Pekka Haavisto vystudovalmaturoval politologiiv Munkkivuori na škole, jejímž ředitelem byl jeho otec<ref>{{Citace elektronické monografie |titul= |url=http://www.yksityiskoulut.fi/yksityiskoulujenmatrikkeli/munkkivuoren.htm |datum přístupu=2012-02-05 |datum archivace=|vydavatel=Salminen, Jari ja Yksityiskoulujen Liitto }}</ref>, a kde učila i jeho matka. Po necelém roce studií politologie na [[Helsinská univerzita|Helsinské univerzitě]] školu opustil.<ref name="CV">{{Citace elektronické monografie | url archivu = https://web.archive.org/web/20120418113742/http://haavisto2012.fi/kuka-pekka-haavisto/ | titul=Kuka Pekka Haavisto? | url=http://haavisto2012.fi/kuka-pekka-haavisto/ | datum archivace=2012-04-18 |datum přístupu=2012-01-13}}</ref> Od roku [[2002]] žije v [[registrované partnerství|registrovaném partnerství]] s Antoniem Florem, který původem pochází z [[Ekvádor]]u.<ref name="haavisto2012"/>
