Ubikvitin ligáza: Porovnání verzí

Přidáno 1 557 bajtů ,  před 6 lety
klasifikace
(+klasifikace)
(klasifikace)
 
==Klasifikace==
Dnes je známo velké množství ubiquitin ligáz, např. v lidském genomu jich je více než 600. Ty jsou zpravidla klasifikovány do tří tříd:<ref>{{Citace periodika|příjmení = Morreale|jméno = Francesca Ester|příjmení2 = Walden|jméno2 = Helen|titul = Types of Ubiquitin Ligases|periodikum = Cell|datum = 2016-03-24|ročník = 165|číslo = 1|strany = 248–248.e1|issn = 0092-8674|doi = 10.1016/j.cell.2016.03.003|jazyk = English|url = http://www.cell.com/article/S0092867416302598/abstract|datum přístupu = 2016-03-26}}</ref>
Dnes je známo obrovské množství ubiquitin ligáz. Nejjednodušší je rozdělení na dvě hlavní třídy – [[RING ubiquitin ligáza|RING ubiquitin ligázy]] a [[HECT ubiquitin ligáza|HECT ubiquitin ligázy]]. Toto dělení vychází z přítomnosti specifických motivů [[RING finger]], resp. [[HECT]]. Zvláštními typy RING ubiquitin ligáz jsou enzymy obsahující doménu [[PHD finger]] nebo [[U-box]].<ref>
* [[RING ubiquitin ligáza|RING ubiquitin ligázy]] – nejrozsáhlejší skupina ubiquitin ligáz, které pracují jako monomery nebo dimery. Obsahují tzv. [[RING finger]] (z angl. výrazu "really interesting new gene"), který váže [[Zinek|zinečnatý]] iont, případně podobný [[U-box]] motiv, který zinek neváže. Katalyzují jednokrokový přenos z [[Enzym E2|enzymu E2]] na molekulu substrátu. Speciální podtřídou RING ubiquitin ligáz jsou [[Cullin-RING ubiquitin ligáza|cullin-RING ubiquitin ligázy]] (CRLs), které se skládají z několika podjednotek vázajících se na kostru [[Cullin|cullinu]]. Další známou RING ubiquitin ligázou je [[Anafázi podporující komplex|APC/C komplex]], resp. jeho RING podjednotka [[Apc11]].
{{Citace periodika
* [[HECT ubiquitin ligáza|HECT ubiquitin ligázy]] – skupina ubiquitin ligáz obsahujících tzv. motiv [[HECT]] (homologous to the [[E6AP]] carboxyl terminus). Přenáší ubiquitin z E2 nejprve na vlastní cysteinový zbytek a teprve následně na substrát. HECT jsou tvořeny dvěma laloky, jeden slouží k vazbě E2 a druhý obsahuje zmíněný katalytický cystein (oba laloky mohou během katalytického cyklu měnit svou vzájemnou prostorovou orientaci). N-terminální část je zodpovědná za substrátovou specifitu a podle jejího typu se ještě dále rozlišují [[Nedd4 ubiquitin ligáza|Nedd4 ubiquitin ligázy]] (obsahující [[WW motiv]] s dvěma tryptofany) a HERC ubiquitin ligázy (které mají jednu nebo více [[RCC1|RCC1-like]] domén)
| příjmení = Willems
* [[RBR ubiquitin ligáza|RBR ubiquitin ligázy]] – z anglického sousloví "RING-betweenRING-RING", odkazujícího na fakt, že obsahují RING1 doménu a RING2 doménu, mezi nimiž je tzv. "betweenRING" doména. RING1 slouží k vazbě E2, zatímco RING2 obsahuje katalytický cystein. RBR často obsahují další dodatečné domény.
| jméno = A. R.
| příjmení2 = Schwab
| jméno2 = M.
| příjmení3 = Tyers
| jméno3 = M.
| titul = A hitchhiker's guide to the cullin ubiquitin ligases: SCF and its kin
| periodikum = Biochim Biophys Acta.
| rok = 2004
| číslo = 1-3
| ročník = 1695
| strany = 133-70
| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15571813
| issn = 0006-3002
}}
</ref>
 
==Reference==