Palindrom (genetika): Porovnání verzí

Smazaný obsah Přidaný obsah
Addbot (diskuse | příspěvky)
m Bot: Odstranění 1 odkazů interwiki, které jsou nyní dostupné na Wikidatech (d:q4852694)
Faskal (diskuse | příspěvky)
přepsání pahýlu. na en.wiki to mají dost mizerně a tady je to nepřesné; jinak to odkazuje na invertované repetice a ne palindrom, ale to nechám tak
Řádek 1:
[[File:Plastid DNA scheme.svg|thumb|Plastidová DNA má typické oblasti IR]]
'''Palindrom''' je v genetice sekvence nukleové kyseliny ([[DNA]] nebo [[RNA]], která je stejná, pokud se čte od 5' konce k 3' konci jednoho vlákna a od 5' konce k 3' konci na komplementárním vlákně (viz [[direkcionalita]] a příklad v textu). Sekvence rozeznávaná [[restrikční endonukleáza|restrikčními endonukleázami]] jsou často palindromatické.
'''Palindrom''', nebo také '''inverted repeat''' (z [[angličtina|angl]]. ''inverted''–obrácený a ''repeat''-opakování), někdy zkráceně '''IR''', je sekvence [[nukleotid]]ů (v [[DNA]] či [[RNA]]), která je [[komplementarita|komplementární]] k jiné sekvenci, ale pořadí [[nukleová báze|bází]] je zrcadlově obrácené. Příkladem je řetězec:
 
::5'---GACTGC....GCAGTC---3' (písmena symbolizují jednotlivé báze DNA, čili [[adenin]], [[guanin]], [[cytosin]] a [[thymin]])
Příklad palindromatické sekvence:
Když mezi oběma sekvencemi IR nejsou jiné báze, označuje se takový řetězec jako „[[palindrom]]“ (čte se v obou směrech stejně). Inverted repeats je možné najít na koncích řetězce [[transpozon]]ů, v určité části [[plastidová DNA|plastidové DNA]], ale také v místech, kde může docházet k párování bází mezi řetězci.
5'- G A A T T C -3'
3'- C T T A A G -5'
 
'''Palindrom''',Jako nebopalindrom se někdy nepřesně označují také '''invertedinvertované repeatrepetice''' (inverted repeat, z [[angličtina|angl]]. ''inverted''–obrácený a ''repeat''-opakování), někdy zkráceně '''IR''', jetedy sekvence [[nukleotid]]ů (v [[DNA]] či [[RNA]]), která je [[komplementarita|komplementární]] k jiné sekvenci, ale pořadí [[nukleová báze|bází]] je zrcadlově obrácené. Příkladem je řetězec:
 
---CCTGCXXXXXXXGCAGG---
 
který může vytvářet [[vlásenka (DNA)|vlásenku]] následující podoby:
 
---C G---
C G
T A
G C
C G
X X
X X
X X
X
 
 
KdyžInvertované mezi oběma sekvencemi IR nejsou jiné báze, označuje se takový řetězec jako „[[palindrom]]“ (čte se v obou směrech stejně). Inverted repeatsrepetice je možné najít na koncích řetězce [[transpozon]]ů, v určité části [[plastidová DNA|plastidové DNA]], ale také v místech, kde může docházet k párování bází mezi řetězci.
 
{{překlad|en|Inverted repeat|273433823}}