.4.2021]</ref> Nese stejnou záměnu E484K a deleci ΔH69/ΔV70 jako ostatní infekční formy viru, ale obsahuje důležitou novou mutaci F888L v S2 doméně spike proteinu, která zvyšuje rezistenci vůči protilátkám a mutaci Q677H, která stabilizuje dimer S1 a S2 spike proteinu. Varianta B.1.525 má řadu dalších mutací ve strukturálních transmembránových proteinech E: (l21F), M:(I82 F), a N:(A12G) a (T208I) a v proteinovém komplexu virové RNA dependentní RNA polymerázy: NSP3: (T1189I), NSP6: (delece tří aminokyselin 106- 108), a NSP12: (P323F). Tyto mutace mohou přispívat k vyšší účinnosti replikace.<ref>[https://www.forbes.com/sites/williamhaseltine/2021/02/24/new-nigerian-variant-continues-the-trend-of-dangerous-strains-threatening-covid-19-progress/ William A. Haseltine, A New Covid-19 Variant From Nigeria Raises Increased Concerns For Containment And Vaccination, Forbes, 24.2.2021]</ref>
==== Další varianty ====
Varianta 20A.EU1 se objevila počátkem léta ve Španělsku a turisté ji následně rozšířili po celé Evropě.<ref>{{Citace elektronického periodika
* '''L452R''' záměna [[leucin]]u za [[arginin]] v pozici 452 spike-proteinu. Charakteristická pro variantu viru B.1.429 dominantní v Kalifornii. Je zřejmě odpovědná za odolnost vůči protilátkám.
* '''S477N''' záměna [[serin]]u za [[asparagin]] v pozici 477 spike-proteinu. Odpovídá za vyšší vazebnou afinitu k receptoru ACE2.
* '''F888L''' záměna [[fenylalanin]]u za [[leucin]] v S2 subjednotce spike proteinu sousedící s membránou. Podobná záměna v pozici 870 se objevila u pacienta s přetrvávajícím onemocněním covid-19 a je patrně odpovědná za rezistenci vůči protilátkám.
* '''Q677H''' záměna [[glutamin]]u za [[histidin]]. Zvyšuje stabilitu komplexu S1 a S2 podjednotek a patrně tak podporuje otevřenou konformaci vazebné domény spike proteinu a tím zvyšuje infekčnost viru.
 
=== Rekombinantní mutace ===