Po pádu Francie v roce 1940 drtivá většina francouzských zámořských území zůstala věrná nové vzniklé vládě [[Vichistická Francie|Vichistické Francie]]. K FFL se připojily pouze francouzské državy v Indii, [[Kamerun]] a [[Francouzská rovníková Afrika]] (s výjimkou [[Gabon]]u) a teprve postupně během války se FFL dařilo získávat kontrolu nad dalšími koloniemi. K FFL se na počátku připojila i [[Francouzská Polynésie]]. S přidáváním francouzských Afrických kolonií do FFL přišlo velké množství Afrických koloniálních vojenských jednotek. Koncem roku [[1940]] začala válka FFL a Vichistické Francie. K prvnímu ozbrojenému střetu mezi Vichisty a FFL došlo již v roce 1940 během neúspěšného pokusu o dobytí Dakaru. Roku [[1941]] uzavřela FFL spojenectví s britskou armádou [[Commonwealth]]u a podporovala je v bojích v [[Severní Afrika|Severní Africe]]. V polovině roku [[1941]] byli [[Henri Dentz]] a jeho Vichistická armáda poražena v [[Levanta|Levantě]] (oblast [[Sýrie|Sýrie]] a [[Libanon|Libanonu]] od konce první světové války pod francouzskou kontrolou). Tohoto tažení ([[Operace Exporter]]) se účastnil i [[Československé pozemní jednotky na Západě 1939–1945|11. československý pěší prapor - Východní]]. Generál [[Georges Catroux]] byl jmenován jedním z velitelů. V Africe padaly vichistické kolonie postupně do rukou vojáků FFL. Ti se účastnili bojů v [[Libye|Libyi]] a [[Egypt]]ě proti [[Erwin Rommel|Erwinu Rommelovi]] a jeho [[Afrika Korps]]. Po těchto úspěších začali roku [[1943]] vstupovat do FFL také obyvatelé [[Guadeloupe]], [[Martinik]]u a [[Francouzská Guyana|Francouzské Guyany]]. Roku [[1944]] boje o kolonie utichly v důsledku [[Den D|vylodění spojenců v Normandii]] a spojení Vichistické Francie s FFL.
