Andrej Babiš má slabost pro čápy, a proto vV březnu 2016 oslabilo důvěryhodnost Andreje Babiše několik protichůdných vyjádření kolem využití dotace na výstavbu areálu [[Čapí hnízdo]].<ref>{{Citace elektronické monografie|titul=Hospodářské noviny|url=http://domaci.ihned.cz/c1-65203390-capi-hnizdo-v-otazkach-a-odpovedich-ano-jedna-z-mych-firem-ho-vlastni-priznal-az-nyni-babis|vydavatel=Hospodářské noviny|datum vydání=2016-03-12|datum přístupu=2016-03-13|jazyk=cs-CZ}}</ref> Podstatou "kauzy Čapí hnízdo" je podezření na účelové čerpání dotací určené pouze pro malé nebo středně velké firmy, když podle kritiků koncern Agrofert formálně převedl v roce 2008 společnost Čapí hnízdo na jiného majitele krytého [[akcie na majitele|listinnými akciemi na majitele]], protože Agrofert by dotaci ve výši 50 mil. korun nezískal.<ref name="idnesOSA">[http://zpravy.idnes.cz/casova-osa-capi-hnizdo-babis-agrofert-dsw-/domaci.aspx?c=A160311_135345_domaci_jw Anonymní akcie, dotace, kritika auditorů. Časová osa kauzy Čapí hnízdo]</ref> Na mimořádné schůzi [[Poslanecká sněmovna Parlamentu České republiky|Poslanecké sněmovny]] Babiš uvedl, že majiteli akcií byli jeho dospělé děti Adriana a Andrej a bratr partnerky Moniky Martin Herodes.<ref>[http://www.ceskatelevize.cz/ct24/domaci/1732993-zive-capi-hnizdo-vlastnili-me-dospele-deti-s-bratrem-partnerky-rekl-babis ČT24: Čapí hnízdo vlastnily mé dospělé děti s bratrem partnerky, řekl Babiš]</ref><ref name=PO/>
