Oprava DNA: Porovnání verzí

Přidáno 3 209 bajtů ,  před 1 rokem
m
bez shrnutí editace
m (Přehození schémat v první části.)
m
** mezi DNA a okolními [[Bílkovina|proteiny]] ([[histon]]y atp.)
 
'''<big>''Zdroje způsobující poškození:''</big>'''
 
''Poškození na DNA lze rozdělit na 2 hlavní typy:''
 
# Endogenní poškození jako je útok (ROS) reaktivními molekulami s kyslíkem pochazejících z obecných produktů metabolismu (spontánní mutace), především proces oxidativní deaminace (Včetně chyb při [[Replikace DNA|replikaci]]).
# Exogenní poškození způsobené útoky z vnějšího okolí.
 
* Ultrafialové záření (UV 200 - 400 nm) radiace z Slunce.
 
* Ostatní typy radiace (frekvencí), včetně rentgenového záření, gama záření.
* [[Hydrolýza]], tepelná nerovnováha
* Některé [[Rostliny|rostlinné]] [[Toxin|toxiny]]
 
* Chemické látky způsobující mutace, obzvláště [[Aromaticita|aromatické]] sloučeniny, které se dokáží vměstnant do struktury DNA a tím jí lehce poškozují.
* Účinky [[Virus|virusu]].
 
'''<big>''Komkrétní typy narušení:''</big>'''
 
''Je několik typů poškození DNA vzhledem k endogenním procesům týkajících se buňky:''
 
# Oxidace bází (8-oxo-7,8-dihydroguanin (8-oxoG)) a narušení generace vláken DNA přerušním reaktivními molekulami s kyslíkem.
# Alkylace bází (obvykle metylace) jako je formace 7-metylguanosine, 1-metyladenin, 6-O-Metylguanin.
# Hydrolýza bází - depyrimidinace, depurinace, deaminace.
# Tzv. ''"bulky adduct formation"''
# Překřížení bází, vzhledem k chybám při DNA replikaci. (špatná báze DNA je sešita do nepatřičného místa v nově se formujícím vlákně DNA, nebo je přeskočena báze, chybně vložena do struktury vlákna.
# Monoaditivní poškození způsobené změnou jedné dusíkaté báze DNA.
# Diaditivní poškození.
 
''Typy poškození exogenními vlivy:''
 
# UV - B záření
# UV - A záření
 
Poškození UV zářením, alkylace/[[Methylace DNA|metylace]] , narušení rentgenovým zářením a oxidativní poškození jsou příklady indukované, kumulativní škody. Spontanní poškození zahrnuje ztrátu báze, deaminaci, svráštěné prstencové formace sacharidů, tautomerní posun.
 
== Oprava DNA během replikace ==
[[Replikace DNA]], tedy kopírování DNA, které musí předcházet [[buněčné dělení|buněčnému dělení]], je choulostivý proces, při němž je vysoký potenciál vzniku chyb v genetickémgenetické informaci vycházejícího vlákna materiálu(repliky). To, že je nakonec tato chybovost pouze jedna chyba na miliardu bází (1/10<sup>9</sup>),<ref name="essential">{{citace monografie| příjmení=Alberts | jméno=Bruce| spoluautoři = et al| vydání = 2 | titul = Essential Cell Biology | vydavatel = Garland Science| rok=2004 | místo=New York}}</ref> je zásluhou kontrolních mechanismů během replikace i po ní.
 
=== Proofreading ===
 
== Oprava DNA mimo období replikace ==
Jednotlivé buňky nemohou správně fungovat při narušené DNA a tím pádem kompromitované integrity a dostupnosti informací genomu (i když buňky mohou být funkční i při poškození, nebo přímo postrádání genů, které nejsou eseciálně důležité). Podle typu poškození ohrožujícího dvoušrobovici DNA, se evolučně vyvinuly opravné mechanismy na rekonstrukci a obnovení ztracených informací. Pokud je to možné, buňky použijí nemodifikované komplementární vlákna DNA, nebo sousední chromatidu jako vzor k napravení škod originální informace. Bez přístupu k předloze, buňky využijí metody náchylné k chybám a to, translační syntézy jako poslední zásobu snahy o nápravu. Jakékoliv poškození DNA, narušuje originální prostorovou konfiguraci vlákna šroubovice, což buňka dokáže detekovat. Jakmile je lokalizováno poškození, konkrétní molekuly na opravu DNA se přichytí v blízkosti místa poškození. Tím napomáhají lokalizovat a přichytit se k místu dalším molekulám, s kterým dohromady tvoří komplex, který teprve aktivně opravuje poškozené místo v konfiguraci.
 
Každá učebnice pojímá klasifikaci opravných mechanismů jinak, tento je založen na knize Biochemistry od Donalda a Judith Voetových.<ref name="voet">{{citace monografie| příjmení = Voet | jméno=Donald |příjmení2= Voet |jméno2=Judith | titul = Biochemie | vydání = 1. | vydavatel=Victoria Publishing| místo=Praha| rok= 1995| isbn= 80-85605-44-9}}</ref>
 
569

editací