Vyšetřování zjistilo, že hlavní příčinou nehody byl software dodaný společností [[Lockheed Martin]], který počítal celkový impuls dodaný tryskami sondy v imperiálních jednotkách (lb·s), zatímco software pro výpočet trajektorie dodaný [[NASA]] očekával tytotato data v jednotkách SI (N·s). Vzhledem k převodnímu faktoru mezi lbs a Ns, který je 4,45, byla takto vypočítaná trajektorie chybná. Sonda se tak namísto plánovaného nejnižšího bodu oběžné dráhy 226 km měla dostat do vzdálenosti pouhých 57 km od povrchu planety. Atmosféra (ač řídká) ji spálila už někde mezi 80 až 90 km od povrchu.<ref>{{Citace elektronické monografie|příjmení = |jméno = |titul = "Mars Climate Orbiter Mishap Investigation Board Phase I Report"|url = http://sunnyday.mit.edu/accidents/MCO_report.pdf|vydavatel = NASA|místo = |datum vydání = 10. listopad 1999}}</ref>