C-terminus: Porovnání verzí

Smazaný obsah Přidaný obsah
m napřímení odkazu
G3robot (diskuse | příspěvky)
m uvozovky kolem identifikátoru reference, kosmetické úpravy za použití AWB
Řádek 1:
[[Soubor:C-terminus.svg|thumb|Takto vypadá schematicky C-terminální část proteinu]]
[[Soubor:HMG-CoA Lyase 2cw6.png|thumb|Jeden příklad za všechny: [[HMG-CoA lyáza]] s vyznačeným C-terminem a N-terminem; C-terminus začíná kratším [[alfa helix]]em]]
'''C-terminus''' (někdy též '''C-konec''') je označení pro ten konec [[peptid]]u (případně [[polypeptid]]u, resp. [[Bílkovina|proteinu]]), který končí [[karboxylová skupina|–COOH]] (karboxylovou) skupinou, tzn. karboxylová skupina navázaná na [[alfa uhlík]]u už není [[peptidová vazba|peptidovou vazbou]] připojena na další aminokyselinu.<ref name="cammack" /> Opačný konec proteinu se označuje jako [[N-terminus]] a je ukončen [[aminoskupina|–NH<sub>2</sub>]] skupinou – díky tomu je polypeptid strukturně polarizovaný.<ref name="Alberts">{{citace monografie | příjmení = Alberts| jméno = Bruce , et al.| rok=2002|titul= The Molecular Biology of the Cell | edice=4th. ed|vydavatel = Garland Science | isbn=0-8153-3218-1 | url =}}</ref> COOH skupina je obvykle deprotonována na COO<sup>-</sup>, vzácněji je nekovalentně substituována nebo dochází ke vzniku [[amid]]u (účinkem speciálních enzymů v [[Golgiho aparát]]u).<ref name="cammack" />
 
== Translace ==
[[Translace]] (syntéza proteinů) postupuje od N-terminu k C-terminu. Na C-terminální konec prodlužujícího se polypeptidu se přidávají aminokyseliny tím, že se oddělí stará tRNA a naváže se nová tRNA „nabitá“ další aminokyselinou v řadě.<ref name="Alberts" />
 
== Membránové proteiny ==
[[Membránový protein|Membránové proteiny]] mohou mít C-terminus jak na cytosolickou (vnitřní), tak na extracelulární (vnější) stranu [[cytoplazmatická membrána|cytoplazmatické membrány]].<ref name="cammack">{{citace monografie| titul=Oxford dictionary of biochemistry and molecular biology; revised edition|vydavatel=Oxford university press|isbn=0-19-852917-1|rok=2006| místo=New York| editoři= R. Cammack et al}}</ref> Na C-terminálních koncích (nejen) membránových proteinů může docházet k řadě [[posttranslační modifikace|posttranslačních úprav]]. Z hlediska membránových bílkovin je významná zejména tzv. [[GPI kotva]], jež umožňuje [[kovalentní vazba|kovalentní]] připojení proteinu k membráně přes jeho C-terminální konec.<ref>{{citace monografie| titul= Cell Biology| jméno=Thomas D| příjmení=Pollard| jméno2= William C| příjmení2= Earnshaw| vydání=2|vydavatel=Saunders| rok=2007| isbn=1416022554| strany=928}}</ref>
 
== Detekce ==
V určitých případech je žádoucí určit počet C-konců nebo typ aminokyseliny nacházející se na C-konci. Typicky se k tomu používají [[karboxypeptidáza|karboxypeptidázy]], [[enzym]]y, které odbourávají protein od C-konce.<ref name="vodrazka">{{citace monografie| titul = Biochemie| příjmení=Vodrážka| jméno=Zdeněk| vydavatel=Academia| místo = Praha| rok=2007| isbn = 978-80-200-0600-4}}</ref>
 
== Reference ==