Somatická hypermutace
Somatická hypermutace (SHM) je buněčný mechanismus, který zahrnuje mutace variabilních částí genů, jež kódují imunoglobulíny. SHM probíhá v germinálním centru s izotypovým přesmykem a jejím výsledkem je zvýšení afinity a funkce protilátky [1]. Rozmanitost protilátek se vytváří během dvou fází vývoje B-lymfocytů. V pre-B dochází k přeuspořádání V, D, J genových segmentů, čímž se vytvoří primární repertoár imunoglobulinových receptorů. U dospělých B-lymfocytů podstupují Ig receptory SHM a izotypový přesmyk [2].
Mechanismus editovat
SHM může být popsána pomocí biochemických drah, ve kterých jeden enzym generuje substrát pro enzym druhý. Tento sled dějů je iniciován enzymem AID (z angl. activation-induced deaminase). AID tvoří skupinu polynukleotidových deamináz, který je kódovaný genem Aicda [2]. B-buňky exprimují AID po rozeznání antigenu jejich antigenním receptorem (BCR) [3]. Aby mohl být tento enzym transportován do jádra, dochází k jeho fosforylaci nebo k interakci s dalšími proteiny. AID v jádře interaguje s ssDNA a v oblastech V a S a katalyzue přeměnu DC na DU. Uracil nepatří mezi báze, které se vyskytují v DNA a z důvodu udržení integrity genomu, tyto mutace jsou dále opraveny následujícími mechanismy.
- vzniklá mutace v DNA G-U podléhá replikaci a vzniká mutace C-T[4]
- pomocí UNG (z angl. Uracil-DNA glycosylase), který odstraňuje uracil, čímž se vytvoří abazické místo – to může být následně přeměněno pomocí AP-endonukleázy a následně opraveno nebo replikováno na libovolnou bázi[4]
Reference editovat
- ↑ METHOT, S.P.; DI NOIA, J.M. Molecular Mechanisms of Somatic Hypermutation and Class Switch Recombination. [s.l.]: Elsevier Dostupné online. ISBN 9780128124093. DOI 10.1016/bs.ai.2016.11.002. S. 37–87.
- ↑ a b MAUL, Robert W.; GEARHART, Patricia J. AID and Somatic Hypermutation. [s.l.]: Elsevier Dostupné online. ISBN 9780123813022. DOI 10.1016/s0065-2776(10)05006-6. S. 159–191.
- ↑ TENG, Grace; PAPAVASILIOU, F. Nina. Immunoglobulin Somatic Hypermutation. Annual Review of Genetics. 2007-12-01, roč. 41, čís. 1, s. 107–120. Dostupné online [cit. 2018-04-30]. ISSN 0066-4197. DOI 10.1146/annurev.genet.41.110306.130340. Archivováno 12. 9. 2019 na Wayback Machine.
- ↑ a b LI, Ziqiang; WOO, Caroline J.; IGLESIAS-USSEL, Maria D. The generation of antibody diversity through somatic hypermutation and class switch recombination. Genes & Development. 2004-01-01, roč. 18, čís. 1, s. 1–11. PMID: 14724175. Dostupné online [cit. 2018-04-30]. ISSN 0890-9369. DOI 10.1101/gad.1161904. PMID 14724175. (anglicky)