S fotbalem začal v pětiosmdesátipěti letech, kdy začal hrát s týmem Grandoli, kde trénoval jeho otec. V roce [[1995]] začal působit v [[CA Newell's Old Boys]]. V jedenácti mu byl diagnostikován nedostatek růstových hormonů.<ref>{{Citace elektronického periodika |titul={title} |url=http://worldsoccer.about.com/od/soccerprofiles/p/lionelmessi.htm |datum přístupu=2007-06-25 |url archivu=https://web.archive.org/web/20070525045207/http://worldsoccer.about.com/od/soccerprofiles/p/lionelmessi.htm |datum archivace=2007-05-25 |nedostupné=ano }}</ref> Tehdy o něj projevil zájem [[CA River Plate]], ale Messiho rodiče tehdy neměli peníze, aby platili synovu léčbu. Carles Rexach, tehdejší ředitel týmu FC Barcelona, nabídl Messimu kontrakt včetně zaplacení celé léčby a přestěhování do [[Španělsko|Španělska]].
