UniProt: Porovnání verzí

'''UniProt'''[http://www.uniprot.org/ Uniprot] je komplexní databáze proteinových sekvencí. Tato volně přístupná databáze obsahuje informace o funkci [[protein|proteinu]]. Informace v UniProt sdružují výsledky projektů sekvenujících genomy a informace o biologických funkcích bílkovin.

UniProt se skládá ze čtyř databází: the UniProt Knowledgebase (UniProtKB)<ref>http://database.oxfordjournals.org/content/2011/bar009</ref>, the UniProt Archive (UniParc)<ref>http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/20/17/3236</ref>, the UniProt Reference Clusters (UniRef) <ref>http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4375400/</ref> a The UniProt Metagenomic and Environmental Sequences (UniMes).

UniProtKB/TrEMBL obsahuje kvalitní výpočetně analyzované záznamy obohacené o automatickou anotaci. Anotované překlady kódujících sekvencí z jiných databází jsou automaticky zpracovány a převedeny do UniProtKB/TrEMBL. UniProtKB/TrEMBL obsahuje také sekvence například z PDB<ref>{{Citace monografie|titul=Protein Data Bank|url=https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Protein_Data_Bank&oldid=717466106|poznámka=Page Version ID: 717466106|jazyk=en}}</ref>.

UniMes slouží jako uložištěúložiště metagenomických a environmentálních údajů.

Internetové stránky UniProt jsou primárním přístupovým bodem k datům a dokumentaci. Tyto stránky nabízí různé nástroje jako např.: fulltextové vyhledávání, fulltextové vyhledávání pro jednotlivé pole, vyhledávání podobné sekvence, sériové vyhledávání pro více sekvencí současně, mapování identifikátoru v databázi<ref>https://ru.wikipedia.org/wiki/UniProt</ref>. Web také nabízí stručný úvod pro začátečníky, příslušný odkaz lze nalézt na domovské stránce. Při vyhledávání není třeba mít znalost o funkcích organizace dat ani syntaxe vyhledávání, takže je vhodný i pro uživatele-začátečníky. Výsledky vyhledávání jsou seřazeny dle podobnosti s vyhledávaným slovem. V levé části webu je po vyhledání možné výsledky filtrovat dle různých parametrů. Výsledky vyhledávání sekvenční podobnosti lze filtrovat podle taxonomie, pro získání rychlého přehledu o taxonomickém rozdělení výsledků<ref>https://ru.wikipedia.org/wiki/UniProt</ref>. Anotace sekvencí shodných záznamů mohou být transformovány do [[Alignment (biologie)|alignmentu]], aby bylo vidět, zda zůstávají zachovány důležité pozice. Web umožnujeumožňuje si vyhledané struktury dávat do záložek (funkce Basket) a sady výsledků stahovat.