'''Střevní mikroflóra''' jsou [[mikroorganismus|mikroorganismy]], které žijí v [[trávicí soustava|trávicí soustavě]] [[Živočichové|živočichů]] včetně člověka. Mnohdy [[hostitel]]i prospívají, někdy však mohou i škodit.
V lidských střevech je přibližně 10<sup>13</sup>-10–10<sup>14</sup> bakterií, přičemž buněk lidského těla je asi 10<sup>13</sup>. Jinými slovy, bakterií v lidském těle je stejně či až desetkrát více, než lidských buněk samotných.<ref name="Guarner and Malagelada 2003b">Guarner F and Malagelada JR. 2003. Gut flora in health and disease. ''The Lancet'', Volume 361, Issue 9356, 8 February 2003, Pages 512-519. PMID 12583961. Accessed [[September 15]], [[2007]]</ref><ref>{{Citace periodika|titul = Are We Really Vastly Outnumbered? Revisiting the Ratio of Bacterial to Host Cells in Humans|url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26824647|periodikum = Cell|datum = 2016-01-28|datum přístupu = 2016-02-12|issn = 1097-4172|pmid = 26824647|strany = 337–340|ročník = 164|číslo = 3|doi = 10.1016/j.cell.2016.01.013|poznámka = PMID: 26824647|jméno = Ron|příjmení = Sender|jméno2 = Shai|příjmení2 = Fuchs|jméno3 = Ron|příjmení3 = Milo}}</ref> Celkem ve střevě žije asi 500 druhů mikroorganismů<ref>Gibson RG. 2004. Fibre and effects on probiotics (the prebiotic concept). Clinical Nutrition Supplements, Volume 1, Issue 2, Pages 25-31.</ref>. Dominantními mikroorganismy v [[tlusté střevo|tlustém střevě]] jsou [[bakterie]], ty ve výsledku tvoří 60 % [[hmotnost]]i [[stoliceStolice (vyprazdňování)|stolice]].<ref name="Stephen and Cummings">{{cite journal |doi=10.1099/00222615-13-1-45 |title=The Microbial Contribution to Human Faecal Mass |year=1980 |last1=Stephen |first1=A. M. |last2=Cummings |first2=J. H. |journal=Journal of Medical Microbiology |volume=13 |pages=45–56 |pmid=7359576 |issue=1}}</ref> Devadesát devět procent těchto bakterií však pochází z 30-4030–40 nejběžnějších druhů<ref name="Beaugerie">Beaugerie L and Petit JC. 2004. Microbial-gut interactions in health and disease. Antibiotic-associated diarrhoea. Best Practice & Research Clinical Gastroenterology, Volume 18, Issue 2, Pages 337-352. PMID 15123074. Accessed September 15, 2007</ref>. Mimo bakterie jsou častými mikroorganismy v střevech i různé [[houby]] a [[prvoci]], o nichž se však zatím ví jen málo.
