Klasifikace virů: Porovnání verzí

Smazaný obsah Přidaný obsah
+ link.
HypoBOT (diskuse | příspěvky)
m Přidání šablony Commonscat dle ŽOPP z 28. 7. 2016; kosmetické úpravy
Řádek 3:
Nejstarší klasifikační systémy virů vycházely z klasifikace napadaných organismů. Byla to například '''Holmesova klasifikace''' z r. 1948, aplikující linnéovskou [[Binominální nomenklatura|binominální nomenklaturu]] a členící viry na fágy (napadající [[bakterie]]), fytofágy (napadající [[rostliny]]) a zoofágy (napadající [[živočichové|živočichy]]).
 
Později se viry začaly klasifikovat podle strukturních fyzikálních a chemických vlastností, jako je nosič genetické informace ([[RNA]] nebo [[DNA]]), velikost, tvar a symetrie [[kapsid]]u apod. K takovým klasifikačním systémům patří např. hierarchická '''[[Klasifikace virů#Systém LHT|klasifikace LHT]]''' z roku 1962, dnes již zastaralá.
 
V současnosti se stále používá zjednodušená klasifikace podle nosiče genetické informace a způsobu jejího přepisu, tak zvaná '''[[Klasifikace virů#Baltimorova klasifikace|Baltimorova klasifikace]]''' z r. 1971.
Řádek 9:
Aktuální snahou biologických klasifikačních systémů je přirozenost z hlediska fylogenetické příbuznosti. O tu se snaží podrobný, každoročně aktualizovaný '''[[Klasifikace virů#Systém ICTV|systém Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV)]]'''.
 
Vzhledem k tomu, že není známo příliš typů subvirových činitelů ([[viroid]]y a virové satelity včetně [[virofág]]ů a [[virusoid]]ů), neexistuje pro ně zpravidla zvláštní systém a klasifikují se pouze podle nosiče genetické informace, případně i její velikosti. Výjimkou je '''[[Klasifikace virů#Klasifikace viroidů|klasifikační systém viroidů podle Florese]]''' z roku 1998, používající čeledi a rody. Také systém ICTV zahrnuje i viroidy (je do něj včleněna Floresova klasifikace) a nově (od r. 2015) vybrané satelity (i [[virofág]]y) se snahou respektovat jejich pravděpodobnou fylogenetickou příbuznost k jiným virům.
== Systém ICTV ==
Mezinárodní komise pro klasifikaci virů (International Committee on Taxonomy of Viruses - ICTV) klasifikuje viry podobně jako buněčné organismy do řádů, čeledí a rodů. Snahou je přitom respektovat fylogenetickou příbuznost, tedy na základě genetické informace sdružovat [[taxon]]y dané úrovně do skupin, u kterých lze předpokládat společného předka. Nejistota u fylogenetické příbuznosti však vede k existenci mnoha nezařazených taxonů.
 
Standardními příponami jsou:
* pro řád: ''-virales''
* pro čeleď: ''-viridae'' (''-virodae'' v případě viroidů)
* pro podčeleď: ''-virinae''
* pro rod: ''-virus''
Podle názvoslovného kódu ICTV se názvy všech těchto taxonů píší stejně jako jména druhů kurzívou.<ref>The International Code of Virus Classification and Nomenclature. Kapitola IX, odstavec 3.36. ICTV, únor 2013. [http://www.ictvonline.org/codeOfVirusClassification.asp Dostupné online] (anglicky)</ref>
 
Řádek 27:
V následujícím přehledu jsou navíc pro úplnost uvedeny i dosud neuznané navrhované taxony, vždy označené závorkou "(neuznaný/á)". Návrh plyne z uvedené reference (zpravidla vědeckého periodika nebo webové složky ICTV s návrhy, u kterých dosud neskončil proces k jejich uznání.<ref>International Committee on Taxonomy of Viruses: [http://talk.ictvonline.org/files/proposals/default.aspx Pending Proposals]</ref>).
 
=== Caudovirales ===
* '''Řád: ''Caudovirales''''' (3 čeledi)
** Čeleď: ''Myoviridae'' (5 podčeledí, 28 nezařazených rodů)
**:* Nezařazený rod: ''Agatevirus''
**:* Nezařazený rod: ''Ap22virus''
**:* Nezařazený rod: ''B4virus''
**:* Nezařazený rod: ''Bastillevirus''
**:* Nezařazený rod: ''Bc431virus ''
**:* Nezařazený rod: ''Bcep78virus''
**:* Nezařazený rod: ''Bcepmuvirus''
**:* Nezařazený rod: ''Biquartavirus''
**:* Nezařazený rod: ''Bxz1virus''
**:* Nezařazený rod: ''Cd119virus ''
**:* Nezařazený rod: ''Cp51virus''
**:* Nezařazený rod: ''Cvm10virus ''
**:* Nezařazený rod: ''Felixo1virus''
**:* Nezařazený rod: ''Hapunavirus''
**:* Nezařazený rod: ''Kpp10virus ''
**:* Nezařazený rod: ''Muvirus''
**:* Nezařazený rod: ''Myohalovirus''
**:* Nezařazený rod: ''Nit1virus''
**:* Nezařazený rod: ''P1virus''
**:* Nezařazený rod: ''Pakpunavirus''
**:* Nezařazený rod: ''Pbunavirus ''
**:* Nezařazený rod: ''Phikzvirus ''
**:* Nezařazený rod: ''Rheph4virus''
**:* Nezařazený rod: ''Secunda5virus''
**:* Nezařazený rod: ''Tg1virus''
**:* Nezařazený rod: ''Vhmlvirus''
**:* Nezařazený rod: ''Vi1virus''
**:* Nezařazený rod: ''Wphvirus''
*** Podčeleď: ''Eucampyvirinae'' (2 rody)
**** Rod: ''Cp220virus''
**** Rod: ''Cp8virus''
*** Podčeleď: ''Peduovirinae'' (2 rody)
**** Rod: ''Hp1virus''
**** Rod: ''P2virus''
*** Podčeleď: ''Spounavirinae'' (5 rodů)
**** Rod: ''Kayvirus''
**** Rod: ''P100virus''
**** Rod: ''Silviavirus''
**** Rod: ''Spo1virus''
**** Rod: ''Twortvirus''
*** Podčeleď: ''Tevenvirinae'' (8 rodů)
**** Rod: ''Cc31virus''
**** Rod: ''Js98virus''
**** Rod: ''Rb49virus''
**** Rod: ''Rb69virus''
**** Rod: ''S16virus''
**** Rod: ''Schizot4virus''
**** Rod: ''Sp18virus''
**** Rod: ''T4virus''
*** Podčeleď: ''Vequintavirinae'' (3 rody)
**** Rod: ''Cr3virus''
**** Rod: ''Se1virus''
**** Rod: ''V5virus''
** Čeleď: ''Podoviridae'' (2 podčeledi, 14 nezařazených rodů)
**:* Nezařazený rod: ''Bcep22likevirus''
**:* Nezařazený rod: ''Bpp1virus''
**:* Nezařazený rod: ''Cba41virus''
**:* Nezařazený rod: ''Epsilon15virus''
**:* Nezařazený rod: ''F116virus''
**:* Nezařazený rod: ''G7cvirus''
**:* Nezařazený rod: ''Lit1virus''
**:* Nezařazený rod: ''Luz24virus''
**:* Nezařazený rod: ''N4virus''
**:* Nezařazený rod: ''Nonanavirus''
**:* Nezařazený rod: ''P22virus''
**:* Nezařazený rod: ''Pagevirus''
**:* Nezařazený rod: ''Phieco32virus''
**:* Nezařazený rod: ''Vp5virus''
*** Podčeleď: ''Autographivirinae'' (4 rody)
**** Rod: ''Kp34virus''
**** Rod: ''Phikmvvirus''
**** Rod: ''Sp6virus''
**** Rod: ''T7virus''
*** Podčeleď: ''Picovirinae'' (2 rody)
**** Rod: ''P68virus''
**** Rod: ''Phi29virus''
** Čeleď: ''Siphoviridae'' (2 podčeledi, 57 nezařazených rodů, 3 neuznané nezařazené rody)
**:* Nezařazený rod: ''Andromedavirus''
**:* Nezařazený rod: ''Barnyardvirus''
**:* Nezařazený rod: ''Bignuzvirus''
**:* Nezařazený rod: ''Biseptimavirus''
**:* Nezařazený rod: ''Bronvirus''
**:* Nezařazený rod: ''C2virus''
**:* Nezařazený rod: ''C5virus''
**:* Nezařazený rod: ''Cba181virus''
**:* Nezařazený rod: ''Cbastvirus''
**:* Nezařazený rod: ''Cecivirus''
**:* Nezařazený rod: ''Charlievirus''
**:* Nezařazený rod: ''Che8virus''
**:* Nezařazený rod: ''Che9cvirus''
**:* Nezařazený rod: ''Chivirus''
**:* Nezařazený rod: ''Cjw1virus''
**:* Nezařazený rod: ''Corndogvirus''
**:* Nezařazený rod: ''D3112virus''
**:* Nezařazený rod: ''D3virus''
**:* Nezařazený rod: ''E125virus''
**:* Nezařazený rod: ''Ff47virus''
**:* Nezařazený rod: ''Hk578virus''
**:* Nezařazený rod: ''L5virus''
**:* Nezařazený rod: ''Lambdavirus''
**:* Nezařazený rod: ''Liefievirus''
**:* Nezařazený rod: ''N15virus''
**:* Nezařazený rod: ''Nonagvirus''
**:* Nezařazený rod: ''Omegavirus''
**:* Nezařazený rod: ''P23virus''
**:* Nezařazený rod: ''P70virus''
**:* Nezařazený rod: ''Pbi1virus''
**:* Nezařazený rod: ''Pg1virus''
**:* Nezařazený rod: ''Phic31virus''
**:* Nezařazený rod: ''Phicbkvirus''
**:* Nezařazený rod: ''Phietavirus''
**:* Nezařazený rod: ''Phifelvirus''
**:* Nezařazený rod: ''Phijl1virus''
**:* Nezařazený rod: ''Psavirus''
**:* Nezařazený rod: ''Psimunavirus''
**:* Nezařazený rod: ''Reyvirus''
**:* Nezařazený rod: ''Sap6virus''
**:* Nezařazený rod: ''Septima3virus''
**:* Nezařazený rod: ''Seuratvirus''
**:* Nezařazený rod: ''Sextaecvirus''
**:* Nezařazený rod: ''Sfi11virus''
**:* Nezařazený rod: ''Sfi21dt1virus''
**:* Nezařazený rod: ''Sitaravirus''
**:* Nezařazený rod: ''Sk1virus''
**:* Nezařazený rod: ''Slashvirus''
**:* Nezařazený rod: ''Spbetavirus''
**:* Nezařazený rod: ''Ssp2virus''
**:* Nezařazený rod: ''T5virus''
**:* Nezařazený rod: ''Tm4virus''
**:* Nezařazený rod: ''Tp21virus''
**:* Nezařazený rod: ''Triavirus''
**:* Nezařazený rod: ''Wbetavirus''
**:* Nezařazený rod: ''Xp10virus''
**:* Nezařazený rod: ''Yuavirus''
**:* Nezařazený rod (neuznaný): ''Lebronvirus''<ref name="Adriaenssens_2015">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Adriaenssens
| jméno = Evelien M.
Řádek 189:
| jazyk = anglicky
}}</ref>
**:* Nezařazený rod (neuznaný): ''Likavirus''<ref name="Adriaenssens_2015" />
**:* Nezařazený rod (neuznaný): ''R4virus''<ref name="Adriaenssens_2015" />
*** Podčeleď: ''Guernseyvirinae'' (3 rody)
**** Rod: ''Jerseyvirus''
**** Rod: ''K1gvirus''
**** Rod: ''Sp31virus''
*** Podčeleď: ''Tunavirinae'' (5 rodů, 1 neuznaný rod)
**** Rod: ''Kp36virus''
**** Rod: ''Rogue1virus''
**** Rod: ''Rtpvirus''
**** Rod: ''T1virus''
**** Rod: ''Tlsvirus''
**** Rod (neuznaný): ''Jk06virus''<ref name="Niu 2014">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Niu
| jméno = Yan D.
Řádek 227:
}}</ref>
 
=== Herpesvirales ===
* '''Řád: ''[[Herpetické viry|Herpesvirales]]''''' (3 čeledi)
** Čeleď: ''Alloherpesviridae'' (4 rody)
**:* Rod: ''Batrachovirus''
**:* Rod: ''Cyprinivirus''
**:* Rod: ''Ictalurivirus''
**:* Rod: ''Salmonivirus''
** Čeleď: ''Herpesviridae'' (3 podčeledi)
*** Podčeleď: ''[[Alphaherpesvirinae]]'' (5 rodů)
**** Rod: ''[[Iltovirus]]''
**** Rod: ''[[Mardivirus]]''
**** Rod: ''Scutavirus''
**** Rod: ''[[Herpes simplex virus|Simplexvirus]]''
**** Rod: ''[[Varicellovirus]]''
*** Podčeleď: ''Betaherpesvirinae'' (4 rody)
**** Rod: ''[[Cytomegalovirus]]''
**** Rod: ''Muromegalovirus''
**** Rod: ''Proboscivirus''
**** Rod: ''[[Roseolovirus]]''
*** Podčeleď: ''Gammaherpesvirinae'' (4 rody)
**** Rod: ''[[Virus Epstein-Barrové|Lymphocryptovirus]]''
**** Rod: ''Macavirus''
**** Rod: ''Percavirus''
**** Rod: ''Rhadinovirus''
** Čeleď: ''Malacoherpesviridae'' (2 rody)
**:* Rod: ''Aurivirus''
**:* Rod: ''Ostreavirus''
 
=== Ligamenvirales ===
* '''Řád: ''Ligamenvirales''''' (2 čeledi)
** Čeleď: ''Lipothrixviridae'' (4 rody)
**:* Rod: ''Alphalipothrixvirus''
**:* Rod: ''Betalipothrixvirus''
**:* Rod: ''Deltalipothrixvirus''
**:* Rod: ''Gammalipothrixvirus''
** Čeleď: ''Rudiviridae'' (1 rod)
**:* Rod: ''Rudivirus''
 
=== Mononegavirales ===
* '''Řád: ''[[:Kategorie:Mononegavirales|Mononegavirales]]''''' (8 čeledí, 5 nezařazených rodů)
*::* Nezařazený rod: ''Anphevirus''
*::* Nezařazený rod: ''Arlivirus''
*::* Nezařazený rod: ''Chengtivirus''
*::* Nezařazený rod: ''Crustavirus''
*::* Nezařazený rod: ''Wastrivirus''
** Čeleď: ''Bornaviridae'' (1 rod)
**:* Rod: ''Bornavirus''
** Čeleď: ''[[Filoviridae]]'' (3 rody)
**:* Rod: ''Cuevavirus''
**:* Rod: ''[[Ebola]]virus''
**:* Rod: ''[[Virus Marburg|Marburgvirus]]''
** Čeleď: ''Mymonaviridae'' (1 rod)
**:* Rod: ''Sclerotimonavirus''
** Čeleď: ''Nyamiviridae'' (2 rody)
**:* Rod: ''Nyavirus''
**:* Rod: ''Socyvirus''
** Čeleď: ''Paramyxoviridae'' (7 rodů)
**:* Rod: ''Aquaparamyxovirus''
**:* Rod: ''Avulavirus''
**:* Rod: ''Ferlavirus''
**:* Rod: ''Henipavirus''
**:* Rod: ''Morbillivirus''
**:* Rod: ''Respirovirus''
**:* Rod: ''Rubulavirus''
** Čeleď: ''Pneumoviridae'' (2 rody)
**:* Rod: ''Metapneumovirus''
**:* Rod: ''Pneumovirus''
** Čeleď: ''[[Rhabdoviridae]]'' (13 rodů)
**:* Rod: ''Cytorhabdovirus''
**:* Rod: ''Dichorhavirus''
**:* Rod: ''Ephemerovirus''
**:* Rod: ''[[Virus vztekliny|Lyssavirus]]''
**:* Rod: ''Novirhabdovirus''
**:* Rod: ''Nucleorhabdovirus''
**:* Rod: ''Perhabdovirus''
**:* Rod: ''Sigmavirus''
**:* Rod: ''Sprivivirus''
**:* Rod: ''Tibrovirus''
**:* Rod: ''Tupavirus''
**:* Rod: ''Varicosavirus''
**:* Rod: ''Vesiculovirus''
** Čeleď: ''Sunviridae'' (1 rod)
**:* Rod: ''Sunshinevirus''
 
=== Nidovirales ===
* '''Řád: ''[[:Kategorie:Nidovirales|Nidovirales]]''''' (4 čeledi)
** Čeleď: ''Arteriviridae'' (1 rod)
**:* Rod: ''Arterivirus''
** Čeleď: ''[[Coronaviridae]]'' (2 podčeledi)
*** Podčeleď: ''Coronavirinae'' (4 rody)
**** Rod: ''Alphacoronavirus''
**** Rod: ''Betacoronavirus''
**** Rod: ''Deltacoronavirus''
**** Rod: ''[[Virus infekční bronchitidy|Gammacoronavirus]]''
*** Podčeleď: ''Torovirinae'' (2 rody)
**** Rod: ''Bafinivirus''
**** Rod: ''Torovirus''
** Čeleď: ''Mesoniviridae'' (1 rod)
**:* Rod: ''Alphamesonivirus''
** Čeleď: ''Roniviridae'' (1 rod)
**:* Rod: ''Okavirus''
 
=== Picornavirales ===
* '''Řád: ''[[:Kategorie:Picornavirales|Picornavirales]]''''' (5 čeledí a 2 nezařazené rody)
*::* Nezařazený rod: ''Bacillarnavirus''
*::* Nezařazený rod: ''Labyrnavirus''
** Čeleď: ''Dicistroviridae'' (3 rody)
**:* Rod: ''Aparavirus''
**:* Rod: ''Cripavirus''
**:* Rod: ''Triatovirus''
** Čeleď: ''Iflaviridae'' (1 rod)
**:* Rod: ''Iflavirus''
** Čeleď: ''Marnaviridae'' (1 rod)
**:* Rod: ''Marnavirus''
** Čeleď: ''[[Picornaviridae]]'' (31 rodů)
**:* Rod: ''[[Virus slintavky a kulhavky|Aphthovirus]]''
**:* Rod: ''Aquamavirus''
**:* Rod: ''Avihepatovirus''
**:* Rod: ''Avisivirus''
**:* Rod: ''Cardiovirus''
**:* Rod: ''Cosavirus''
**:* Rod: ''Dicipivirus''
**:* Rod: ''[[Enterovirus]]''
**:* Rod: ''Erbovirus''
**:* Rod: ''Gallivirus''
**:* Rod: ''Hepatovirus''
**:* Rod: ''Hunnivirus''
**:* Rod: ''Kobuvirus''
**:* Rod: ''Kunsagivirus''
**:* Rod: ''Limnipivirus''
**:* Rod: ''Megrivirus''
**:* Rod: ''Mischivirus''
**:* Rod: ''Mosavirus''
**:* Rod: ''Oscivirus''
**:* Rod: ''Parechovirus''
**:* Rod: ''Pasivirus''
**:* Rod: ''Passerivirus''
**:* Rod: ''Potamipivirus''
**:* Rod: ''Rosavirus''
**:* Rod: ''Sakobuvirus''
**:* Rod: ''Salivirus''
**:* Rod: ''Sapelovirus''
**:* Rod: ''Senecavirus''
**:* Rod: ''Sicinivirus''
**:* Rod: ''Teschovirus''
**:* Rod: ''[[Aviární encefalomyelitida|Tremovirus]]''
** Čeleď: ''Secoviridae'' (1 podčeleď a 5 nezařazených rodů)
**:* Nezařazený rod: ''Cheravirus''
**:* Nezařazený rod: ''Sadwavirus''
**:* Nezařazený rod: ''Sequivirus''
**:* Nezařazený rod: ''Torradovirus''
**:* Nezařazený rod: ''Waikavirus''
*** Podčeleď: ''Comovirinae'' (3 rody)
**** Rod: ''Comovirus''
**** Rod: ''Fabavirus''
**** Rod: ''Nepovirus''
 
=== Tymovirales ===
* '''Řád: ''Tymovirales''''' (4 čeledi)
** Čeleď: ''Alphaflexiviridae'' (7 rodů)
**:* Rod: ''Allexivirus''
**:* Rod: ''Botrexvirus''
**:* Rod: ''Lolavirus''
**:* Rod: ''Mandarivirus''
**:* Rod: ''Platypuvirus''
**:* Rod: ''Potexvirus''
**:* Rod: ''Sclerodarnavirus''
** Čeleď: ''Betaflexiviridae'' (2 podčeledi)
*** Podčeleď: ''Quinvirinae'' (3 rody)
**** Rod: ''Carlavirus''
**** Rod: ''Foveavirus''
**** Rod: ''Robigovirus''
*** Podčeleď: ''Trivirinae'' (8 rodů)
**** Rod: ''Capillovirus''
**** Rod: ''Chordovirus''
**** Rod: ''Citrivirus''
**** Rod: ''Divavirus''
**** Rod: ''Prunevirus''
**** Rod: ''Tepovirus''
**** Rod: ''Trichovirus''
**** Rod: ''Vitivirus''
** Čeleď: ''Gammaflexiviridae'' (1 rod)
**:* Rod: ''Mycoflexivirus''
** Čeleď: ''Tymoviridae'' (3 rody)
**:* Rod: ''Maculavirus''
**:* Rod: ''Marafivirus''
**:* Rod: ''Tymovirus''
 
=== „Megavirales“ ===
* '''Řád (neuznaný): ''Megavirales''''' (7 čeledí, 2 neuznané čeledi, 1 uznaný a 2 neuznané nezařazené rody)<ref name="Moumouvirus" /><ref name="Colson_2013">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Colson
| jméno = Philippe
Řádek 437:
| jazyk = anglicky
}}</ref><ref name="Megavirales" group="pozn." />
*::* Nezařazený rod: ''Dinodnavirus''
*::* Nezařazený rod (neuznaný): ''Faustovirus''<ref name="Reteno_2015">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Reteno
| jméno = Dorine Gaëlle I.
Řádek 497:
| jazyk = anglicky
}}</ref>
*::* Nezařazený rod (neuznaný): ''Mollivirus''<ref name="Legendre_2015">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Legendre
| jméno = Matthieu
Řádek 529:
| jazyk = anglicky
}}</ref>
** Nezařazená čeleď: ''Ascoviridae'' (2 rody)<ref name="Megavirales" group="pozn." />
**:* Rod: ''Ascovirus''
**:* Rod: ''Toursvirus''
** Nezařazená čeleď: ''Asfarviridae'' (1 rod)<ref name="Megavirales" group="pozn." />
**:* Rod: ''Asfivirus''
** Nezařazená čeleď: ''[[Iridoviry|Iridoviridae]]'' (5 rodů)<ref name="Megavirales" group="pozn." />
**:* Rod: ''Chloriridovirus''
**:* Rod: ''Iridovirus''
**:* Rod: ''Lymphocystivirus''
**:* Rod: ''Megalocytivirus''
**:* Rod: ''Ranavirus''
** Nezařazená čeleď: ''Marseilleviridae'' (1 rod, 2 neuznané rody)<ref name="Megavirales" group="pozn." />
**:* Rod: ''Marseillevirus''
**:* Rod (neuznaný): ''Lausannevirus''
**:* Rod (neuznaný): ''Tunisvirus''
** Nezařazená čeleď: ''Mimiviridae'' (2 rody, 3 neuznané rody){{#tag:ref|Vzhledem k příbuznosti je navrhováno vyčlenění čeledí ''Ascoviridae'', ''Asfarviridae'', ''Iridoviridae'', ''Marseilleviridae'', ''Mimiviridae'', ''Phycodnaviridae'' a ''Poxviridae'' do zvláštního řádu '''''Megavirales'''''.<ref name="Moumouvirus" /><ref name="Colson_2013" /> Do řádu by pravděpodobně také náležely navrhované čeledi ''Pandoraviridae'' (vzhledem k blízkosti k čeledi ''Phycodnaviridae'')<ref name="Yutin_2013">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Yutin
| jméno = Natalya
Řádek 604:
| jazyk = anglicky
}}</ref>|group="pozn."|name="Megavirales"}}
**:* Rod: ''Cafeteriavirus''
**:* Rod: ''[[Mimivirus]]''
**:* Rod (neuznaný): ''[[Megavirus]]''<ref>{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Arslan
| jméno = Defne
Řádek 626:
| jazyk = anglicky
}}</ref>
**:* Rod (neuznaný): ''Lentillevirus''<ref>{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Desnues
| jméno = Christelle
Řádek 652:
| jazyk = anglicky
}}</ref>
**:* Rod (neuznaný): ''Moumouvirus''<ref name="Moumouvirus">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Yoosuf
| jméno = Niyaz
Řádek 673:
| jazyk = anglicky
}}</ref>
** Nezařazená čeleď (neuznaná): ''Pandoraviridae''<ref name="Megavirales" group="pozn." /> (1 neuznaný rod)<ref name="Philippe_2013">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Philippe
| jméno = Nadège
Řádek 694:
| pmid =
| jazyk = anglicky
}}</ref><ref>MIHULKA, Stanislav: Mimiviry jsou out, teď vládnou pandoraviry! O.S.E.L., 20. červenec 2013. [http://www.osel.cz/index.php?clanek=7023 Dostupné online]</ref>
**:* Rod (neuznaný): ''[[Pandoravirus]]''
** Nezařazená čeleď: ''Phycodnaviridae'' (6 rodů)<ref name="Megavirales" group="pozn." />
**:* Rod: ''Chlorovirus''
**:* Rod: ''Coccolithovirus''
**:* Rod: ''Phaeovirus''
**:* Rod: ''Prasinovirus''
**:* Rod: ''Prymnesiovirus''
**:* Rod: ''Raphidovirus''
** Nezařazená čeleď (neuznaná): ''Pithoviridae''<ref name="Megavirales" group="pozn." /> (1 neuznaný rod)<ref name="Claverie_2014">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Legendre
| jméno = Matthieu
Řádek 749:
| url = http://www.tyden.cz/rubriky/veda/veda-a-my/vedci-ozivili-30-tisic-let-stary-virus-z-ledu_300024.html
}}</ref>
**:* Rod (neuznaný): ''Pithovirus''
** Nezařazená čeleď: ''[[:Kategorie:Poxviry|Poxviridae]]'' (2 podčeledi)<ref name="Megavirales" group="pozn." />
*** Podčeleď: ''Chordopoxvirinae'' (10 rodů)
**** Rod: ''Avipoxvirus''
**** Rod: ''Capripoxvirus''
**** Rod: ''Cervidpoxvirus''
**** Rod: ''Crocodylidpoxvirus''
**** Rod: ''Leporipoxvirus''
**** Rod: ''[[Virus molluscum contagiosum|Molluscipoxvirus]]''
**** Rod: ''[[Virus pravých neštovic|Orthopoxvirus]]''
**** Rod: ''Parapoxvirus''
**** Rod: ''Suipoxvirus''
**** Rod: ''Yatapoxvirus''
*** Podčeleď: ''Entomopoxvirinae'' (3 rody)
**** Rod: ''Alphaentomopoxvirus''
**** Rod: ''Betaentomopoxvirus''
**** Rod: ''Gammaentomopoxvirus''
 
=== Nezařazené čeledi a rody ===
:* Nezařazená čeleď: ''[[:Kategorie:Adenoviridae|Adenoviridae]]'' (5 rodů)
:*:* Rod: ''[[Adenovirová salpingitida drůbeže|Atadenovirus]]''
:*:* Rod: ''Aviadenovirus''
:*:* Rod: ''Ichtadenovirus''
:*:* Rod: ''Mastadenovirus''
:*:* Rod: ''Siadenovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Alphatetraviridae'' (2 rody)
:*:* Rod: ''Betatetravirus''
:*:* Rod: ''Omegatetravirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Alvernaviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Dinornavirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Amalgaviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Amalgavirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Ampullaviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Ampullavirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Anelloviridae'' (12 rodů)
:*:* Rod: ''Alphatorquevirus''
:*:* Rod: ''Betatorquevirus''
:*:* Rod: ''Deltatorquevirus''
:*:* Rod: ''Epsilontorquevirus''
:*:* Rod: ''Etatorquevirus''
:*:* Rod: ''Gammatorquevirus''
:*:* Rod: ''Gyrovirus''
:*:* Rod: ''Iotatorquevirus''
:*:* Rod: ''Kappatorquevirus''
:*:* Rod: ''Lambdatorquevirus''
:*:* Rod: ''Thetatorquevirus''
:*:* Rod: ''Zetatorquevirus''
:* Nezařazená čeleď: ''[[Arenaviridae]]'' (2 rody)
:*:* Rod: ''Mammarenavirus''
:*:* Rod: ''Reptarenavirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Ascoviridae'' – viz neuznaný řád ''Megavirales'' výše
:* Nezařazená čeleď: ''Asfarviridae'' – viz neuznaný řád ''Megavirales'' výše
:* Nezařazená čeleď: ''Astroviridae'' (2 rody)
:*:* Rod: ''Avastrovirus''
:*:* Rod: ''Mamastrovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Avsunviroidae'' (3 rody)
:*:* Rod: ''Avsunviroid
:*:* Rod: ''Elaviroid
:*:* Rod: ''Pelamoviroid
:* Nezařazená čeleď: ''Baculoviridae'' (4 rody)
:*:* Rod: ''Alphabaculovirus''
:*:* Rod: ''Betabaculovirus''
:*:* Rod: ''Deltabaculovirus''
:*:* Rod: ''Gammabaculovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Barnaviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Barnavirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Benyviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Benyvirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Bicaudaviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Bicaudavirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Bidnaviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Bidensovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Birnaviridae'' (4 rody)
:*:* Rod: ''Aquabirnavirus''
:*:* Rod: ''Avibirnavirus''
:*:* Rod: ''Blosnavirus''
:*:* Rod: ''Entomobirnavirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Bromoviridae'' (6 rodů)
:*:* Rod: ''Alfamovirus''
:*:* Rod: ''Anulavirus''
:*:* Rod: ''Bromovirus''
:*:* Rod: ''Cucumovirus''
:*:* Rod: ''Ilarvirus''
:*:* Rod: ''Oleavirus''
:* Nezařazená čeleď: ''[[:Kategorie:Bunyaviridae|Bunyaviridae]]'' (5 rodů, 2 neuznané rody){{#tag:ref|V r. 2016 bylo navrženo, aby byla čeleď ''Bunyaviridae'' pod novým názvem ''Peribunyaviridae'', společně s nově navrženými čeleděmi ''Feraviridae'', ''Fimoviridae'' (zahrnující dosud nezařazený rod ''Emaravirus''), ''Hantaviridae'', ''Jonviridae'', ''Nairoviridae'', ''Phasmaviridae'', ''Phenuiviridae'' (zahrnující dosud nezařazený rod ''Tenuivirus'') a ''Tospoviridae'' do nově vytvořeného samostatného řádu '''''Bunyavirales'''''.<ref name="Bunyaviridae Study Group_2016">Bunyaviridae Study Group: Create a new order, ''Bunyavirales'', to accommodate nine families (eight new, one renamed) comprising thirteen genera. Proposal to ICTV, Nr. 2016.030a-vM, 2016. [https://talk.ictvonline.org/files/proposals/taxonomy_proposals_plant1/m/plant02/6426 Dostupné online] (anglicky)</ref>|group="pozn."|name="Bunyavirales"}}
:*:* Rod: ''[[Hantavirus]]''
:*:* Rod: ''Nairovirus''
:*:* Rod: ''[[Schmallenberský virus|Orthobunyavirus]]''
:*:* Rod: ''Phlebovirus''
:*:* Rod: ''Tospovirus''
:*:* Rod (neuznaný): ''Ferakvirus''<ref name="Marklewitz_2015">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Marklewitz
| jméno = Marco
Řádek 864:
| jazyk = anglicky
}}</ref>
:*:* Rod (neuznaný): ''Jonchetvirus''<ref name="Marklewitz_2015" />
:* Nezařazená čeleď: ''[[:Kategorie:Caliciviridae|Caliciviridae]]'' (5 rodů)
:*:* Rod: ''Lagovirus''
:*:* Rod: ''Nebovirus''
:*:* Rod: ''[[Norovirus]]''
:*:* Rod: ''Sapovirus''
:*:* Rod: ''Vesivirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Carmotetraviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Alphacarmotetravirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Caulimoviridae'' (8 rodů)
:*:* Rod: ''Badnavirus''
:*:* Rod: ''Caulimovirus''
:*:* Rod: ''Cavemovirus''
:*:* Rod: ''Petuvirus''
:*:* Rod: ''Rosadnavirus''
:*:* Rod: ''Solendovirus''
:*:* Rod: ''Soymovirus''
:*:* Rod: ''Tungrovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Chrysoviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Chrysovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Circoviridae'' (2 rody)
:*:* Rod: ''Circovirus''
:*:* Rod: ''Cyclovirus''
<!--:*:*Rod (neuznaný): ''Tornovirus''<ref name="STTV">{{Citace elektronického periodika
| příjmení =
Řádek 911:
| pmid =
| jazyk = anglicky
}}</ref>-->
:* Nezařazená čeleď: ''Clavaviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Clavavirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Closteroviridae'' (4 rody)
:*:* Rod: ''Ampelovirus''
:*:* Rod: ''Closterovirus''
:*:* Rod: ''Crinivirus''
:*:* Rod: ''Velarivirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Corticoviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Corticovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Cystoviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Cystovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Endornaviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Endornavirus''
:* Nezařazená čeleď: ''[[Flaviviridae]]'' (4 rody)
:*:* Rod: ''Flavivirus''
:*:* Rod: ''Hepacivirus''
:*:* Rod: ''Pegivirus''
:*:* Rod: ''Pestivirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Fuselloviridae'' (2 rody)
:*:* Rod: ''Alphafusellovirus''
:*:* Rod: ''Betafusellovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Geminiviridae'' (7 rodů, 1 neuznaný rod)
:*:* Rod: ''Becurtovirus''
:*:* Rod: ''Begomovirus''
:*:* Rod: ''Curtovirus''
:*:* Rod: ''Eragrovirus''
:*:* Rod: ''Mastrevirus''
:*:* Rod: ''Topocuvirus''
:*:* Rod: ''Turncurtovirus''
:*:* Rod (neuznaný): ''Graingemvirus''<ref>{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Poojari
| jméno = Sudarsana
Řádek 963:
| jazyk = anglicky
}}</ref>
:* Nezařazená čeleď: ''Genomoviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Gemycircularvirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Globuloviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Globulovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Guttaviridae'' (2 rody)
:*:* Rod: ''Alphaguttavirus''
:*:* Rod: ''Betaguttavirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Hepadnaviridae'' (2 rody)
:*:* Rod: ''Avihepadnavirus''
:*:* Rod: ''[[Virus hepatitidy B|Orthohepadnavirus]]''
:* Nezařazená čeleď: ''Hepeviridae'' (2 rody)
:*:* Rod: ''Orthohepevirus''
:*:* Rod: ''Piscihepevirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Hypoviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Hypovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Hytrosaviridae'' (2 rody)
:*:* Rod: ''Glossinavirus''
:*:* Rod: ''Muscavirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Inoviridae'' (2 rody)
:*:* Rod: ''Inovirus''
:*:* Rod: ''Plectrovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Iridoviridae'' – viz neuznaný řád ''Megavirales'' výše
:* Nezařazená čeleď: ''Lavidaviridae'' (2 rody)
:*:* Rod: ''Mavirus''
:*:* Rod: ''Sputnikvirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Leviviridae'' (2 rody)
:*:* Rod: ''Allolevivirus''
:*:* Rod: ''Levivirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Luteoviridae'' (3 rody)
:*:* Rod: ''Enamovirus''
:*:* Rod: ''Luteovirus''
:*:* Rod: ''Polerovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Marseilleviridae'' – viz neuznaný řád ''Megavirales'' výše
:* Nezařazená čeleď: ''Megabirnaviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Megabirnavirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Metaviridae'' (3 rody)
:*:* Rod: ''Errantivirus''
:*:* Rod: ''Metavirus''
:*:* Rod: ''Semotivirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Microviridae'' (2 podčeledi)
:** Podčeleď: ''Bullavirinae'' (3 rody)
:*** Rod: ''Alpha3microvirus''
:*** Rod: '' G4microvirus''
:*** Rod: '' Phix174microvirus''
:** Podčeleď: ''Gokushovirinae'' (3 rody)
:*** Rod: ''Bdellomicrovirus''
:*** Rod: ''Chlamydiamicrovirus''
:*** Rod: ''Spiromicrovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Mimiviridae'' – viz neuznaný řád ''Megavirales'' výše
:* Nezařazená čeleď: ''Nanoviridae'' (2 rody)
:*:* Rod: ''Babuvirus''
:*:* Rod: ''Nanovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Narnaviridae'' (2 rody)
:*:* Rod: ''Mitovirus''
:*:* Rod: ''Narnavirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Nimaviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Whispovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Nodaviridae'' (2 rody)
:*:* Rod: ''Alphanodavirus''
:*:* Rod: ''Betanodavirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Nudiviridae'' (2 rody)
:*:* Rod: ''Alphanudivirus''
:*:* Rod: ''Betaanudivirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Ophioviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Ophiovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''[[Orthomyxoviridae]]'' (6 rodů, 1 neuznaný rod)
:*:* Rod: ''[[Chřipkový virus A|Influenzavirus A]]''
:*:* Rod: ''Influenzavirus B''
:*:* Rod: ''Influenzavirus C''
:*:* Rod (neuznaný): ''Influenzavirus D''<ref>ICTV: [https://talk.ictvonline.org/files/proposals/animal_dsrna_and_ssrna-_viruses/m/animal_rna_minus_ec_approved/6262 Taxonomy Proposals]</ref>
:*:* Rod: ''Isavirus''
:*:* Rod: ''Quaranjavirus''
:*:* Rod: ''Thogotovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''[[:Kategorie:Papilomavirus|Papillomaviridae]]'' (49 rodů)
:*:* Rod: ''Alphapapillomavirus''
:*:* Rod: ''Betapapillomavirus''
:*:* Rod: ''Chipapillomavirus''
:*:* Rod: ''Deltapapillomavirus''
:*:* Rod: ''Dyochipapillomavirus''
:*:* Rod: ''Dyodeltapapillomavirus''
:*:* Rod: ''Dyoepsilonpapillomavirus''
:*:* Rod: ''Dyoetapapillomavirus''
:*:* Rod: ''Dyoiotapapillomavirus''
:*:* Rod: ''Dyokappapapillomavirus''
:*:* Rod: ''Dyolambdapapillomavirus''
:*:* Rod: ''Dyomupapillomavirus''
:*:* Rod: ''Dyonupapillomavirus''
:*:* Rod: ''Dyoomegapapillomavirus''
:*:* Rod: ''Dyoomikronpapillomavirus''
:*:* Rod: ''Dyophipapillomavirus''
:*:* Rod: ''Dyopipapillomavirus''
:*:* Rod: ''Dyopsipapillomavirus''
:*:* Rod: ''Dyorhopapillomavirus''
:*:* Rod: ''Dyosigmapapillomavirus''
:*:* Rod: ''Dyotaupapillomavirus''
:*:* Rod: ''Dyothetapapillomavirus''
:*:* Rod: ''Dyoupsilonpapillomavirus''
:*:* Rod: ''Dyoxipapillomavirus''
:*:* Rod: ''Dyozetapapillomavirus''
:*:* Rod: ''Epsilonpapillomavirus''
:*:* Rod: ''Etapapillomavirus''
:*:* Rod: ''Gammapapillomavirus''
:*:* Rod: ''Iotapapillomavirus''
:*:* Rod: ''Kappapapillomavirus''
:*:* Rod: ''Lambdapapillomavirus''
:*:* Rod: ''Mupapillomavirus''
:*:* Rod: ''Nupapillomavirus''
:*:* Rod: ''Omegapapillomavirus''
:*:* Rod: ''Omikronpapillomavirus''
:*:* Rod: ''Phipapillomavirus''
:*:* Rod: ''Pipapillomavirus''
:*:* Rod: ''Psipapillomavirus''
:*:* Rod: ''Rhopapillomavirus''
:*:* Rod: ''Sigmapapillomavirus''
:*:* Rod: ''Taupapillomavirus''
:*:* Rod: ''Thetapapillomavirus''
:*:* Rod: ''Treisdeltapapillomavirus''
:*:* Rod: ''Treisepsilonpapillomavirus''
:*:* Rod: ''Treisetapapillomavirus''
:*:* Rod: ''Treiszetapapillomavirus''
:*:* Rod: ''Upsilonpapillomavirus''
:*:* Rod: ''Xipapillomavirus''
:*:* Rod: ''Zetapapillomavirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Partitiviridae'' (5 rodů)
:*:* Rod: ''Alphapartitivirus''
:*:* Rod: ''Betapartitivirus''
:*:* Rod: ''Cryspovirus''
:*:* Rod: ''Deltapartitivirus''
:*:* Rod: ''Gammapartitivirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Parvoviridae'' (2 podčeledi)
:** Podčeleď: ''Densovirinae'' (5 rodů)
:*** Rod: ''Ambidensovirus''
:*** Rod: ''Brevidensovirus''
:*** Rod: ''Hepandensovirus''
:*** Rod: ''Iteradensovirus''
:*** Rod: ''Penstyldensovirus''
:** Podčeleď: ''Parvovirinae'' (8 rodů)
:*** Rod: ''Amdoparvovirus''
:*** Rod: ''Aveparvovirus''
:*** Rod: ''Bocaparvovirus''
:*** Rod: ''Copiparvovirus''
:*** Rod: ''Dependoparvovirus''
:*** Rod: ''Erythroparvovirus''
:*** Rod: ''Protoparvovirus''
:*** Rod: ''Tetraparvovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Permutotetraviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Alphapermutotetravirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Phycodnaviridae'' – viz neuznaný řád ''Megavirales'' výše
:* Nezařazená čeleď: ''Picobirnaviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Picobirnavirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Plasmaviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Plasmavirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Pleolipoviridae'' (3 rody)
:*:* Rod: ''Alphapleolipovirus''
:*:* Rod: ''Betapleolipovirus''
:*:* Rod: ''Gammapleolipovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Polydnaviridae'' (2 rody)
:*:* Rod: ''Bracovirus''
:*:* Rod: ''Ichnovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Polyomaviridae'' (4 rody)
:*:* Rod: ''Alphapolyomavirus''
:*:* Rod: ''Betapolyomavirus''
:*:* Rod: ''Deltapolyomavirus''
:*:* Rod: ''Gammapolyomavirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Pospiviroidae'' (5 rodů)
:*:* Rod: ''Apscaviroid
:*:* Rod: ''Cocadviroid
:*:* Rod: ''Coleviroid
:*:* Rod: ''Hostuviroid
:*:* Rod: ''Pospiviroid
:* Nezařazená čeleď: ''Potyviridae'' (8 rodů)
:*:* Rod: ''Brambyvirus''
:*:* Rod: ''Bymovirus''
:*:* Rod: ''Ipomovirus''
:*:* Rod: ''Macluravirus''
:*:* Rod: ''Poacevirus''
:*:* Rod: ''Potyvirus''
:*:* Rod: ''Rymovirus''
:*:* Rod: ''Tritimovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Poxviridae'' – viz neuznaný řád ''Megavirales'' výše
:* Nezařazená čeleď: ''Pseudoviridae'' (3 rody)
:*:* Rod: ''Hemivirus''
:*:* Rod: ''Pseudovirus''
:*:* Rod: ''Sirevirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Quadriviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Quadrivirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Reoviridae'' (2 podčeledi)
:** Podčeleď: ''Sedoreovirinae'' (6 rodů)
:*** Rod: ''Cardoreovirus''
:*** Rod: ''Mimoreovirus''
:*** Rod: ''Orbivirus''
:*** Rod: ''Phytoreovirus''
:*** Rod: ''Rotavirus''
:*** Rod: ''Seadornavirus''
:** Podčeleď: ''Spinareovirinae'' (9 rodů)
:*** Rod: ''Aquareovirus''
:*** Rod: ''Coltivirus''
:*** Rod: ''Cypovirus''
:*** Rod: ''Dinovernavirus''
:*** Rod: ''Fijivirus''
:*** Rod: ''Idnoreovirus''
:*** Rod: ''Mycoreovirus''
:*** Rod: ''Orthoreovirus''
:*** Rod: ''Oryzavirus''
:* Nezařazená čeleď: ''[[Retroviry|Retroviridae]]'' (2 podčeledi)
:** Podčeleď: ''Orthoretrovirinae'' (6 rodů)
:*** Rod: ''Alpharetrovirus''
:*** Rod: ''Betaretrovirus''
:*** Rod: ''Deltaretrovirus''
:*** Rod: ''Epsilonretrovirus''
:*** Rod: ''Gammaretrovirus''
:*** Rod: ''Lentivirus''
:** Podčeleď: ''Spumaretrovirinae'' (1 rod)
:*** Rod: ''Spumavirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Sarthoviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Macronovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Sphaerolipoviridae'' (3 rody)
:*:* Rod: ''Alphasphaerolipovirus''
:*:* Rod: ''Betasphaerolipovirus''
:*:* Rod: ''Gammasphaerolipovirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Spiraviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Alphaspiravirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Tectiviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Tectivirus''
:* Nezařazená čeleď: ''[[Togaviridae]]'' (2 rody)
:*:* Rod: ''[[Alphavirus]]''
:*:* Rod: ''[[Rubivirus]]''
:* Nezařazená čeleď: ''Tombusviridae'' (16 rodů)
:*:* Rod: ''Alphacarmovirus''
:*:* Rod: ''Alphanecrovirus''
:*:* Rod: ''Aureusvirus''
:*:* Rod: ''Avenavirus''
:*:* Rod: ''Betacarmovirus''
:*:* Rod: ''Betanecrovirus''
:*:* Rod: ''Dianthovirus''
:*:* Rod: ''Gallantivirus''
:*:* Rod: ''Gammacarmovirus''
:*:* Rod: ''Macanavirus''
:*:* Rod: ''Machlomovirus''
:*:* Rod: ''Panicovirus''
:*:* Rod: ''Pelarspovirus''
:*:* Rod: ''Tombusvirus''
:*:* Rod: ''Umbravirus''
:*:* Rod: ''Zeavirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Totiviridae'' (5 rodů)
:*:* Rod: ''Giardiavirus''
:*:* Rod: ''Leishmaniavirus''
:*:* Rod: ''Totivirus''
:*:* Rod: ''Trichomonasvirus''
:*:* Rod: ''Victorivirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Turriviridae'' (1 rod)
:*:* Rod: ''Alphaturrivirus''
:* Nezařazená čeleď: ''Virgaviridae'' (7 rodů)
:*:* Rod: ''Furovirus''
:*:* Rod: ''Goravirus''
:*:* Rod: ''Hordeivirus''
:*:* Rod: ''Pecluvirus''
:*:* Rod: ''Pomovirus''
:*:* Rod: ''[[Virus tabákové mozaiky|Tobamovirus]]''
:*:* Rod: ''Tobravirus''
 
:::* Nezařazené rody: ''Albetovirus'', ''Aumaivirus'', ''Bacilladnavirus'', ''Botybirnavirus'', ''Cilevirus'', ''Deltavirus'', ''Dinodnavirus'' (pravděpodobně by patřil do neuznaného řádu ''Megavirales''<ref name="Dinodnavirus"> [http://talk.ictvonline.org/files/ictv_official_taxonomy_updates_since_the_8th_report/m/fungal-official/4091/download.aspx&sa=U&ei=ptXSUdIQxdO1BuTXgOgM&ved=0CCgQFjAB&usg=AFQjCNF_t_nyrQZhOe8K-fHM5Q_pf3lMDQ ICTV taxonomic proposal 2009.001a/fF] (anglicky)]</ref>), ''Emaravirus''<ref name="Bunyavirales" group="pozn." />, ''Higrevirus'', ''Idaeovirus'', ''Ourmiavirus'', ''Papanivirus'', ''Polemovirus'', ''Rhizidiovirus'', ''Salterprovirus'', ''Sinaivirus'', ''Sobemovirus'', ''Tenuivirus''<ref name="Bunyavirales" group="pozn." />, ''Virtovirus''
 
== Baltimorova klasifikace ==
[[Soubor:Baltimore Classification.png|right|thumb|300px|Baltimorova klasifikace virů je založena na způsobu syntézy virové [[mRNA]] podle virového genomu]]
 
Řádek 1 266:
}}</ref>|group="pozn."}} V původním návrhu Davida Baltimora bylo šest skupin virů (I.-VI.), sedmá skupina byla vytvořena pro později objevenou skupinu [[hepadnaviridae|hepadnavirů]] s unikátně stavěným genomem. Systém umožňuje zjednodušit si nesmírně komplikované a rozmanité typy životních cyklů, jimiž viry oplývají.<ref>{{citace elektronické monografie| titul = Simplifying virus classification: The Baltimore system| rok=2009| vydavatel=Virology Blog| jméno=Vincent| příjmení= Racaniello| url=http://www.virology.ws/2009/08/12/simplifying-virus-classification-the-baltimore-system/}}</ref>
 
* '''Skupina I.: [[dsDNA viry]]''', tedy viry s dvouvláknovou DNA
*: Patří sem:
*:* tzv. "head-tail" viry, tedy celé řády
*:** '''Řád: ''Caudovirales'''''
*:** '''Řád: ''Herpesvirales'''''
*:* tzv. NCLDV (''nucleocytoplasmic large DNA viruses''), tedy celý neuznaný řád '''''Megavirales''''', tedy:
*:** Čeleď: ''Ascoviridae''
*:** Čeleď: ''Asfarviridae''
*:** Čeleď: ''Iridoviridae''
*:** Čeleď: ''Marseilleviridae''
*:** Čeleď: ''Mimiviridae''
*:** Čeleď (neuznaná): ''Pandoraviridae''
*:** Čeleď: ''Phycodnaviridae''
*:** Čeleď (neuznaná): ''Pithoviridae''
*:** Čeleď: ''Poxviridae''
*:** Nezařazený rod: ''Dinodnavirus''
*:** Nezařazený rod (neuznaný): ''Faustovirus''
*:** Nezařazený rod (neuznaný): ''Mollivirus''
*:* a dále:
*:** '''Řád: ''Ligamenvirales''''' (celý)
*:** Nezařazená čeleď: ''Adenoviridae''
*:** Nezařazená čeleď: ''Ampullaviridae''
*:** Nezařazená čeleď: ''Baculoviridae''
*:** Nezařazená čeleď: ''Bicaudaviridae''
*:** Nezařazená čeleď: ''Clavaviridae''
*:** Nezařazená čeleď: ''Corticoviridae''
*:** Nezařazená čeleď: ''Fuselloviridae''
*:** Nezařazená čeleď: ''Globuloviridae''
*:** Nezařazená čeleď: ''Guttaviridae''
*:** Nezařazená čeleď: ''Hytrosaviridae''
*:** Nezařazená čeleď: ''Nimaviridae''
*:** Nezařazená čeleď: ''Nudiviridae''
*:** Nezařazená čeleď: ''Papillomaviridae''
*:** Nezařazená čeleď: ''Plasmaviridae''
*:** Nezařazená čeleď: ''Polydnaviridae''
*:** Nezařazená čeleď: ''Polyomaviridae''
*:** Nezařazená čeleď: ''Sphaerolipoviridae''
*:** Nezařazená čeleď: ''Tectiviridae''
*:** Nezařazená čeleď: ''Turriviridae''
*:** Nezařazené rody: ''Rhizidiovirus'', ''Salterprovirus''
 
* ''' Skupina II.: [[ssDNA viry]]''', tedy viry s jednovláknovou DNA přepisovanou do mRNA totožné polarity
*: Patří sem:
*:* Nezařazená čeleď: ''Anelloviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Bidnaviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Circoviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Geminiviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Genomoviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Inoviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Lavidaviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Microviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Nanoviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Parvoviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Pleolipoviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Spiraviridae''
*:* Nezařazený rod: ''Bacilladnavirus''
 
* ''' Skupina III.: [[dsRNA viry]]''', tedy viry s dvouvláknovou RNA
*: Patří sem:
*:* Nezařazená čeleď: ''Amalgamaviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Birnaviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Chrysoviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Cystoviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Endornaviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Hypoviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Megabirnaviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Partitiviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Picobirnaviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Quadriviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Reoviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Totiviridae''
*:* Nezařazený rod: ''Botybirnavirus''
 
* ''' Skupina IV.: [[ssRNA viry s pozitivní polaritou]]''', tedy viry s jednovláknovou RNA přepisovanou do mRNA totožné polarity
*: Patří sem:
*:* '''Řád: ''Nidovirales''''' (celý)
*:* '''Řád: ''Picornavirales''''' (celý)
*:* '''Řád: ''Tymovirales''''' (celý)
*:* Nezařazená čeleď: ''Alphatetraviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Alvernaviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Astroviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Barnaviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Benyviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Bromoviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Caliciviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Carmotetraviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Closteroviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''[[Flaviviridae]]''
*:* Nezařazená čeleď: ''Hepeviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Leviviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Luteoviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Narnaviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Nodaviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Permutotetraviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Potyviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Sarthoviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Togaviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Tombusviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Virgaviridae''
*:* Nezařazené rody: ''Albetovirus'', ''Aumaivirus'', ''Papanivirus'', ''Cilevirus'', ''Higrevirus'', ''Idaeovirus'', ''Ourmiavirus'', ''Polemovirus'', ''Sinaivirus'', ''Sobemovirus'', ''Virtovirus''
 
* ''' Skupina V.: [[ssRNA viry s negativní polaritou]]''', tedy viry s jednovláknovou RNA přepisovanou do mRNA opačné polarity
*: Patří sem:
*:* '''Řád: ''Mononegavirales''''' (celý)
*:* Nezařazená čeleď: ''Arenaviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Bunyaviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Ophioviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Orthomyxoviridae''
*:* Nezařazené rody: ''Deltavirus'', ''Emaravirus'', ''Tenuivirus''
 
* ''' Skupina VI.: [[ssRNA viry s reverzní transkriptázou]]''', tedy viry s jednovláknovou RNA reverzně přepisovanou do DNA
*: Patří sem:
*:* Nezařazená čeleď: ''Metaviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Pseudoviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Retroviridae''
 
* ''' Skupina VII.: [[dsDNA viry s reverzní transkriptázou]]''', tedy viry s dvouvláknovou (částečně i jednovláknovou) DNA nejprve přepisovanou do RNA a následně reverzně přepisovanou do DNA
*: Patří sem:
*:* Nezařazená čeleď: ''Caulimoviridae''
*:* Nezařazená čeleď: ''Hepadnaviridae''
 
== Systém LHT ==
Systém navrhli v r. 1962 André Lwoff, R. W. Horne a P. Tournier. K zařazení druhů využili standardní taxony kmen, podkmen, třída, řád, podřád, čeleď, podčeleď a rod. Kritériem sdružování byly společně sdílené vlastnosti, nikoli napadané organismy. 5 hlavních charakteristik používaných ke klasifikaci bylo:
* druh nukleové kyseliny genomu (DNA, RNA),
* symetrie kapsidu (šroubovice, dvacetistěn, složitý tvar),
Řádek 1 420:
}}</ref>
 
* '''Kmen Vira''' (rozdělen na 2 podkmeny)
** '''Podkmen Deoxyvira''' (DNA viry)
*** Třída Deoxybinala (duální symetrie)
**** Řád Urovirales
****:* Čeleď Phagoviridae
*** Třída Deoxyhelica (helikální symetrie - šroubovice)
**** Řád Chitovirales
****:* Čeleď Poxviridae
*** Třída Deoxycubica (kubická symetrie - mnohostěn)
**** Řád Peplovirales
****:* Čeleď Herpesviridae (162 kapsomer)
**** Řád Haplovirales (bez obálky)
****:* Čeleď Iridoviridae (812 kapsomer)
****:* Čeleď Adenoviridae (252 kapsomer)
****:* Čeleď Papiloviridae (72 kapsomer)
****:* Čeleď Paroviridae (32 kapsomer)
****:* Čeleď Microviridae (12 kapsomer)
** '''Podkmen Ribovira (RNA viry)
*** Třída Ribocubica (kubická symetrie - mnohostěn)
**** Řád Togovirales
****:* Čeleď Arboviridae
**** Řád Lymovirales
****:* Čeleď Napoviridae
****:* Čeleď Reoviridae
*** Třída Ribohelica (helikální symetrie - šroubovice)
**** Řád Sagovirales
****:* Čeleď Stomataviridae
****:* Čeleď Paramyxoviridae
****:* Čeleď Myxoviridae
**** Řád Rhabdovirales
***** Podřád Flexiviridales
****** Čeleď Mesoviridae
****** Čeleď Peptoviridae
***** Podřád Rigidovirales
****** Čeleď Pachyviridae
****** Čeleď Protoviridae
****** Čeleď Polichoviridae
 
== Klasifikace viroidů ==
Klasifikace byla navržena Floresem a kol. v r. 1998<ref>{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Flores
Řádek 1 502:
 
Standardními příponami jsou:
* pro čeleď: ''-viroidae''
* pro rod: ''-viroid''
 
[[Viroid]]y jsou členěny do dvou čeledí. Zástupci čeledi '''''Pospiviroidae''''' mají v genomu tzv. centrální konzervovanou oblast (CCR – central conserved region) obsahující „jádrové“ sekvence a mající specifické sekundární struktury klíčové pro replikaci. Zástupci čeledi '''''Avsunviroidae''''' jsou zase schopni katalyzovat samoštěpení multimerů vytvářených při replikaci.
Řádek 1 526:
| jazyk = anglicky
}}</ref>
* Čeleď ''Avsunviroidae''
** Rod ''Avsunviroid''
** Rod ''Pelamoviroid''
** Rod ''Elaviroid''
* Čeleď ''Pospiviroidae''
** Rod ''Pospiviroid''
** Rod ''Hostuviroid''
** Rod ''Cocadviroid''
** Rod ''Apscaviroid''
** Rod ''Coleviroid''
 
== Poznámky ==
Řádek 1 544:
 
== Externí odkazy ==
* {{Commonscat}}
* {{en}} [http://viralzone.expasy.org/ ViralZone] – podrobný přehled virů s popisy a schematickými obrázky kapsidů
 
[[Kategorie:Viry| ]]