Oprava DNA: Porovnání verzí
Smazaný obsah Přidaný obsah
mBez shrnutí editace |
m Překlad části pod přímý zvrat poškození. |
||
Řádek 37:
''Poškození na DNA lze rozdělit na 2 hlavní typy:''
# Endogenní poškození jako je útok (ROS) reaktivními molekulami s kyslíkem pochazejících z obecných produktů metabolismu (spontánní mutace), především proces oxidativní deaminace (
# Exogenní poškození způsobené útoky z vnějšího okolí.
[[Soubor:Production of mitochondrial ROS, mitochondrial ROS.png|náhled|vpravo|Produkce ROS v [[Mitochondrie|mitochondriích]] u matrix a mezimembránového prostoru.]]
Řádek 90:
=== Přímý zvrat poškození ===
Do této skupiny opravných mechanismů patří například [[fotolyáza]], [[enzym]], jenž je schopen opravit chyby způsobené paprsky [[ultrafialové záření|ultrafialového (UV) záření]] (vlnové délky 300 - 500 nm). UV záření je schopné spojit vazbou
V podstatě se tímto buňka snaží o opačný průběh události poškození, tím že jeden ze tří typů průběhu tohoto narušení chemicky obrátí. Tyto mechanismy nevyžadují předlohu, protože nastalé poškození, které se snaží zvrátit se nachází jen v jedné z bází. Takovéto opravy jsou velmi konkrétní a není u nich tedy, potřeba rozložení [[Fosfodiesterová vazba|fosfodiesterové vazby]]. U lidí probíhají opravy (NER) v reakci na vystavení UV záření.
# První poškození je způsobené UV zářením (NER).
# Druhým typem je zvrat poškození způsobené metylací báze guaninu proteinem MGMT.
# Třetím typem zvratu v buňce určitého poškození DNA je způsobené konkrétní [[metylace|metylací]] báze cytosinu a adeninu
Opravy jiných typů poškození DNA je schopná také [[06-methyl-guanin-DNA-methyltransferáza|0<sup>6</sup>-methyl-guanin-DNA-methyltransferáza]]. Tento protein je schopen opravit báze [[06-methylguanin|0<sup>6</sup>-methylguanin]] a [[06-ethylguanin|0<sup>6</sup>-ethylguanin]], které vznikají [[alkylace|alkylací]] [[guanin]]u např. po jeho vystavení [[alkylační činidlo|alkylačním činidlům]], jako je [[MNNG]].<ref name="voet" />
=== Vyštěpovací oprava ===
[[Soubor:Uracil base glycosidase.jpg|
Vyštěpovací či také [[ekcize|ekcizní]] typ oprav (z angl. ''excision repair'') představuje další možnost, jak opravit poškození ultrafialovým světlem. V tomto případě je pomocí speciálních enzymů (jistých [[endonukleáza|endonukleáz]]; konkrétně [[UvrABC–endonukleáza|UvrABC–endonukleázou]]) vyštěpen z molekuly DNA [[oligonukleotid]] (jednovláknový řetězec dlouhý několik [[nukleotid]]ů) obsahující [[pyrimidin]]ové [[dimer]]y (cytosinové či thyminové). Následně jsou (u bakterií zřejmě [[DNA polymeráza I|DNA polymerázou I]]) syntetizovány předtím odstraněné nukleotidy. Poruchy v těchto ekcizních mechanismech mohou vést k onemocnění [[xeroderma pigmentosum]].<ref name="voet" />
Řádek 101 ⟶ 105:
=== Rekombinační oprava ===
[[File:DNA Repair.jpg|náhled|200px|[[DNA ligáza|DNA ligáza]] je enzym, který dokáže spojit narušené nukleotidy dohromady jako katalyzátor internukleotidu, ([[Fosfodiesterová vazba|fosfodiesterové vazby]]) vazby mezi nukleotidy [[Deoxyribóza|deoxyribózy]] a [[Fosforečnany|fosfátovou páteří]]. Vyobrazení je DNA ligáza opravující poškození na chromozomech a blíže, tedy samotné deoxyribonukleové kyseliny.]]
[[Soubor:PDB 1x9n EBI.jpg|náhled|vpravo|Schéma DNA ligázy z PDB.]]
Rekombinační (protože připomíná [[crossing-over|rekombinaci]]) nebo také postreplikační typ oprav spočívá v tom, že pyrimidinové dimery vzniklé účinkem UV záření, jako je dimer thyminový, působí vážné potíže při [[replikace DNA|replikaci DNA]]. Pokud DNA polymeráza replikující genom dojde na místo, kde je např. thyminový dimer, přeruší zde polymeraci a toto místo přeskočí. Taková mezera však musí být zacelena, a to nejlépe podle vzoru v podobě druhého rodičovského vlákna, které již mezi tím bylo replikováno. U ''[[Escherichia coli|E. coli]]'' toto zajišťuje nukleáza [[RecA]], která vystřihne odpovídající část DNA z rodičovského vlákna a přesune ho na druhou část [[replikační vidlice]], kde se řetězec zabuduje do dceřiného vlákna.<ref name="voet" />
=== SOS odpověď ===
Řádek 108 ⟶ 114:
== Související články ==
* [[Chromozom|chromozomy]]
* [[Karyotyp]]
* [[DNA]]
* [[RNA]]
* [[Enzym]]
* [[Bílkovina]]
* [[genetické inženýrství]]
* [[genová terapie]]
| |||