Ubikvitin ligáza: Porovnání verzí

Přidán 1 bajt ,  před 6 lety
m
Robot: kosmetické úpravy
(klasifikace)
m (Robot: kosmetické úpravy)
'''Ubiquitin ligáza''' (též '''enzym E3''') je jakýkoliv [[enzym]], který katalyzuje konečný přenos malého proteinu [[ubiquitin]]u na cílový substrát. Jedná se o poslední krok v procesu [[ubiquitinylace]] proteinů. Ubuiquitin je přenesen buď z [[SH skupina|SH skupiny]] [[cystein]]u přímo na molekule enzymu E3, nebo (u ligáz obsahujících [[RING finger]]) přímo z [[enzym E2|enzymu E2]]. Cílem je [[aminoskupina]] [[lysin]]u na substrátu, případně [[N-terminus|N-terminální]] aminoskupina proteinu. Řada ubiquitinylačních reakcí za sebou se označuje jako [[polyubiquitinylace]] a obvykle je signálem pro [[degradace proteinů|degradaci proteinu]], na který byla taková značka přidána.<ref name="ency">{{citace monografie | editoři = Lennarz,W.J., Lane, M.D. | titul = Encyclopedia of Biological Chemistry , Four-Volume Set, 1-4 | kapitola = Ubiquitin System | autor = Aaron Ciechanover ; Michael H. Glickman}}</ref>
 
== Klasifikace ==
Dnes je známo velké množství ubiquitin ligáz, např. v lidském genomu jich je více než 600. Ty jsou zpravidla klasifikovány do tří tříd:<ref>{{Citace periodika|příjmení = Morreale|jméno = Francesca Ester|příjmení2 = Walden|jméno2 = Helen|titul = Types of Ubiquitin Ligases|periodikum = Cell|datum = 2016-03-24|ročník = 165|číslo = 1|strany = 248–248.e1|issn = 0092-8674|doi = 10.1016/j.cell.2016.03.003|jazyk = English|url = http://www.cell.com/article/S0092867416302598/abstract|datum přístupu = 2016-03-26}}</ref>
* [[RING ubiquitin ligáza|RING ubiquitin ligázy]] – nejrozsáhlejší skupina ubiquitin ligáz, které pracují jako monomery nebo dimery. Obsahují tzv. [[RING finger]] (z angl. výrazu "really interesting new gene"), který váže [[Zinek|zinečnatý]] iont, případně podobný [[U-box]] motiv, který zinek neváže. Katalyzují jednokrokový přenos z [[Enzym E2|enzymu E2]] na molekulu substrátu. Speciální podtřídou RING ubiquitin ligáz jsou [[Cullin-RING ubiquitin ligáza|cullin-RING ubiquitin ligázy]] (CRLs), které se skládají z několika podjednotek vázajících se na kostru [[Cullin|cullinu]]. Další známou RING ubiquitin ligázou je [[Anafázi podporující komplex|APC/C komplex]], resp. jeho RING podjednotka [[Apc11]].
* [[HECT ubiquitin ligáza|HECT ubiquitin ligázy]] – skupina ubiquitin ligáz obsahujících tzv. motiv [[HECT]] (homologous to the [[E6AP]] carboxyl terminus). Přenáší ubiquitin z E2 nejprve na vlastní cysteinový zbytek a teprve následně na substrát. HECT jsou tvořeny dvěma laloky, jeden slouží k vazbě E2 a druhý obsahuje zmíněný katalytický cystein (oba laloky mohou během katalytického cyklu měnit svou vzájemnou prostorovou orientaci). N-terminální část je zodpovědná za substrátovou specifitu a podle jejího typu se ještě dále rozlišují [[Nedd4 ubiquitin ligáza|Nedd4 ubiquitin ligázy]] (obsahující [[WW motiv]] s dvěma tryptofany) a HERC ubiquitin ligázy (které mají jednu nebo více [[RCC1|RCC1-like]] domén)
* [[RBR ubiquitin ligáza|RBR ubiquitin ligázy]] – z anglického sousloví "RING-betweenRING-RING", odkazujícího na fakt, že obsahují RING1 doménu a RING2 doménu, mezi nimiž je tzv. "betweenRING" doména. RING1 slouží k vazbě E2, zatímco RING2 obsahuje katalytický cystein. RBR často obsahují další dodatečné domény.
 
== Reference ==
<references />
{{pahýl}}
 
[[Kategorie:Ligázy]]
[[Kategorie:Proteolýza‎Proteolýza]]
[[Kategorie:Ubiquitin ligázy| ]]
1 400 493

editací